8-(4,5,6,7-tetrabromo-1H-benzimidazole-1-yl)octanoic acid | 1407156-59-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 8-(4,5,6,7-tetrabromo-1H-benzimidazole-1-yl)octanoic acid
• 英文别名: 8-(4,5,6,7-tetrabromo-1H-benzimidazol-1-yl)octanoic acid；8-(4,5,6,7-tetrabromobenzimidazol-1-yl)octanoic acid
• CAS: 1407156-59-5
• 化学式: C₁₅H₁₆Br₄N₂O₂
• 分子量: 575.92
• InChiKey: OTAXRRBXSSWBKI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  55.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-Lys(Boc)-Wang resin 、 8-(4,5,6,7-tetrabromo-1H-benzimidazole-1-yl)octanoic acid 、 L-天门冬氨酸-4-叔丁基酯 、 D-天冬氨酸 4-叔丁酯 在 哌啶 、 N-甲基吗啉 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.33h， 生成 (2S)-6-amino-2-[[(2S)-3-carboxy-2-[[(2S)-3-carboxy-2-[[(2S)-3-carboxy-2-[[(2S)-3-carboxy-2-[[(2S)-3-carboxy-2-[[(2R)-3-carboxy-2-[8-(4,5,6,7-tetrabromobenzimidazol-1-yl)octanoylamino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Bisubstrate fluorescent probes for protein kinase CK2

  摘要：

  本发明涉及用于筛选和表征与蛋白激酶CK2结合的化合物、测量CK2催化活性形式的浓度以及成像细胞和组织中CK2活性的荧光探针。本发明的CK2选择性探针与CK2催化亚基的两个底物的结合位点相互作用，因此可用于表征所有结合到CK2活性位点的抑制剂在结合/置换试验中的作用。探针的高亲和力可在低浓度下检测酶，并表征广泛亲和力范围内的抑制剂。本发明还涉及将探针应用于细胞、组织和活体中CK2活性的映射和监测。

  公开号：

  US09176064B2
• 作为产物：
  描述：

  8-溴辛酸甲酯 在 水 、 sodium hydride 、 potassium hydroxide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 49.5h， 生成 8-(4,5,6,7-tetrabromo-1H-benzimidazole-1-yl)octanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Bisubstrate fluorescent probes for protein kinase CK2

  摘要：

  本发明涉及用于筛选和表征与蛋白激酶CK2结合的化合物、测量CK2催化活性形式的浓度以及成像细胞和组织中CK2活性的荧光探针。本发明的CK2选择性探针与CK2催化亚基的两个底物的结合位点相互作用，因此可用于表征所有结合到CK2活性位点的抑制剂在结合/置换试验中的作用。探针的高亲和力可在低浓度下检测酶，并表征广泛亲和力范围内的抑制剂。本发明还涉及将探针应用于细胞、组织和活体中CK2活性的映射和监测。

  公开号：

  US09176064B2

文献信息

• A subnanomolar fluorescent probe for protein kinase CK2 interaction studies
  作者：Erki Enkvist、Kaido Viht、Nils Bischoff、Jürgen Vahter、Siiri Saaver、Gerda Raidaru、Olaf-Georg Issinger、Karsten Niefind、Asko Uri

  DOI：10.1039/c2ob26022k

  日期：——

  conjugated with peptides containing multiple aspartate residues via different linkers. The design of the inhibitors was by crystallographic analysis of the complex of an inhibitor with the catalytic subunit of the enzyme (CK2α). The inhibitory potency of the synthesized compounds was established in a kinetic assay that used thin layer chromatography for the measurement of the rate of phosphorylation of fluorescently

  嗜酸蛋白激酶CK2的上调已在几种类型的癌症中建立。这种认识使CK2成为癌症化疗药物开发的重要靶标。可能的候选药物的表征，CK2的结构的确定和功能的澄清可以通过应用以高亲和力和选择性结合到酶的活性位点的小分子荧光探针来促进。我们已使用双底物方法开发了高效的CK2抑制剂。4,5,6,7-四溴1 ħ -苯并咪唑与含有多个天冬氨酸残基的肽缀合通过不同的链接器。抑制剂的设计是通过晶体学分析抑制剂与酶催化亚基（CK2α）的复合物。在动力学测定中建立了合成化合物的抑制能力，该动力学测定使用薄层色谱法来测量荧光标记的肽5-TAMRA-RADDSDDDDD的磷酸化速率。最有效的抑制剂ARC-1502（K i= 0.5 nM），揭示了在140种蛋白激酶中对CK2α的高选择性。用PromoFluor-647标记ARC-1502，得到的荧光探针ARC-1504对CK2α和全酶都具有亚纳摩尔亲和力。该探针用于基于荧
• BISUBSTRATE FLUORESCENT PROBES FOR PROTEIN KINASE CK2
  申请人：University of Tartu

  公开号：US20140057291A1

  公开（公告）日：2014-02-27

  This invention relates to fluorescent probes for screening and characterization of compounds binding to protein kinase CK2, measurement of concentration of the catalytically active form of CK2 and imaging of CK2 activity in cells and tissues. The CK2-selective probe of the present invention interacts with binding sites of both substrates of the catalytic subunit of CK2 and therefore can be used for characterization of all inhibitors binding to the active site of CK2 in the binding/displacement assay. The high affinity of the probe affords the detection of the enzyme at low concentration and characterization of inhibitors in a wide affinity range. The invention also relates to the application of the probes for mapping and monitoring of CK2 activity in cells, tissues and live organisms.

  本发明涉及用于筛选和表征结合到蛋白激酶CK2的化合物、测量CK2催化活性形式的浓度以及在细胞和组织中成像CK2活性的荧光探针。本发明的CK2选择性探针与CK2催化亚基的两个底物的结合位点相互作用，因此可用于特征化所有结合到CK2活性位点的抑制剂在结合/置换试验中的作用。探针的高亲和力可在低浓度下检测酶并特征化广泛亲和力范围内的抑制剂。本发明还涉及将探针应用于细胞、组织和活体中CK2活性的映射和监测。
• US9176064B2
  申请人：——

  公开号：US9176064B2

  公开（公告）日：2015-11-03
• Bisubstrate fluorescent probes for protein kinase CK2
  申请人：University of Tartu

  公开号：US09176064B2

  公开（公告）日：2015-11-03

  This invention relates to fluorescent probes for screening and characterization of compounds binding to protein kinase CK2, measurement of concentration of the catalytically active form of CK2 and imaging of CK2 activity in cells and tissues. The CK2-selective probe of the present invention interacts with binding sites of both substrates of the catalytic subunit of CK2 and therefore can be used for characterization of all inhibitors binding to the active site of CK2 in the binding/displacement assay. The high affinity of the probe affords the detection of the enzyme at low concentration and characterization of inhibitors in a wide affinity range. The invention also relates to the application of the probes for mapping and monitoring of CK2 activity in cells, tissues and live organisms.

  本发明涉及用于筛选和表征与蛋白激酶CK2结合的化合物、测量CK2催化活性形式的浓度以及成像细胞和组织中CK2活性的荧光探针。本发明的CK2选择性探针与CK2催化亚基的两个底物的结合位点相互作用，因此可用于表征所有结合到CK2活性位点的抑制剂在结合/置换试验中的作用。探针的高亲和力可在低浓度下检测酶，并表征广泛亲和力范围内的抑制剂。本发明还涉及将探针应用于细胞、组织和活体中CK2活性的映射和监测。