3'-O-methyl-2'-deoxycytidine | 76551-25-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-O-methyl-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 4-amino-1-[(2R,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)-4-methoxyoxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 76551-25-2
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₄
• 分子量: 241.247
• InChiKey: AHMIQNIHGPSTCJ-LKEWCRSYSA-N

物化性质

• 沸点：
  431.3±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.55±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.4
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  97.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-methyl-2'-deoxycytidine 在 sodium hydrogensulfite 作用下， 反应 48.0h， 以80%的产率得到2'-deoxy-3'-O-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  人脱氧胞苷激酶（dCK）和胸苷激酶（TK1和TK2）对核苷（包括O'-烷基类似物）糖部分的底物/抑制剂特性。

  摘要：

  已经检查了具有修饰的糖部分的核苷类似物对人类白血病脾脏的高度纯化的脱氧胞苷激酶（dCK）和胸苷激酶（TK1和TK2的四聚体高亲和力形式）的底物/抑制剂特异性。特别地，类似物包括dC，dU和dA的单-和二-O'-甲基衍生物，描述了它们的合成。通常，具有修饰的糖环的嘌呤核苷比相应的胞嘧啶类似物更弱。糖修饰的dU类似物也是TK1和TK2的底物相对较弱，但还是相当好的抑制剂，与TK2相比，Ki值通常低于TK1。TK1和TK2之间的出色区分是3'-己酰氨基-2'，3'-二脱氧胸苷，TK1的Ki约为600 microM，Ki约为0。TK2为1 microM。3'-OMe-dC是dCK优于其5'-O-甲基同类物的抑制剂，与作为质子受体的（3'）-OH或（3'）-OMe的氧可能参与氢键结合与酶。令人惊讶的是，alpha-dT是TK1和TK2的良好底物，TK1和TK2的Ki值分别为120和30 microM

  DOI：

  10.1080/07328319908044850
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-三苯甲基-2'-脱氧尿苷 在 吡啶 、 氢氧化钾 、 tetraphosphorus decasulfide 、 氨 、 溶剂黄146 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 苯 为溶剂， 反应 39.0h， 生成 3'-O-methyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  物种或同工酶特异性酶抑制剂。5.胸苷取代基对大鼠胸苷激酶同工酶的亲和力的差异作用。

  摘要：

  通过对胸苷（TdR）的八个位置上的基团进行单次替换或置换获得的衍生物已作为大鼠线粒体（M-TK）和胸苷激酶胞质（C-TK）同工酶的抑制剂进行了研究。通过等电聚焦将大鼠脾脏的C-TK（pI = 7.5）和M-TK（pI = 5.1）纯化为明显的同功同质性。通过将TdR的米氏常数除以抑制常数，可得出相对于TdR同工酶的TdR位点的亲和力。在八种TdR衍生物中，五种对M-TK位点具有更高的亲和力，另外两种对C-TK位点具有更高的亲和力。最有效和/或选择性的抑制剂是3'-O-苄基-TdR（相对于TdR，相对于M-TK的亲和力为100％；相对于C-TK相对于M-TK的亲和力为7.5），5-氨基-2 '-脱氧尿苷（对M-TK的相对亲和力，11％; 对M-TK的差分亲和力为26），5'-氨基-5'-脱氧TdR（对C-TK的相对亲和力为67％;对C-TK的差分亲和力大于25）。修饰某些取代基的效果表明，这

  DOI：

  10.1021/jm00348a007

文献信息

• 3'-Substituted methyl nucleosides as antiviral agents
  申请人：Bristol-Myers Squibb Company

  公开号：EP0391411A2

  公开（公告）日：1990-10-10

  Certain 3′-substituted methyl nucleosides are disclosed which are useful in the treatment of viral infections, e.g., infections caused by herpes simplex virus types 1 and 2, and/or are useful as intermediates in the preparation of 3′-substituted methyl nucleosides having antiviral activity. In accordance with one aspect of the invention, there are provided novel 3′-substituted methyl nucleosides represented by Formulas I and II wherein: B indicates that B can be either alpha or beta; B is a member selected from the group consisting of the pyrimidine and purine nucleoside bases connected to the tetrahydrofuran ring through the N¹ heterocyclic nitrogen atom of the pyrimidines and the N⁹ or N⁷ heterocyclic nitrogen atom of the purines including the naturally occurring nucleoside bases and 5-fluoro, 5-bromo, 5-iodo, 5-chloro, 5-trifluoromethyl, 5-ethyl, 5-(2-bromovinyl)­uracil; triazolecarboxamide; 2-aminopurine; 2,6-diaminopurine; 4-chloropyrimidine; pyrimidine; azapyrimidine; purine; 2,6-dichloropurine; 2-amino-6-­chloropurine; and deazapurine; R and Q are either both hydrogen or halogen, especially fluorine, or one is hydrogen and the other one is hydroxy or halogen, especially fluorine; in Formula I at least one of R and Q is halogen; and X and Y can be the same or different and are selected from the group consisting of O-alkyl, O-aryl, O-acyl-, halogen, especially fluorine, azido, amino, acylamido, -SH, S-alkyl and S-aryl, or one of X or Y can be hydroxy, or X may be the group R¹O and Y may be the group R²O wherein R¹ and R² are hydrogen or hydroxy-protecting groups. Preferred O-alkyl and S-alkyl groups contain from one to four carbon atoms; preferred O-aryl and S-aryl groups contain from 6 to 10 carbon atoms; and preferred O-acyl groups contain from one to four carbon atoms.

  本发明公开了某些3′-取代的甲基核苷，它们可用于治疗病毒感染，例如由单纯疱疹病毒1型和2型引起的感染，和/或可用作制备具有抗病毒活性的3′-取代的甲基核苷的中间体。根据本发明的一个方面，提供了由式 I 和 II 表示的新型 3′-取代的甲基核苷 其中 B表示B可以是α或β； B 是选自以下组成的组的成员：通过嘧啶的 N¹ 杂环氮原子和嘌呤的 N⁹ 或 N⁷ 杂环氮原子与四氢呋喃环连接的嘧啶和嘌呤核苷碱基，包括天然存在的核苷碱基和 5-氟、5-溴、5-碘、5-氯、5-三氟甲基、5-乙基、5-(2-溴乙烯基)尿嘧啶；三唑甲酰胺； 2-氨基嘌呤； 2,6-二氨基嘌呤；4-氯嘧啶；嘧啶；氮杂嘧啶；嘌呤；2,6-二氯嘌呤；2-氨基-6-氯嘌呤；以及去氮嘌呤； R 和 Q 要么都是氢或卤素，特别是氟，要么一个是氢，另一个是羟基或卤素，特别是氟；在式 I 中，R 和 Q 中至少有一个是卤素；以及 X 和 Y 可以相同或不同，选自由 O-烷基、O-芳基、O-酰基、卤素（尤其是氟）、叠氮、氨基、酰氨基、-SH、S-烷基和 S-芳基组成的组，或者 X 或 Y 中的一个可以是羟基，或者 X 可以是基团 R¹O，Y 可以是基团 R²O，其中 R¹ 和 R² 是氢或羟基保护基团。 优选的 O-烷基和 S-烷基含有 1 至 4 个碳原子；优选的 O-芳基和 S-芳基含有 6 至 10 个碳原子；优选的 O-酰基含有 1 至 4 个碳原子。
• Substrate/Inhibitor Properties of Human Deoxycytidine Kinase (dCK) and Thymidine Kinases (Tk1 And Tk2) Towards the Sugar Moiety of Nucleosides, Including O′-Alkyl Analogues
  作者：Borys Kierdaszuk、Krzysztof Krawiec、Zygmunt Kazimierczuk、Ulla Jacobsson、Nils G. Johansson、Birgitte Munch-petersen、Staffan Eriksson、David Shugar

  DOI：10.1080/07328319908044850

  日期：1999.8

  deoxycytidine kinase (dCK) and thymidine kinases (tetrameric high-affinity form of TK1, and TK2) from human leukemic spleen. In particular, the analogues included the mono- and di-O'-methyl derivatives of dC, dU and dA, syntheses of which are described. In general, purine nucleosides with modified sugar rings were feebler substrates than the corresponding cytosine analogues. Sugar-modified analogues of dU were

  已经检查了具有修饰的糖部分的核苷类似物对人类白血病脾脏的高度纯化的脱氧胞苷激酶（dCK）和胸苷激酶（TK1和TK2的四聚体高亲和力形式）的底物/抑制剂特异性。特别地，类似物包括dC，dU和dA的单-和二-O'-甲基衍生物，描述了它们的合成。通常，具有修饰的糖环的嘌呤核苷比相应的胞嘧啶类似物更弱。糖修饰的dU类似物也是TK1和TK2的底物相对较弱，但还是相当好的抑制剂，与TK2相比，Ki值通常低于TK1。TK1和TK2之间的出色区分是3'-己酰氨基-2'，3'-二脱氧胸苷，TK1的Ki约为600 microM，Ki约为0。TK2为1 microM。3'-OMe-dC是dCK优于其5'-O-甲基同类物的抑制剂，与作为质子受体的（3'）-OH或（3'）-OMe的氧可能参与氢键结合与酶。令人惊讶的是，alpha-dT是TK1和TK2的良好底物，TK1和TK2的Ki值分别为120和30 microM
• Species- or isozyme-specific enzyme inhibitors. 5. Differential effects of thymidine substituents on affinity for rat thymidine kinase isozymes
  作者：Alexander Hampton、Ram R. Chawla、Francis Kappler

  DOI：10.1021/jm00348a007

  日期：1982.6

  eight positions of thymidine (TdR) have been examined as inhibitors of rat mitochondrial (M-TK) and cytoplasmic (C-TK) isozymes of thymidine kinase. A C-TK (pI = 7.5) and an M-TK (pI = 5.1) from rat spleen were purified to apparent isozymic homogeneity by isoelectric focusing. Affinities relative to that of TdR for the TdR sites of the isozymes were derived by dividing the Michaelis constants of TdR

  通过对胸苷（TdR）的八个位置上的基团进行单次替换或置换获得的衍生物已作为大鼠线粒体（M-TK）和胸苷激酶胞质（C-TK）同工酶的抑制剂进行了研究。通过等电聚焦将大鼠脾脏的C-TK（pI = 7.5）和M-TK（pI = 5.1）纯化为明显的同功同质性。通过将TdR的米氏常数除以抑制常数，可得出相对于TdR同工酶的TdR位点的亲和力。在八种TdR衍生物中，五种对M-TK位点具有更高的亲和力，另外两种对C-TK位点具有更高的亲和力。最有效和/或选择性的抑制剂是3'-O-苄基-TdR（相对于TdR，相对于M-TK的亲和力为100％；相对于C-TK相对于M-TK的亲和力为7.5），5-氨基-2 '-脱氧尿苷（对M-TK的相对亲和力，11％; 对M-TK的差分亲和力为26），5'-氨基-5'-脱氧TdR（对C-TK的相对亲和力为67％;对C-TK的差分亲和力大于25）。修饰某些取代基的效果表明，这