N²-(tert-butoxycarbonyl)-N⁶-propionyl-L-lysine | 1416785-82-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N²-(tert-butoxycarbonyl)-N⁶-propionyl-L-lysine
• 英文别名: Nα-Boc-Nε-propionyl-L-lysine
• CAS: 1416785-82-4
• 化学式: C₁₄H₂₆N₂O₅
• 分子量: 302.371
• InChiKey: RCHPUJSPKQWRRN-JTQLQIEISA-N

物化性质

• 沸点：
  536.1±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.107±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.66
• 重原子数：
  21.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  104.73
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²-(tert-butoxycarbonyl)-N⁶-propionyl-L-lysine 在 劳森试剂 、 茴香硫醚 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N²-((benzyloxy)carbonyl)-N⁶-propanethioyl-L-lysine
  参考文献：
  名称：

  Sirtuins 的脱硫酰化 1-3：使用基于机制的 Sirtuin 抑制进行药物设计的注意事项

  摘要：

  Sirtuin 酶是干预一系列疾病的潜在药物靶点。用含硫代酰胺和硫脲的底物模拟实体抑制此类酶的努力已经产生了许多高亲和力结合剂。然而，对这些抑制剂在各种条件下的稳定性研究的关注较少。在这里，我们提供了短链 ε- N前所未有的裂解程度的证据-硫代酰基赖氨酸修饰旨在靶向这些沉默调节蛋白，并进一步深入了解含有硫代酰胺和硫脲的化合物的血清稳定性。我们的研究对用于药物开发的基于短链硫代酰胺的 Sirtuins 抑制剂提出质疑，并指出基于单烷基化硫脲的化学型在人血清中更稳定。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.9b00580
• 作为产物：
  描述：

  丙酰氯 、 N-alpha-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 在 三甲基氯硅烷 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.05h， 以73%的产率得到N²-(tert-butoxycarbonyl)-N⁶-propionyl-L-lysine
  参考文献：
  名称：

  Sirtuins 的脱硫酰化 1-3：使用基于机制的 Sirtuin 抑制进行药物设计的注意事项

  摘要：

  Sirtuin 酶是干预一系列疾病的潜在药物靶点。用含硫代酰胺和硫脲的底物模拟实体抑制此类酶的努力已经产生了许多高亲和力结合剂。然而，对这些抑制剂在各种条件下的稳定性研究的关注较少。在这里，我们提供了短链 ε- N前所未有的裂解程度的证据-硫代酰基赖氨酸修饰旨在靶向这些沉默调节蛋白，并进一步深入了解含有硫代酰胺和硫脲的化合物的血清稳定性。我们的研究对用于药物开发的基于短链硫代酰胺的 Sirtuins 抑制剂提出质疑，并指出基于单烷基化硫脲的化学型在人血清中更稳定。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.9b00580

文献信息

• Synthesis of ε-N-propionyl-, ε-N-butyryl-, and ε-N-crotonyl-lysine containing histone H3 using the pyrrolysine system
  作者：Michael J. Gattner、Milan Vrabel、Thomas Carell

  DOI：10.1039/c2cc37836a

  日期：——

  Recently new lysine modifications were detected in histones and other proteins. Using the pyrrolysine amber suppression system we genetically inserted three of the new amino acids ε-N-propionyl-, ε-N-butyryl-, and ε-N-crotonyl-lysine site specifically into histone H3. The lysine at position 9 (H3 K9), which is known to be highly modified in chromatin, was replaced by these unnatural amino acids.

  最近在组蛋白和其他蛋白质中检测到新的赖氨酸修饰。使用吡咯赖氨酸琥珀抑制系统，我们将三个新氨基酸 ε-N-丙酰-、ε-N-丁酰-和 ε-N-巴豆酰-赖氨酸位点特异性插入组蛋白 H3 中。已知染色质中高度修饰的第 9 位赖氨酸 (H3 K9) 被这些非天然氨基酸取代。
• <i>N</i>^ε-Acryloyllysine Piperazides as Irreversible Inhibitors of Transglutaminase 2: Synthesis, Structure–Activity Relationships, and Pharmacokinetic Profiling
  作者：Robert Wodtke、Christoph Hauser、Gloria Ruiz-Gómez、Elisabeth Jäckel、David Bauer、Martin Lohse、Alan Wong、Johanna Pufe、Friedrich-Alexander Ludwig、Steffen Fischer、Sandra Hauser、Dieter Greif、M. Teresa Pisabarro、Jens Pietzsch、Markus Pietsch、Reik Löser

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b00286

  日期：2018.5.24

  Transglutaminase 2 (TGase 2)-catalyzed transamidation represents an important post-translational mechanism for protein modification with implications in physiological and pathophysiological conditions, including fibrotic and neoplastic processes. Consequently, this enzyme is considered a promising target for the diagnosis of and therapy for these diseases. In this study, we report on the synthesis and kinetic characterization of N-acryloyllysine piperazides as irreversible inhibitors of TGase 2. Systematic structural modifications on 54 new compounds were performed with a major focus on fluorine-bearing substituents due to the potential of such compounds to serve as radiotracer candidates for positron emission tomography. The determined inhibitory activities ranged from 100 to 10 000 M-1 s(-1), which resulted in comprehensive structure activity relationships. Structure activity correlations using various substituent parameters accompanied by covalent docking studies provide an advanced understanding of the molecular recognition for this inhibitor class within the active site of TGase 2. Selectivity profiling of selected compounds for other transglutaminases demonstrated an excellent selectivity toward transglutaminase 2. Furthermore, an initial pharmacokinetic profiling of selected inhibitors was performed, including the assessment of potential membrane permeability and liver microsomal stability.