Cbz(L-Phe)Aib₄OH | 1187839-12-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Cbz(L-Phe)Aib₄OH
• 英文别名: Cbz-Phe-Aib-Aib-Aib-Aib-OH；2-methyl-2-[[2-methyl-2-[[2-methyl-2-[[2-methyl-2-[[(2S)-3-phenyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoic acid
• CAS: 1187839-12-8
• 化学式: C₃₃H₄₅N₅O₈
• 分子量: 639.749
• InChiKey: DESHIDFTPKDETM-QHCPKHFHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  192
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Cbz(L-Phe)Aib₄OH 在 水 、 sodium acetate 、 乙酸酐 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 89.0h， 生成 benzyl ((14S)-2-(4-(hydroxy(phenyl)methyl)-5-oxo-4,5-dihydrooxazol-2-yl)-2,5,5,8,8,11,11-heptamethyl-4,7,10,13-tetraoxo-15-phenyl-3,6,9,12-tetraazapentadecan-14-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  Chemical communication: conductors and insulators of screw-sense preference between helical oligo(aminoisobutyric acid) domains

  摘要：

  1H NMR研究表明，非手性氨基酸能够传递从螺旋Aib4结构域到另一个结构域的左旋螺向偏好：某些四级氨基酸（如Ac6c）能有效传递构象偏好，而其他氨基酸（如双苯甘氨酸）则起到绝缘体的作用。

  DOI：

  10.1039/c2cc00060a
• 作为产物：
  描述：

  Z-L-PheAib4OtBu 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以76%的产率得到Cbz(L-Phe)Aib₄OH
  参考文献：
  名称：

  通过手性肽链定量手性的端到端构象交流

  摘要：

  成功的交流：来自最近的手性中心的超过60个键的两个非对映质子作为AB系统出现，表明插入结构是一个有序的螺旋。等时性的衰变量化了非手性氨基酸螺旋的线性持久性：每增加一个非手性残基，就损失了3.5％的手性影响。

  DOI：

  10.1002/anie.200901892

文献信息

• Diastereotopic fluorine substituents as 19F NMR probes of screw-sense preference in helical foldamers
  作者：Sarah J. Pike、Matteo De Poli、Wojciech Zawodny、James Raftery、Simon J. Webb、Jonathan Clayden

  DOI：10.1039/c3ob40463c

  日期：——

  Ligating simple amino alcohol or amino ester monomers containing enantiotopic fluorine substituents to the C-terminus of a helical peptide places the fluorine atoms in diastereotopic environments, and gives two distinct and easily identifiable signals in the 19F NMR spectrum. In the case of a dynamically inverting helix built from achiral monomers, the chemical shift separation between the 19F signals provides a simple means of analysing the ratio of screw-sense conformers in the oligomer, in cases where an asymmetric bias leads to a screw-sense preference.

  将含有对映体氟取代基的简单氨基醇或氨基酯单体连接到螺旋肽的 C 端，将氟原子置于非对映环境中，并在 19F NMR 光谱中产生两个不同且易于识别的信号。对于由非手性单体构建的动态反转螺旋，19F 信号之间的化学位移分离提供了一种简单的方法，在不对称偏置导致螺旋顺应性偏好的情况下，可以分析低聚物中螺旋顺应性构象的比例。
• Bis-pyrene probes of foldamer conformation in solution and in phospholipid bilayers
  作者：Francis G. A. Lister、Natasha Eccles、Sarah J. Pike、Robert A. Brown、George F. S. Whitehead、James Raftery、Simon J. Webb、Jonathan Clayden

  DOI：10.1039/c8sc02532k

  日期：——

  requires sensitive probes of conformation. Here we describe the design, synthesis and characterization of bis(pyrene) probes that report conformational changes in membrane-active dynamic foldamers. The probes were designed to distinguish between left-handed (M) and right-handed (P) screw-sense conformers of 310-helical α-aminoisobutyric acid (Aib) peptide foldamers, both in solution and in bilayer membranes

  探索膜相中合成分子的详细结构特征需要灵敏的构象探针。在这里，我们描述了报告膜活性动态折叠体中构象变化的双（芘）探针的设计、合成和表征。探针设计用于区分溶液和双层膜中的 3个 10-螺旋 α-氨基异丁酸 (Aib) 肽折叠体的左旋 ( M ) 和右旋 ( P ) 螺旋式构象异构体。合成了几种不同的双（芘）探针并将其连接到在N端具有不同手性残基的 Aib 四聚体的 C 端，这些残基在 310-螺旋。易于合成且方便掺入的N-乙酰基-1,2-双（芘-1'-基）乙二胺探针被证明具有最佳性能。在溶液中，折叠体螺旋感的变化导致该构象报告者的准分子/单体荧光发射（ E / M）比率发生显着变化，X射线晶体学显示相反的螺旋感产生非常不同的芘间距离记者。在双层中，这种方便且灵敏的荧光报告器首次允许研究天然磷脂的手性如何影响折叠体构象。
• The N-Terminal Nonapeptide of Cephaibols A and C: A Naturally Occurring Example of Mismatched Helical Screw-Sense Control
  作者：Ugo Orcel、Matteo De Poli、Marta De Zotti、Jonathan Clayden

  DOI：10.1002/chem.201302648

  日期：2013.11.25

  spectroscopy that the peptide containing the chiral amino acids Phe and Leu in the naturally occurring relative configuration exists in solution as an interconverting mixture of helical screw‐sense conformers. In contrast, the nonapeptide containing the unnatural relative configuration at Phe and Leu adopts a single, stable helical screw‐sense, which is left handed when the N‐terminal Phe residue is L and right‐handed

  据报道，真菌非核糖体肽抗生素cephaibol A和cephaibol C（AcPheAib 4 LeuIvaGly-Aib）的N端非肽结构域在结晶状态下采用右旋螺旋构象。但是，这种构象与在以Ac‐ L‐ PheAib 4封端的相关合成低聚物中的溶液中观察到的左旋螺旋结构不一致。碎片。我们报告了cephaibol N末端九肽的四种非对映异构体的合成，并通过NMR和CD光谱法表明，以自然存在的相对构型包含手性氨基酸Phe和Leu的肽以螺旋螺钉的互变混合物形式存在于溶液中。有意识的整合者。相比之下，在Phe和Leu处具有非自然相对构型的九肽采用单个稳定的螺旋螺序列，当N末端Phe残基为L时左旋，而N末端Phe残基为D时右旋。。
• Screw sense alone can govern enantioselective extension of a helical peptide by kinetic resolution of a racemic amino acid
  作者：Liam Byrne、Jordi Solà、Jonathan Clayden

  DOI：10.1039/c5cc01790d

  日期：——

  Helical peptides built principally from the achiral quaternary amino acid Aib but with an induced preferred screw-sense exhibit enantioselectivity in their chain-extension reactions when presented with a racemic tertiary amino...

  螺旋肽主要由非手性季氨基酸Aib构建，但具有诱导的优选螺旋感，当与消旋叔胺呈递时，它们的链延伸反应表现出对映选择性。
• A Chiral ¹⁹F NMR Reporter of Foldamer Conformation in Bilayers
  作者：Siyuan Wang、Flavio della Sala、Matthew J. Cliff、George F. S. Whitehead、Iñigo J. Vitórica-Yrezábal、Simon J. Webb

  DOI：10.1021/jacs.2c09103

  日期：2022.11.30

  Crystallography confirmed that the foldamers adopted 310 helical conformations. Variable temperature (VT) NMR spectroscopy in organic solvents showed that the (R)-TFEA reporter had an intrinsic preference for P helicity, but the overall screw-sense was dominated by a chiral “controller” at the N-terminus. The 19F NMR chemical shift of the CF3 resonance was correlated with the ability of different N-terminal

  了解和控制磷脂双层中的肽折叠体构象是其用作膜中分子信息中继的关键一步。为此，我们开发了一种新的19 F“报告者”标签，并将其附加到动态肽折叠器上。 ( R )-1-(三氟甲基)乙基酰胺基(( R )-TFEA)报道分子连接至α-氨基-异丁酸(Aib)折叠体的C末端。晶体学证实折叠体采用3 ×10螺旋构象。有机溶剂中的变温 (VT) NMR 光谱表明 ( R )-TFEA 报道分子对P螺旋性具有内在偏好，但整体螺旋方向由 N 末端的手性“控制器”主导。 CF 3共振的19 F NMR化学位移与不同N端基团在溶液中诱导M或P螺旋的能力相关。在双层中，也发现了类似的相关性。含有相同家族 ( R )-TFEA 标记的折叠体的小单层囊泡 (SUV) 悬浮液的溶液19 F NMR 光谱显示出较宽但可分辨的19 F 共振，每个化学位移反映了它们在有机溶剂中的相对位置。这些研究表明，磷脂双层中的折叠体构象