(5R)-2-chloro-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidine | 573987-69-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (5R)-2-chloro-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidine
• 英文别名: (5R)-2-chloro-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholane
• CAS: 573987-69-6
• 化学式: C₉H₁₁ClNOP
• 分子量: 215.619
• InChiKey: RGVPAVYGPVWCBR-LLTODGECSA-N

物化性质

• 沸点：
  276.1±43.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  12.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (5R)-2-chloro-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidine 在 叔丁基过氧化氢 、 二叔丁基过氧化物 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.08h， 生成 5'-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-3'-O-(3-methyl-2-oxo-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidin-2-yl)thymidine
  参考文献：
  名称：

  一种用于立体控制合成寡核苷硫代磷酸酯的氧氮杂磷脂方法

  摘要：

  描述了使用核苷 3'-O-oxazaphospholidine 衍生物作为单体单元的低聚脱氧核糖核苷硫代磷酸酯 (PS-ODNs) 的立体控制合成。2-Chloro-1,3,2-oxazaphospholidine 衍生物由六种对映纯的 1,2-氨基醇制备而成，用于 5'-O-保护核苷的磷酸化反应。对这些反应的详细研究表明，该反应的非对映选择性取决于对映体纯 1,2-氨基醇的结构、反应温度和用作 HCl 清除剂的胺。此外，还对 2-氯氧氮杂磷脂衍生物进行了从头算分子轨道计算，以阐明这些非对映选择性磷酸化反应的机理。发现磷原子上的 2-氯-5-苯基氧氮杂磷脂衍生物的 LUMO 几乎与 P-Cl 键正交。该 LUMO 可能参与主要保留 P 构型的磷酸化反应。开发了一系列二烷基（氰甲基）铵盐，并将其用作非对映纯核苷 3'-O-oxazaphospholidines 与 3'-O-保护的核苷的缩合

  DOI：

  10.1021/ja034502z
• 作为产物：
  描述：

  盐穗草碱 在 N-甲基吗啉 、 三氯化磷 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 以65%的产率得到(5R)-2-chloro-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidine
  参考文献：
  名称：

  一种用于立体控制合成寡核苷硫代磷酸酯的氧氮杂磷脂方法

  摘要：

  描述了使用核苷 3'-O-oxazaphospholidine 衍生物作为单体单元的低聚脱氧核糖核苷硫代磷酸酯 (PS-ODNs) 的立体控制合成。2-Chloro-1,3,2-oxazaphospholidine 衍生物由六种对映纯的 1,2-氨基醇制备而成，用于 5'-O-保护核苷的磷酸化反应。对这些反应的详细研究表明，该反应的非对映选择性取决于对映体纯 1,2-氨基醇的结构、反应温度和用作 HCl 清除剂的胺。此外，还对 2-氯氧氮杂磷脂衍生物进行了从头算分子轨道计算，以阐明这些非对映选择性磷酸化反应的机理。发现磷原子上的 2-氯-5-苯基氧氮杂磷脂衍生物的 LUMO 几乎与 P-Cl 键正交。该 LUMO 可能参与主要保留 P 构型的磷酸化反应。开发了一系列二烷基（氰甲基）铵盐，并将其用作非对映纯核苷 3'-O-oxazaphospholidines 与 3'-O-保护的核苷的缩合

  DOI：

  10.1021/ja034502z

文献信息

• Nucleic acid prodrugs and methods of use thereof
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD.

  公开号：US10307434B2

  公开（公告）日：2019-06-04

  Described herein are nucleic acid prodrugs and nucleic acid prodrugs comprising chiral phosphorous moieties. Also described herein are methods of making and using nucleic acid prodrugs and nucleic acid prodrugs comprising chiral phosphorous moieties.

  本文描述了包含手性磷分子的核酸原药和核酸原药。本文还描述了制造和使用包含手性磷分子的核酸原药和核酸原药的方法。
• [EN] METHOD OF PRODUCING A HIGHLY STEREOREGULAR PHOSPHORUS ATOM-MODIFIED NUCLEOTIDE ANALOGUE<br/>[FR] PROCEDE DE PRODUCTION D'UN ANALOGUE DE NUCLEOTIDE HAUTEMENT STEREOREGULIER DONT L'ATOME DE PHOSPHORE EST MODIFIE
  申请人：TOUDAI TLO LTD

  公开号：WO2005014609A3

  公开（公告）日：2005-04-28
• NOVEL NUCLEIC ACID PRODRUGS AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Verdine Gregory L.

  公开号：US20120316224A1

  公开（公告）日：2012-12-13

  Described herein are nucleic acid prodrugs and nucleic acid prodrugs comprising chiral phosphorous moieties. Also described herein are methods of making and using nucleic acid prodrugs and nucleic acid prodrugs comprising chiral phosphorous moieties.
• US9744183B2
  申请人：——

  公开号：US9744183B2

  公开（公告）日：2017-08-29
• Solid-Phase Synthesis of Stereoregular Oligodeoxyribonucleoside Phosphorothioates Using Bicyclic Oxazaphospholidine Derivatives as Monomer Units
  作者：Natsuhisa Oka、Mika Yamamoto、Terutoshi Sato、Takeshi Wada

  DOI：10.1021/ja805780u

  日期：2008.11.26

  Nucleoside 3'-O-bicylic oxazaphospholidine derivatives were designed as monomer units for a solid-phase synthesis of stereoregular oligodeoxyribonucleoside phosphorothioates (PS-ODNs). The trans-isomers of appropriately designed nucleoside 3'-O-bicyclic oxazaphospholidine derivatives were generated exclusively by the reaction between the 3'-OH of the corresponding protected nucleosides and 2-chloro-1

  核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物被设计为单体单元，用于固相合成有规立构寡脱氧核糖核苷硫代磷酸酯 (PS-ODNs)。适当设计的核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物的反式异构体仅通过相应受保护核苷的 3'-OH 与 2-氯-1,3,2-oxazaphospholidine 衍生物之间的反应生成。得到的反式-氧氮杂磷脂异构体在构型上是稳定的，在固体载体上缩合过程中，在酸性活化剂存在下差向异构化不会损害它们的非对映纯度。因此，通过使用氧氮杂磷脂单体和酸性活化剂形成 (Rp)- 和 (Sp)-硫代磷酸酯核苷酸间键的过程中，非对映纯度没有任何损失（非对映选择性 > 或 = 99:1）。此外，从头分子轨道计算表明，氧氮杂磷脂衍生物的差向异构化最有可能通过 N-质子化加速的边缘反转过程进行。计算不仅合理化了本研究中观察到的环结构与 oxazaphospholidines