蛋白
水解复合物ClpXP是细菌稳态和发病机理的基础。由于其构象的灵活性,有效的ClpXP
抑制剂的开发具有挑战性,迫切需要新的工具来解密其复杂的调控。在这里,我们提出了基于
氨基酸的苯基酯作为分子探针,以研究
金黄色葡萄球菌的ClpXP复合物的活性和低聚。系统地筛选(R)和(S)
氨基酸导致化合物显示出有效的抑制作用,并刺激ClpXP介导的蛋白
水解作用。探针的亚
化学计量结合使ClpXP停滞在前所未有的七聚体-六聚体组装中,其中两个七聚体ClpP环彼此解离。同时,ClpX和ClpP之间的亲和力增加,导致两种酶的抑制作用。这种构象停滞对于ClpXP的合并关闭以及在其催化循环期间研究低聚状态是有益的。