| 1345134-33-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• CAS: 1345134-33-9
• 化学式: C₃₈H₆₈N₄O₁₀Si₃
• 分子量: 825.235
• InChiKey: HPPSDAYCXDUKEN-VQKSECAYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.35
• 重原子数：
  55.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  165.1
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  beta-胸苷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 2,6-二叔丁基-4-甲基吡啶 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.92h， 生成
  参考文献：
  名称：

  A TT Dinucleotide with a Nonionic Silyl Backbone: Impact on Conformation and H-Bond Mediated Base Pairing as Studied by Low-Temperature NMR

  摘要：

  一个通过非离子二异丙基硅骨架连接的T_SiT二核苷酸已经合成并研究了其通过碱基识别的自组装，同时还有一个游离的胸腺嘧啶核苷酸。为了更详细地表征氢键结合物，NMR测量在低至113K的温度下在缓慢的氢键交换区域中在一种氟烃溶剂中进行。对于胸腺嘧啶来说，观察到了TT碱基对，其中2-和4-羰基与亚胺质子形成了氢键。尽管与O4受体的氢键更强，这一点表明通过氢桥与O2受体的氢键相比，后者在TT碱基对的氢键形成中略微优于O4。T_SiT二核苷酸的二异丙基硅基连接对形成的NH-O2和NH-O4氢键的几何形状和强度没有显著影响，表明硅基骨架不会影响碱基的排列并且不会对两条链的胸腺嘧啶之间的环状氢键形成施加任何限制。然而，NMR结果表明T_SiT双链具有反平行链取向的独特形成。

  DOI：

  10.1524/zpch.2013.0382

文献信息

• Synthesis of dendritic oligodeoxyribonucleotide analogs with nonionic diisopropylsilyl linkage
  作者：Jin-Liang Lv、Zhi-Yong Zhao、Zhong-Qiang Yang、Dong-Sheng Liu、Qing-Hua Fan

  DOI：10.1016/j.tet.2011.09.108

  日期：2011.11

  Series of new dendritic oligodeoxyribonucleotide analogs with diisopropylsilyl linkage were prepared via liquid-phase synthesis. Dendron was employed as soluble support, which facilitated purification of the products by simple solvent precipitation. Sequences leading to the dendritic octamer 5'-TSiTSiTSiTSiTSiT-(Si)T(Si)T(S)2-3' (T8D(2)) were prepared and each isolated intermediate was characterized by NMR and mass spectrometry. The recognition properties of two complementary dendritic dinucleotide analogs of TSiTSiD2 (T2D2) and A(Si)A(Si)D(2) (A2D(2)) were also studied by NMR and FT-MS spectra in a nonaqueous aprotic environment (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.