7-[6-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-1,3-dioxa-5-selena-pentalen-4-yl]-6-chloro-7H-purine | 1433368-79-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 7-[6-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-1,3-dioxa-5-selena-pentalen-4-yl]-6-chloro-7H-purine
• 英文别名: [(3aR,4R,6R,6aS)-4-(6-chloropurin-7-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydroselenopheno[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methoxy-tert-butyl-diphenylsilane
• CAS: 1433368-79-6
• 化学式: C₂₉H₃₃ClN₄O₃SeSi
• 分子量: 628.105
• InChiKey: VDBQKWFCYODTKV-VBHAUSMQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.58
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  71.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-[6-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-1,3-dioxa-5-selena-pentalen-4-yl]-6-chloro-7H-purine 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 0.5h， 以50%的产率得到9-[6-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-1,3-dioxa-5-selena-pentalen-4-yl]-6-chloro-9H-purine
  参考文献：
  名称：

  N6-取代的5'-N-甲基氨基甲酰基-4'-硒腺苷为有力的和选择性的A3腺苷受体激动剂，具有异常的糖起皱和核碱基取向。

  摘要：

  通过用生物等位硒取代4'-氧代-或4'-硫代核苷来鉴定有效和选择性的A3腺苷受体（AR）激动剂。与先前的激动剂不同，如5'-N-甲基氨基甲酰基衍生物3p的X射线晶体结构所示，4'-硒类似物更喜欢糖苷的顺式构象和南糖起皱。在测试的化合物中，发现N6-3-碘苄基类似物3d是最有效的A3AR完全激动剂（Ki = 0.57 nM），对A1AR和A2AAR的选择性分别是≥800倍和1900倍。在N6-环烷基系列中，2-Cl类似物通常比2-H类似物表现出更好的hA3AR亲和力，而在N6-3-卤代苄基系列中2-H> 2-Cl。N7异构体3t和3u的结合力比相应的N9异构体弱得多，但化合物3t缺乏A3AR活化，似乎是弱者。2-Cl-N6-3-碘苄基类似物3p抑制小分子胶质细胞/单核细胞趋化性诱导的迁移，而在≤50μM时不引起细胞死亡。这表明开发4'-硒代核苷A3AR激动剂作为新型抗中风剂的潜力。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b00241
• 作为产物：
  描述：

  2,3-O-异亚丙基-D-核糖酸 gamma-内酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 甲基磺酰氯 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 53.0h， 生成 7-[6-(tert-butyl-diphenyl-silanyloxymethyl)-2,2-dimethyl-tetrahydro-1,3-dioxa-5-selena-pentalen-4-yl]-6-chloro-7H-purine
  参考文献：
  名称：

  2，6-二取代-4'-硒腺苷-5'-N，N-二甲基脲酰胺衍生物作为人A3腺苷受体拮抗剂的设计与合成

  摘要：

  描述了作为高效和选择性人A 3腺苷受体（hA 3 AR）拮抗剂的一系列新的4'-硒腺苷-5'- N，N-二甲基脲酰胺衍生物。通过向5'-尿嘧啶酰胺位置添加第二个N-甲基，将高度选择性的A 3 AR激动剂4'-硒腺苷-5'- N-甲基尿嘧啶酰胺成功转化为选择性拮抗剂。所有合成的化合物在hA 3 AR处显示中等至高的结合亲和力。在合成的化合物中，2-H- N 6 -3-碘苄基胺衍生物9f在hA 3 AR处显示出最高的结合亲和力。（K i = 22.7 nM）。通常，2-H类似物比2-Cl类似物显示出更好的结合亲和力。用2-Cl- N 6 -3-碘苄基胺衍生物9l进行的cAMP功能测定证明了hA 3 AR拮抗剂的活性。分子模型研究表明5'-乌拉酰胺的氢作为hA 3 AR活化的必要氢键供体的重要作用。

  DOI：

  10.3390/ph14040363

文献信息

• <i>N</i>⁶-Substituted 5′-<i>N</i>-Methylcarbamoyl-4′-selenoadenosines as Potent and Selective A₃ Adenosine Receptor Agonists with Unusual Sugar Puckering and Nucleobase Orientation
  作者：Jinha Yu、Long Xuan Zhao、Jongmi Park、Hyuk Woo Lee、Pramod K. Sahu、Minghua Cui、Steven M. Moss、Eva Hammes、Eugene Warnick、Zhan-Guo Gao、Minsoo Noh、Sun Choi、Hee-Chul Ahn、Jungwon Choi、Kenneth A. Jacobson、Lak Shin Jeong

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b00241

  日期：2017.4.27

  Potent and selective A3 adenosine receptor (AR) agonists were identified by the replacement of 4'-oxo- or 4'-thionucleosides with bioisosteric selenium. Unlike previous agonists, 4'-seleno analogues preferred a glycosidic syn conformation and South sugar puckering, as shown in the X-ray crystal structure of 5'-N-methylcarbamoyl derivative 3p. Among the compounds tested, N6-3-iodobenzyl analogue 3d

  通过用生物等位硒取代4'-氧代-或4'-硫代核苷来鉴定有效和选择性的A3腺苷受体（AR）激动剂。与先前的激动剂不同，如5'-N-甲基氨基甲酰基衍生物3p的X射线晶体结构所示，4'-硒类似物更喜欢糖苷的顺式构象和南糖起皱。在测试的化合物中，发现N6-3-碘苄基类似物3d是最有效的A3AR完全激动剂（Ki = 0.57 nM），对A1AR和A2AAR的选择性分别是≥800倍和1900倍。在N6-环烷基系列中，2-Cl类似物通常比2-H类似物表现出更好的hA3AR亲和力，而在N6-3-卤代苄基系列中2-H> 2-Cl。N7异构体3t和3u的结合力比相应的N9异构体弱得多，但化合物3t缺乏A3AR活化，似乎是弱者。2-Cl-N6-3-碘苄基类似物3p抑制小分子胶质细胞/单核细胞趋化性诱导的迁移，而在≤50μM时不引起细胞死亡。这表明开发4'-硒代核苷A3AR激动剂作为新型抗中风剂的潜力。
• New RNA Purine Building Blocks, 4′-Selenopurine Nucleosides: First Synthesis and Unusual Mixture of Sugar Puckerings
  作者：Jinha Yu、Jin-Hee Kim、Hyuk Woo Lee、Varughese Alexander、Hee-Chul Ahn、Won Jun Choi、Jungwon Choi、Lak Shin Jeong

  DOI：10.1002/chem.201300741

  日期：2013.4.26

  Writer's blocks: The first synthesis of RNA purine building blocks, 4′‐selenoadenosine and 4′‐selenoguanosine was achieved from D‐ribose by regioisomeric rearrangement, which was confirmed by X‐ray crystallography. 4′‐Selenoadenosine exists in an unusual mixture of north and south conformers in the solid state.

  作者的区块：通过区域异构体重排由D-核糖实现了RNA嘌呤结构单元4'-硒腺苷和4'-硒鸟苷的首次合成，这一点已通过X射线晶体学证实。4'-硒腺苷以固态的北部和南部构象异构体的混合物存在。
• Design and Synthesis of 2,6-Disubstituted-4′-Selenoadenosine-5′-N,N-Dimethyluronamide Derivatives as Human A3 Adenosine Receptor Antagonists
  作者：Hongseok Choi、Kenneth Jacobson、Jinha Yu、Lak Jeong

  DOI：10.3390/ph14040363

  日期：——

  ne derivative 9f exhibited the highest binding affinity at hA3AR. (Ki = 22.7 nM). The 2-H analogues generally showed better binding affinity than the 2-Cl analogues. The cAMP functional assay with 2-Cl-N6-3-iodobenzylamine derivative 9l demonstrated hA3AR antagonist activity. A molecular modelling study suggests an important role of the hydrogen of 5′-uronamide as an essential hydrogen bonding donor

  描述了作为高效和选择性人A 3腺苷受体（hA 3 AR）拮抗剂的一系列新的4'-硒腺苷-5'- N，N-二甲基脲酰胺衍生物。通过向5'-尿嘧啶酰胺位置添加第二个N-甲基，将高度选择性的A 3 AR激动剂4'-硒腺苷-5'- N-甲基尿嘧啶酰胺成功转化为选择性拮抗剂。所有合成的化合物在hA 3 AR处显示中等至高的结合亲和力。在合成的化合物中，2-H- N 6 -3-碘苄基胺衍生物9f在hA 3 AR处显示出最高的结合亲和力。（K i = 22.7 nM）。通常，2-H类似物比2-Cl类似物显示出更好的结合亲和力。用2-Cl- N 6 -3-碘苄基胺衍生物9l进行的cAMP功能测定证明了hA 3 AR拮抗剂的活性。分子模型研究表明5'-乌拉酰胺的氢作为hA 3 AR活化的必要氢键供体的重要作用。