Activating Effect of 3‐Benzylidene Oxindoles on AMPK: From Computer Simulation to High‐Content Screening
作者:Daria S. Novikova、Tatyana A. Grigoreva、Gleb S. Ivanov、Gerry Melino、Nickolai A. Barlev、Vyacheslav G. Tribulovich
DOI:10.1002/cmdc.202000579
日期:2020.12.15
we studied the binding of 3‐benzylidene oxindoles to the kinase domain of the AMPK α‐subunit, which is thought to prevent its interaction with the autoinhibitory domain and thus result in the AMPK activation. For this purpose, we developed the cellular test system based on the AMPKAR plasmid, which implements the FRET effect, synthesized a number of 3‐benzylidene oxindole compounds and simulated their
AMP 活化蛋白激酶 (AMPK) 目前是深入研究和积极讨论的主题。AMPK 在细胞水平上发挥其功能,提供能量消耗和能量产生过程之间的转换,以及在整个身体水平上,特别是调节高级神经活动和行为的某些方面。控制这种“主开关”可补偿功能障碍和相关疾病。在本文中,我们研究了 3-亚苄基羟吲哚与 AMPK α-亚基激酶结构域的结合,这被认为可以阻止其与自身抑制结构域的相互作用,从而导致 AMPK 激活。为此,我们开发了基于 AMPKAR 质粒的细胞测试系统,它实现了 FRET 效应,合成了许多 3-亚苄基羟吲哚化合物并模拟它们与激酶结构域的各个位点的结合。所研究化合物的最可能结合位点是通过计算和实验数据的相关性确定的。获得的结果允许使用虚拟和高内涵筛选分析各类 AMPK 激活剂。