5'-O-三苯甲基-2'-脱氧尿苷 | 14270-73-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: 5'-O-三苯甲基-2'-脱氧尿苷
• 英文名称: O^5'-trityl-2'-deoxy-uridine
• 英文别名: 5'-O-(triphenylmethyl)-2'-deoxyuridine；2'-deoxy-5'-O-triphenylmethyluridine；5'-O-trityl-2'-deoxyuridine；1-(4-hydroxy-5-trityloxymethyltetrahydrofuran-2-yl)-1H-pyrimidine-2,4-dione；5'-0-Trityl-2'-deoxyuridine；5'-O-Trityl-2'Deoxyuridine；1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(trityloxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 14270-73-6
• 化学式: C₂₈H₂₆N₂O₅
• 分子量: 470.525
• InChiKey: JJJNFNLUKYZAKI-BFLUCZKCSA-N

物化性质

• 熔点：
  204-205 °C
• 密度：
  1.300±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

安全信息

• 海关编码：
  2934999090
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-三苯甲基-2'-脱氧尿苷 在 四氯化碳 、 叠氮化锂 、 溶剂黄146 、 三苯基膦 作用下， 以 六甲基磷酰三胺 、 N,N-二甲基乙酰胺 为溶剂， 反应 36.33h， 生成 Navuridine
  参考文献：
  名称：

  一些嘧啶的3'-氨基-2'，3'-二脱氧核糖核苷：合成和生物活性。

  摘要：

  胸腺嘧啶，尿嘧啶和5-碘尿嘧啶的3'-氨基-2'，3'-二脱氧核糖核苷（1-3）是通过相应的2'-脱氧核糖核苷通过threo-3'-chloro和erythro-3'-合成的叠氮基衍生物。以3'-氨基-2'，3'-二脱氧胸苷为氨基戊糖基供体，以胸苷磷酸化酶（EC 2.4.2.4）为酶促合成了5-溴尿嘧啶，5-氯尿嘧啶和5-氟尿嘧啶（4-6）的相应氨基核苷催化剂。通过氨基化3′-氨基-2′，3′-二脱氧尿苷的3′-叠氮基前体合成3′-氨基-2′，3′-二脱氧胞苷（7）。在这组氨基核苷中，3'-氨基-2'，3'-二脱氧-5-氟尿苷的生物活性显着（6）。它对腺病毒的ED50为10 microM，对培养的哺乳动物细胞没有明显的细胞毒性。它也对某些革兰氏阳性细菌有活性，但对多种革兰氏阴性细菌没有活性。其他氨基核苷（1-5和7）缺乏或表现出弱的抗病毒和抗菌活性。该组中唯一对培养的哺乳动物细胞有明显毒性

  DOI：

  10.1021/jm00360a019
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 生成 5'-O-三苯甲基-2'-脱氧尿苷
  参考文献：
  名称：

  ZAJTSEVA, G. V.;KVASYUK, E. I.;PUPEJKO, P. E.;KULAK, T. I.;PASHINNIK, V. +, BIOORGAN. XIMIYA, 14,(1988) N 9, S. 1275-1281

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Deoxyuridine Triphosphate Nucleotidohydrolase as a Potential Antiparasitic Drug Target
  作者：Corinne Nguyen、Ganasan Kasinathan、Isabel Leal-Cortijo、Alexander Musso-Buendia、Marcel Kaiser、Reto Brun、Luis M. Ruiz-Pérez、Nils G. Johansson、Dolores González-Pacanowska、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1021/jm050111e

  日期：2005.9.1

  small-molecule inhibitors of the enzyme deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) from parasitic protozoa. The successful synthesis of a variety of analogues of dUMP is described in which the substituents are introduced at the 3'- and 5'-positions, together with variation in the heteroatom at the 5'-position. The compounds were assayed against recombinant Plasmodium falciparum and Leishmania

  本文介绍了一项结构活性研究，旨在从寄生虫原生动物中鉴定出新型的小分子脱氧尿苷酶5'-三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）抑制剂。描述了dUMP的各种类似物的成功合成，其中在3'-和5'-位引入取代基，以及在5'-位杂原子的变化。对化合物进行了针对重组恶性疟原虫和利什曼原虫主要酶和人类酶的测定，以提供选择性的量度。还针对体外完整的寄生虫恶性疟原虫和多杀利什曼原虫对化合物进行了体外测试。已鉴定出许多恶性疟原虫dUTPase的有效和选择性抑制剂，这些抑制剂表现出类似药物的特性并代表了未来发展的良好线索。最好的抑制剂包括化合物5'-三苯甲基氨基-2'，5'-二脱氧尿苷（2j）（Ki = 0.2 microM）和5'-O-三苯基甲硅烷基-2'，3'-二氢氢化-2'，3'-二脱氧尿苷（5h）（Ki = 1.3 microM），与人类酶相比，选择性大于200倍。确定了对抗疟原虫活性重要的结构特征。在体外
• Modified 5′-Trityl Nucleosides as Inhibitors of<i>Plasmodium falciparum</i>dUTPase
  作者：Gian Filippo Ruda、Corinne Nguyen、Przemysław Ziemkowski、Krzysztof Felczak、Ganasan Kasinathan、Alexander Musso-Buendia、Christian Sund、Xiao Xiong Zhou、Marcel Kaiser、Luis M. Ruiz-Pérez、Reto Brun、Tadeusz Kulikowski、Nils Gunnar Johansson、Dolores González-Pacanowska、Ian H. Gilbert

  DOI：10.1002/cmdc.201000445

  日期：2011.2.7

  2′‐Deoxyuridine triphosphate nucleotidohydrolase (dUTPase) is a potential drug target for the treatment of malaria. We previously reported the discovery of 5′‐tritylated analogues of deoxyuridine as selective inhibitors of this Plasmodium falciparum enzyme. Herein we report further structure–activity studies; in particular, variations of the 5′‐trityl group, the introduction of various substituents

  2'-脱氧尿苷三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）是治疗疟疾的潜在药物靶标。我们之前曾报道过发现脱氧尿苷的5'-三苯甲基化类似物可作为恶性疟原虫的选择性抑制剂酶。在这里，我们报告了进一步的结构活动研究；特别是5'-三苯甲基的变体，在脱氧尿苷的3'-位置引入了各种取代基以及修饰了碱基。测试了针对酶和寄生虫的化合物。5'-三苯甲基和3'-取代基的变异具有良好的耐受性，并产生了活性化合物。然而，由于尿嘧啶环的修饰导致酶抑制作用的丧失和抗血浆作用的显着降低，因此对尿嘧啶碱基的活性有明确的要求。
• Antiviral Activity of Various 1-(2′-Deoxy-β-<scp>d</scp>-lyxofuranosyl), 1-(2′-Fluoro-β-<scp>d</scp>-xylofuranosyl), 1-(3′-Fluoro-β-<scp>d</scp>-arabinofuranosyl), and 2′-Fluoro-2′,3′-didehydro-2′,3′-dideoxyribose Pyrimidine Nucleoside Analogues against Duck Hepatitis B Virus (DHBV) and Human Hepatitis B Virus (HBV) Replication
  作者：Naveen C. Srivastav、Neeraj Shakya、Michelle Mak、Babita Agrawal、D. Lorne Tyrrell、Rakesh Kumar

  DOI：10.1021/jm100803c

  日期：2010.10.14

  3′-fluoroarabinofuranosyl, and 2′-fluoro-2′,3′-didehydro-2′,3′-dideoxyribose pyrimidine nucleoside analogues for antiviral activities against hepatitis B virus. Among the compounds examined, 1-(2-deoxy-β-d-lyxofuranosyl)thymine (23), 1-(2-deoxy-β-d-lyxofuranosyl)-5-trifluoromethyluracil (25), 1-(2-deoxy-2-fluoro-β-d-xylofuranosyl)uracil (38), 1-(2-deoxy-2-fluoro-β-d-xylofuranosyl)thymine (39), 2′,3′-dideoxy-2′,3′-d

  尽管存在成功的疫苗和抗病毒疗法，但乙型肝炎病毒（HBV）的感染仍然是急性和慢性肝病以及高死亡率的全球主要原因。我们合成并评估了几种lyxofuranosyl，2'-fluorooxylofuranosyl，3'-fluoroarabinofuranosyl和2'-fluoro-2'，3'-didehydro-2'，3'-dideoxyribose嘧啶核苷类似物对乙型肝炎病毒的抗病毒活性。在所检查的化合物中，1-（2-脱氧-β - d-呋喃呋喃糖基）胸腺嘧啶（23），1-（2-脱氧-β - d-呋喃呋喃糖基）-5-三氟甲基尿嘧啶（25），1-（2-脱氧-2-氟-β - d-木呋喃糖基）尿嘧啶（38），1-（2-脱氧-2-氟-β- d-二呋喃呋喃糖基）胸腺嘧啶（39），2'，3'-二脱氧-2'，3'-二脱氢-2'-氟胸苷（48）和2'，3'-二脱氧-2'，3'-二脱氢-2在原代鸭肝细胞中发现'
• Protecting Groups Transfer: Unusual Method of Removal of Tr and Tbdms Groups by Transetherification
  作者：Nadia L. D. Cabral、Luciano J. Hoeltgebaum Thiessen、Bogdan Doboszewski

  DOI：10.1080/15257770802257846

  日期：2008.8.11

  The triphenylmethyl (Tr) group undergoes a transfer (transetherification or disproportionation) between the molecules of 5′-O-Tr-2′-deoxynucleosides in a process mediated by anhydrous sulfates of Cu+2, Fe+2, or Ni+2 to yield mixtures of 3′,5′-bis-O-Tr and 3′-O-Tr products. If phenylmethanol is present in a reaction medium, detritylation results with concomitant formation of phenylmethyl triphenylmethyl

  在由Cu + 2，Fe + 2或Ni + 2的无水硫酸盐介导的过程中，三苯甲基（Tr）基团在5'-O-Tr-2'-脱氧核苷分子之间进行转移（转移醚化或歧化）得到3′，5′-双-O-Tr和3′-O-Tr产物的混合物。如果反应介质中存在苯甲醇，则会导致脱三苯甲基化并同时形成苯甲基三苯甲基醚。5'-O-TBDMS-2'-脱氧核苷中叔丁基二甲基甲硅烷基（TBDMS）的行为完全相同。以前没有在O-Tr和O-TBDMS组中观察到这种类型的转醚化作用。
• Methods of manufacture of 2'-deoxy-beta-L-nucleosides
  申请人：——

  公开号：US20040266996A1

  公开（公告）日：2004-12-30

  The present invention relates to the synthesis of 2′-deoxy-&bgr;-L-thymidine, 2′-deoxy-&bgr;-L-uridine and 2′-deoxy-&bgr;-L-cytidine, and their derivatives, such as the 3′-O-acyl or 3′,5′-O-diacyl prodrugs, including the 3′-O-L-aminoacyl and 3′,5′-O-L-diaminoacyl prodrugs, and particularly the 3′-O-L-valinyl and 3′,5′-O-L-divalinyl prodrugs.

  本发明涉及2'-脱氧-β-L-胸苷、2'-脱氧-β-L-尿苷和2'-脱氧-β-L-胞苷的合成，以及它们的衍生物，如3'-O-酰基或3',5'-O-二酰基前药，包括3'-O-L-氨基酰和3',5'-O-L-二氨基酰前药，特别是3'-O-L-缬氨酰和3',5'-O-L-二缬氨酰前药。