N⁴-Succinoyl-N¹,N⁸-bis(2,3-bis(benzyloxy)benzoyl)spermidine | 117680-09-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: N⁴-Succinoyl-N¹,N⁸-bis(2,3-bis(benzyloxy)benzoyl)spermidine
• 英文别名: 4-[4-[[2,3-Bis(phenylmethoxy)benzoyl]amino]butyl-[3-[[2,3-bis(phenylmethoxy)benzoyl]amino]propyl]amino]-4-oxobutanoic acid
• CAS: 117680-09-8
• 化学式: C₅₃H₅₅N₃O₉
• 分子量: 878.034
• InChiKey: KTSNDRMMVCGQDO-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  1000.5±65.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.223±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8
• 重原子数：
  65
• 可旋转键数：
  26
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-Succinoyl-N¹,N⁸-bis(2,3-bis(benzyloxy)benzoyl)spermidine 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 草酰基二咪唑 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 15.5h， 生成 Spermexatol <2>
  参考文献：
  名称：

  Spermexatin and spermexatol: new synthetic spermidine-based siderophore analogs

  摘要：

  Syntheses of hexanediamine-based dihydroxamate (Hexamate), spermidine-based trihydroxamate (Spermexatins), and spermidine-based mixed siderophore analogues (Spermexatols) are described. Key intermediates include the N-hydroxysuccinimide esters of various hydroxamic acids, e.g., malonohydroxamate, succinohydroxamate, and glutarohydroxamate. These intermediates were synthesized, characterized, and incorporated as the ligating chains on spermidine. Also, mixed iron chelating compounds (Spermexatols) with both catechol and hydroxamic acid side chains were synthesized. The reagent carbobenzoxyimidazole was employed to distinguish between the primary and secondary amino groups of spermidine. The ability of these iron chelators to stimulate microbial growth is also described.

  DOI：

  10.1021/jm00122a013
• 作为产物：
  描述：

  N-(Carbobenzoxybutyl)-2-cyanoethylamine 在 4-二甲氨基吡啶 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 生成 N⁴-Succinoyl-N¹,N⁸-bis(2,3-bis(benzyloxy)benzoyl)spermidine
  参考文献：
  名称：

  [EN] ANTIBACTERIAL SIDEROMYCINS
  [FR] SIDÉROMYCINES ANTIBACTÉRIENNES

  摘要：

  一种化合物，包括：与Fe(III)结合和/或Fe(III)结合的铁载体；一个或多个可选的与铁载体共价结合的连接剂；以及共价结合到连接剂的达托霉素，或者如果没有连接剂存在，则共价结合到铁载体；或其药用可接受的盐或溶剂。

  公开号：

  WO2016027262A1

文献信息

• Synthetic Mimics of Native Siderophores Disrupt Iron Trafficking in <i>Acinetobacter baumannii</i>
  作者：Tabbetha J. Bohac、Luting Fang、Victoria S. Banas、Daryl E. Giblin、Timothy A. Wencewicz

  DOI：10.1021/acsinfecdis.1c00119

  日期：2021.8.13

  can serve as synthetically tractable siderophore mimics with potential utility as chemical probes and therapeutic agents to better understand and treat bacterial infections, respectively. Here, we demonstrate that synthetic spermidine-derived mixed ligand bis-catecholate monohydroxamate siderophores (compounds 1–3) are versatile structural and biomimetic analogues of two native siderophores, acinetobactin

  许多病原菌生物合成和排泄小分子金属载体，称为铁载体，用于从宿主来源提取三价铁以满足营养需求。天然铁载体通常是结构复杂的多齿螯合剂，它们选择性地形成具有确定手性的高亲和力八面体三价铁络合物，可通过细菌细胞表面上显示的同源蛋白受体识别。简化的非手性类似物可以作为合成易处理的铁载体模拟物，具有作为化学探针和治疗剂的潜在用途，可以分别更好地了解和治疗细菌感染。在这里，我们证明，亚精胺合成衍生的混合配位体双-儿茶酚monohydroxamate铁载体（化合物1 - 3) 是由多重耐药革兰氏阴性人类病原体鲍曼不动杆菌( Acinetobacter baumannii)生产的两种天然铁载体不动杆菌素和纤毛菌素的多功能结构和仿生类似物。合成铁载体的不含金属和三价铁配合物的生长促进剂鲍曼不动杆菌，而镓（III）-complexes是的有效生长抑制剂鲍曼不动杆菌与MIC值<1微米。合成铁载体与天然铁载体竞争在鲍曼不动杆菌中的摄取，并保持对三价铁
• Synthesis and in vitro antibacterial activity of spermidine-based mixed catechol- and hydroxamate-containing siderophore—Vancomycin conjugates
  作者：Manuka Ghosh、Marvin J. Miller

  DOI：10.1016/0968-0896(95)00161-1

  日期：1996.1

  The first antibiotic conjugates of vancomycin (1) and siderophore analogues containing spermidine-based catechol ligands (conjugate 11) as well as mixed catechol and hydroxamate ligands (conjugate 13) are described. The design of the conjugates was based on the earlier observation that conjugation of siderophore components to beta-lactam antibiotics induced active iron transport-mediated drug delivery

  描述了万古霉素（1）和含铁亚胺基邻苯二酚配体（共轭物11）以及邻苯二酚和异羟肟酸酯混合配体（共轭物13）的铁载体类似物的第一种抗生素共轭物。结合物的设计基于较早的观察结果，即铁载体组分与β-内酰胺抗生素的结合可诱导活性铁转运介导的药物递送。新型共轭物（11和13）是通过选择性酰化1的伯氨基而合成的。初步生物学研究表明，铁载体修饰的万古霉素相对于万古霉素本身，对革兰氏阳性细菌失去了一些活性（4至16倍），在铁充足的条件下，其抗革兰氏阴性菌的活性通常与万古霉素相似。然而，
• Antibacterial sideromycins
  申请人：Hsiri Therapeutics, Inc.

  公开号：US11149046B2

  公开（公告）日：2021-10-19

  A compound, comprising: an Fe(III)-binding and/or Fe(III)-bound siderophore; one or more optional linker covalently bound to the siderophore; and daptomycin covalently bound to the linker, or, if no linker is present, then to the siderophore; or pharmaceutically acceptable salt or solvate thereof.

  一种化合物，包括：与铁（III）结合和/或与铁（III）结合的苷元；与苷元共价结合的一个或多个任选连接体；与连接体共价结合的达托霉素，或如果不存在连接体，则与苷元共价结合的达托霉素；或其药学上可接受的盐或溶液。
• ANTIBACTERIAL SIDEROMYCINS
  申请人：Hsiri Therapeutics, Inc.

  公开号：US20190153010A1

  公开（公告）日：2019-05-23

  A compound, comprising: an Fe(III)-binding and/or Fe(III)-bound siderophore; one or more optional linker covalently bound to the siderophore; and daptomycin covalently bound to the linker, or, if no linker is present, then to the siderophore; or pharmaceutically acceptable salt or solvate thereof.