3'-Trifluoroacetylamino-3'-deoxythymidine | 132149-28-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-Trifluoroacetylamino-3'-deoxythymidine
• 英文别名: Thymidine, 3'-deoxy-3'-((trifluoroacetyl)amino)-；2,2,2-trifluoro-N-[(2S,3S,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]acetamide
• CAS: 132149-28-1
• 化学式: C₁₂H₁₄F₃N₃O₅
• 分子量: 337.255
• InChiKey: NOFSEFRXBUPPDX-XLPZGREQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-Trifluoroacetylamino-3'-deoxythymidine 在 ammonium hydroxide 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 5-(乙硫基)-1H-四唑 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 8.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  共价抑制剂对 DNA 聚合酶 β 的选择性抑制

  摘要：

  DNA 聚合酶 β (Pol β) 在 DNA 修复中起着至关重要的作用，并且与癌症密切相关。缺乏这种酶的选择性抑制剂。受使 Pol β 失活的抗肿瘤剂产生的 DNA 损伤的启发，我们着手开发这种酶的共价小分子抑制剂。使用涉及化学合成文库的两阶段过程，我们确定了Pol β的有效不可逆抑制剂 ( 14 ) ( K I = 1.8 ± 0.45 μM, k inact = (7.0 ± 1.0) × 10 –3 s –1 )。抑制剂14比其他 DNA 聚合酶选择性地灭活 Pol β。用14处理的 Pol β 胰蛋白酶消化物的 LC-MS/MS 分析鉴定了聚合酶结合位点内共价修饰的两个赖氨酸，其中一个先前被确定在DNA结合中起作用。荧光各向异性实验表明，用14预处理 Pol β可防止 DNA 结合。在野生型小鼠胚胎成纤维细胞 (MEF) 中使用前抑制剂 ( pro - 14 ) 的实验表明，抑制剂

  DOI：

  10.1021/jacs.1c02453
• 作为产物：
  描述：

  齐多夫定 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 3'-Trifluoroacetylamino-3'-deoxythymidine
  参考文献：
  名称：

  共价抑制剂对 DNA 聚合酶 β 的选择性抑制

  摘要：

  DNA 聚合酶 β (Pol β) 在 DNA 修复中起着至关重要的作用，并且与癌症密切相关。缺乏这种酶的选择性抑制剂。受使 Pol β 失活的抗肿瘤剂产生的 DNA 损伤的启发，我们着手开发这种酶的共价小分子抑制剂。使用涉及化学合成文库的两阶段过程，我们确定了Pol β的有效不可逆抑制剂 ( 14 ) ( K I = 1.8 ± 0.45 μM, k inact = (7.0 ± 1.0) × 10 –3 s –1 )。抑制剂14比其他 DNA 聚合酶选择性地灭活 Pol β。用14处理的 Pol β 胰蛋白酶消化物的 LC-MS/MS 分析鉴定了聚合酶结合位点内共价修饰的两个赖氨酸，其中一个先前被确定在DNA结合中起作用。荧光各向异性实验表明，用14预处理 Pol β可防止 DNA 结合。在野生型小鼠胚胎成纤维细胞 (MEF) 中使用前抑制剂 ( pro - 14 ) 的实验表明，抑制剂

  DOI：

  10.1021/jacs.1c02453

文献信息

• Synthesis ofN-Substituted 3′-Amino-3′-deoxythymidines and their Biological Evaluation against HIV
  作者：Mohammed S. Motawia、Erik B. Pedersen、Carsten M. Nielsen

  DOI：10.1002/ardp.19903231207

  日期：——

  with a variety of isothiocyanates led to the corresponding thioureido derivatives 3a–i. Also, conversion of 1 into 3′‐carbylamino‐3′‐deoxythymidine (7) is reported. The compounds 2, 3, and 8 were evaluated for their anti‐HIV activity in MT‐4 cells, but did not show sufficient efficacy.

  用羧酸酐处理 3'-氨基-3'-脱氧胸苷 (1) 得到相应的酰氨基衍生物 2a-f。1 与各种异硫氰酸酯反应生成相应的硫脲基衍生物 3a – i。此外，还报道了 1 转化为 3'-carbylamino-3'-deoxythymidine (7)。评估了化合物 2、3 和 8 在 MT-4 细胞中的抗 HIV 活性，但没有显示出足够的功效。
• MOTAWIA, MOHAMMED S.;PEDERSEN, ERIK B.;NIELSEN, CARSTEN M., ARCH. PHARM., 323,(1990) N2, C. 971-975
  作者：MOTAWIA, MOHAMMED S.、PEDERSEN, ERIK B.、NIELSEN, CARSTEN M.

  DOI：——

  日期：——
• OLIGONUCLEOTIDE ANALOGS
  申请人：THE DU PONT MERCK PHARMACEUTICAL COMPANY

  公开号：EP0517796B1

  公开（公告）日：1995-04-19
• US5470967A
  申请人：——

  公开号：US5470967A

  公开（公告）日：1995-11-28
• [EN] OLIGONUCLEOTIDE ANALOGS
  申请人：E.I. DU PONT DE NEMOURS AND COMPANY

  公开号：WO1991015500A1

  公开（公告）日：1991-10-17

  (EN) This invention relates to novel oligonucleotide analogs in which one or more of the internucleotide phosphodiester linkages have been replaced by a sulfur based linkage focusing on therapeutic potential.(FR) Nouveaux analogues d'oligonucléotides dans lesquels une ou plusieurs des liaisons phosphodiesters internucléotides ont été remplacées par une liaison à base de soufre soulignant le potentiel thérapeutique.