Discovery of a potent, selective and cell active inhibitor of m6A demethylase ALKBH5
作者:Zhen Fang、Bo Mu、Yang Liu、Nihong Guo、Liang Xiong、Yinping Guo、Anjie Xia、Rong Zhang、Hailin Zhang、Rui Yao、Yan Fan、Linli Li、Shengyong Yang、Rong Xiang
DOI:10.1016/j.ejmech.2022.114446
日期:2022.8
selectivity for ALKBH5. Cellular thermal shift assay (CETSA) analysis showed that 20m could efficiently stabilize ALKBH5 in HepG2 cells. Dot blot assay demonstrated that 20m could increase m6A level in intact cells. Collectively, 20m is a potent, selective and cell active ALKBH5 inhibitor and could be used as a versatile chemical probe to explore the biological function of ALKBH5.
AlkB 同系物 5 (ALKBH5) 是一种 RNA m 6 A 去甲基化酶,参与基因转录、翻译和代谢的调控,被认为是多种人类疾病,尤其是癌症的有前途的治疗靶点。然而,仍然缺乏强效和选择性的 ALKBH5 抑制剂。在此,我们报告了一类包含 1-aryl-1 H -吡唑支架的新型 ALKBH5 抑制剂,它们是通过基于荧光偏振的筛选、结构优化和构效关系分析获得的。在这些化合物中,20m是最有效的化合物,其在荧光偏振测定中显示出0.021μM的IC 50值。大院20m对 ALKBH5 与 FTO 以及其他 AlkB 亚家族成员表现出高选择性,表明对 ALKBH5 具有良好的选择性。细胞热转移试验 (CETSA) 分析表明,20m可有效稳定 HepG2 细胞中的 ALKBH5。斑点印迹实验表明,20m可以增加完整细胞中的m 6 A 水平。总的来说,20m是一种有效的、选择性的和具有细胞活性的 ALKBH5