3a(2)-Thymidylic acid, 2a(2)-deoxycytidylyl-(3a(2)a5a(2))- | 3922-65-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: 3a(2)-Thymidylic acid, 2a(2)-deoxycytidylyl-(3a(2)a5a(2))-
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] [(2R,3S,5R)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
• CAS: 3922-65-4
• 化学式: C₁₉H₂₇N₅O₁₄P₂
• 分子量: 611.396
• InChiKey: NEROCMOWVKEOLD-SWTKMSQOSA-N

物化性质

• 密度：
  2.04±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.77
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  276.98
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  15.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3’-O-tert-butyldimethylsilyl-2’-deoxy-5’-O-(2-isopropoxyprop-2-yl)thymidine 在 四氮唑 、 tetrakis{[4-({4-[3-(thymidin-3'-O-yl)-3-oxoprop-1-yl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}methyl)phenoxy]methyl}methane 、 四丁基氟化铵 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.5h， 生成 3a(2)-Thymidylic acid, 2a(2)-deoxycytidylyl-(3a(2)a5a(2))-
  参考文献：
  名称：

  液相寡核苷酸合成中的 5'-O-(2-异丙氧基丙-2-基) 保护的亚磷酰胺结构单元

  摘要：

  液相寡核苷酸合成需要改进的方法。我们已经测试了用于保护核苷酸构件的5'- O位点的缩醛修饰。在可溶性载体上通过亚磷酰胺化学合成短2'-脱氧寡核苷酸，获得了良好的产率。该标题基团的优点包括快速裂解、易于去除挥发性残留物以及尺寸小，提高了原子经济性。

  DOI：

  10.1002/ejoc.202300614

文献信息

• Synthesis of oligodeoxyribonucleotides containing a 3'-terminal phosphate group
  作者：V. P. Veiko、T. S. Oretskaya、E. M. Volkov、V. G. Metelev、E. A. Romanova、V. K. Potapov

  DOI：10.1007/bf00580075

  日期：——