5-[p-methyl-α-(methylsulfanyl)benzylidene]-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione | 382626-26-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 5-[p-methyl-α-(methylsulfanyl)benzylidene]-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione
• 英文别名: 5-(p-methyl-α-thiomethoxybenzylidene)-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione；2,2-Dimethyl-5-[(4-methylphenyl)-methylsulfanylmethylidene]-1,3-dioxane-4,6-dione
• CAS: 382626-26-8
• 化学式: C₁₅H₁₆O₄S
• 分子量: 292.356
• InChiKey: NKOHXBMVGYFVMZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  77.9
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  邻氨基苯甲酸甲酯 、 5-[p-methyl-α-(methylsulfanyl)benzylidene]-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione 以 二苯醚 为溶剂， 反应 0.33h， 以83%的产率得到8-(methoxycarbonyl)-2-(4'-methylphenyl)-4(1H)-quinolone
  参考文献：
  名称：

  使用噻唑橙置换试验筛选用于 RNA 结合的螺旋穿线肽。

  摘要：

  使用噻唑橙的荧光嵌入剂置换试验已适用于 RNA 结合螺旋穿线肽 (HTP) 的研究。该测定对 HTP 结合 RNA 高度敏感，并提供与定量核糖核酸酶足迹非常一致的结合亲和力数据，无需放射性标记或凝胶电泳。FID 测定用于定义螺旋线肽的小型文库的结构活性关系。这些研究的结果表明，它们的 RNA 结合取决于肽序列、α-氨基酸立体化学和环化（相对于线性肽），但与分析的五肽、四肽和三肽的大环大小无关。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2008.08.066
• 作为产物：
  描述：

  对溴甲苯 、 5-[双(甲基硫代)亚甲基]-2,2-二甲基-1,3-二噁烷-4,6-二酮 在 magnesium 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以77.4%的产率得到5-[p-methyl-α-(methylsulfanyl)benzylidene]-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione
  参考文献：
  名称：

  Amine catalysis in the vinylic substitution of α-methylthio-α-arylmethylene Meldrum's acids and its absence in the substitution of methyl β-iodo-α-nitrocinnamate by amines

  摘要：

  用胺取代(E)-和(Z)-甲基δ-碘±-硝基肉桂酸盐 (5) 的碘，可得到与苯胺 (Ani) 和哌啶 (Pip) 相同的 (Z)- 烯胺。在 MeCN 中，Pip、Ani、吗啉 (Mor) 或 p-MeOC6H4NHMe (MMA)；在 EtOH 中，Pip 或 Mor 均未发生胺催化作用：kPip/kMor = 115â138 (MeCN), 3.3â6.9（EtOH）；kMeCN/kEtOH = 25.5 ±Â 2.2（Pip），0.79â1.16（Mor）；k(Z)-5/k(E)-5 = 1.3â2.9 （MMA 在 MeCN 中为 13.5）。在 MeCN 和 EtOH 中，用 Pip 取代 6 个δ-甲硫基-δ-芳基亚甲基梅氏酸（6-X）中的 MeS 基团会产生胺催化作用。在 EtOH 中，对甲氧基苯甲酰衍生物（6-MeO）和在 MeCN 中，6-MeO、6-Me 和 6-H 在 Pip 中显示出二阶催化作用。其他 6-X 化合物在 Pip 中的催化顺序介于一阶和二阶之间，30°C 时，胺催化（k3B）/非催化（k2）速率系数比分别为 281â731 （EtOH）和 504â635 （MeCN），kMeCN/kEtOH=3.0â4.9。在MeCN中，δHÂ=Â0.8至Â5.9 kcal molÂ1，δSÂ=Â50至Â72 e.u。对于体系 5，Iâ从 3a 中排出的速率超过了它的去质子化速率，观察到的速率系数是复合的：在 MeCN 中 kobs = k1k2/kâ1 （k1 = 亲核攻击速率系数），但在 EtOH 中 kobs = k1。在 MeCN 中，去质子化的速度快于 MeSâ 的排出速度，对于 X = p-Br、p-CF3、m,mâ²-(CF3)2 的 6-X 来说更是如此。6-X 的不同亲电性、不同程度的氢键、立体效应和电子效应是造成动力学差异的原因。

  DOI：

  10.1039/b103486n

文献信息

• Kinetics and mechanism of reactions of substituted (methylthio)benzylidene Meldrum's acids with primary amines in aqueous DMSO
  作者：Mahammad Ali、Supriya Biswas、Zvi Rappoport、Claude F. Bernasconi

  DOI：10.1002/poc.1109

  日期：2006.10

  A kinetic study of the aminolysis of substituted (methylthio)benzylidene Meldrum's acids, 2-SMe-Z with the aliphatic primary amines, n-butylamine, glycinamide, methoxyethylamine, and aminoacetonitrile, in aqueous DMSO at 20 °C is reported. With all amines the reaction is strictly second-order, that is, first-order in 2-SMe-Z and first-order in the amine. A three steps mechanism has been proposed. The

  据报道，在20°C的DMSO水溶液中，对取代的（甲硫基）亚苄基Meldrum酸2-SMe-Z与脂肪族伯胺，正丁胺，甘氨酰胺，甲氧基乙胺和氨基乙腈的氨解反应进行了动力学研究。对于所有的胺，反应严格地是二级的，即2-SMe-Z中的一级，而胺中的一级。已经提出了三步机制。第一步是限制胺形成四面体中间体（T）的速率，随后的步骤是快速的酸碱平衡，接着是快速的R‴CH 2 NH或H 2 O催化排出物团体。k的布朗斯台德图1为的反应2-SME-H具有四个伯胺显示日志之间的良好相关性ķ 1且p ķ与β NUC  = 0.32±0.02，比稍低值仲胺的反应（β NUC  = 0.41 ±0.01）。正丁胺收率的哈米特图ρ（k 1）= 0.40±0.05，小于哌啶与相同底物的反应（ρ（k 1）= 0.72±0.07）和HOCH 2反应的Hammett图CH 2小号-（ρ（ķ 1）= 1.18），CF 3CH 2
• Reactions of Substituted (Methylthio)benzylidene Meldrum's Acids with Secondary Alicyclic Amines in Aqueous DMSO. Evidence for Rate-Limiting Proton Transfer
  作者：Claude F. Bernasconi、Mahammad Ali、Kelly Nguyen、Viola Ruddat、Zvi Rappoport

  DOI：10.1021/jo040244s

  日期：2004.12.1

  methylthio group of substituted methylthiobenzylidene Meldrum's acids (2-SMe-Z) by secondary alicyclic amines occurs by a three-step mechanism. The first step is a nucleophilic attachment of the amine to 2-SMe-Z to form a zwitterionic intermediate ; the second step involves deprotonation of to form ; while the third step represents general acid-catalyzed conversion of to products. At high amine and/or high

  取代的甲硫基亚苄基Meldrum酸（2-SMe-Z）的甲硫基被脂环族仲胺取代是通过三步机理进行的。第一步是胺与2-SMe-Z亲核连接，形成两性离子中间体。第二步涉及形成的质子化; 而第三步代表了一般的酸催化转化为产物。在高胺和/或高KOH浓度下，亲核附着是速率限制的。在低胺和低KOH浓度下，反应遵循速率规律，该速率规律是一般碱催化的特征，原则上，该速率规律与NH3的限速去质子化或NH3的限速转化相一致。产品。详细的结构反应性分析表明，对于与哌嗪，1-（2-羟乙基）哌嗪和吗啉的反应而言，去质子化是速率限制，而对于与哌啶的反应而言，向哌啶的转化是速率限制。
• Macrocyclic Helix-Threading Peptides for Targeting RNA
  作者：Malathy Krishnamurthy、Kristina Simon、Anita M. Orendt、Peter A. Beal

  DOI：10.1002/anie.200702247

  日期：2007.9.17
• Screening helix-threading peptides for RNA binding using a thiazole orange displacement assay
  作者：Malathy Krishnamurthy、Nicole T. Schirle、Peter A. Beal

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.08.066

  日期：2008.10

  the study of RNA-binding helix-threading peptides (HTPs). This assay is highly sensitive with HTP-binding RNAs and provides binding affinity data in good agreement with quantitative ribonuclease footprinting without the need for radiolabeling or gel electrophoresis. The FID assay was used to define structure activity relationships for a small library of helix-threading peptides. Results of these studies

  使用噻唑橙的荧光嵌入剂置换试验已适用于 RNA 结合螺旋穿线肽 (HTP) 的研究。该测定对 HTP 结合 RNA 高度敏感，并提供与定量核糖核酸酶足迹非常一致的结合亲和力数据，无需放射性标记或凝胶电泳。FID 测定用于定义螺旋线肽的小型文库的结构活性关系。这些研究的结果表明，它们的 RNA 结合取决于肽序列、α-氨基酸立体化学和环化（相对于线性肽），但与分析的五肽、四肽和三肽的大环大小无关。
• Amine catalysis in the vinylic substitution of α-methylthio-α-arylmethylene Meldrum's acids and its absence in the substitution of methyl β-iodo-α-nitrocinnamate by amines
  作者：Michal Beit-Yannai、Xin Chen、Zvi Rappoport

  DOI：10.1039/b103486n

  日期：——

  Substitution of the iodine of (E)- and (Z)-methyl β-iodo-α-nitrocinnamates (5) by amines gives identical (Z)-enamines with aniline (Ani) and piperidine (Pip). No amine catalysis was observed with Pip, Ani, morpholine (Mor), or p-MeOC6H4NHMe (MMA) in MeCN nor with Pip or Mor in EtOH: kPip/kMor = 115–138 (MeCN), 3.3–6.9 (EtOH); kMeCN/kEtOH = 25.5 ± 2.2 (Pip), 0.79–1.16 (Mor); k(Z)-5/k(E)-5 = 1.3–2.9 (13.5 with MMA in MeCN). Replacement of the MeS group in six α-methylthio-α-arylmethylene Meldrum's acid (6-X) by Pip resulted in amine catalysis in MeCN and EtOH. In EtOH, the p-anisyl derivative (6-MeO) and in MeCN 6-MeO, 6-Me and 6-H displayed second order catalysis in Pip. Other 6-X compounds show orders between one and two in Pip with amine catalyzed (k3B)/non-catalyzed (k2) rate coefficient ratios of 281–731 (EtOH) and 504–635 (MeCN) at 30 °C. kMeCN/kEtOH = 3.0–4.9. In MeCN ΔH‡ = −0.8 to −5.9 kcal mol−1 and ΔS‡ = −50 to −72 e.u. An intermediate zwitterion, 3a, is formed in all cases. For system 5 the rate of I− expulsion from 3a exceeds its deprotonation rate, and the observed rate coefficient is composite: kobs = k1k2/k−1 in MeCN (k1 = rate coefficient of nucleophilic attack) but kobs = k1 in EtOH. In MeCN the deprotonation is faster than the expulsion rate of MeS−, and more so for 6-X with X = p-Br, p-CF3, m,m′-(CF3)2. Different electrophilicities of 6-X, different extents of hydrogen bonding, steric and electronic effects account for the kinetic differences.

  用胺取代(E)-和(Z)-甲基δ-碘±-硝基肉桂酸盐 (5) 的碘，可得到与苯胺 (Ani) 和哌啶 (Pip) 相同的 (Z)- 烯胺。在 MeCN 中，Pip、Ani、吗啉 (Mor) 或 p-MeOC6H4NHMe (MMA)；在 EtOH 中，Pip 或 Mor 均未发生胺催化作用：kPip/kMor = 115â138 (MeCN), 3.3â6.9（EtOH）；kMeCN/kEtOH = 25.5 ±Â 2.2（Pip），0.79â1.16（Mor）；k(Z)-5/k(E)-5 = 1.3â2.9 （MMA 在 MeCN 中为 13.5）。在 MeCN 和 EtOH 中，用 Pip 取代 6 个δ-甲硫基-δ-芳基亚甲基梅氏酸（6-X）中的 MeS 基团会产生胺催化作用。在 EtOH 中，对甲氧基苯甲酰衍生物（6-MeO）和在 MeCN 中，6-MeO、6-Me 和 6-H 在 Pip 中显示出二阶催化作用。其他 6-X 化合物在 Pip 中的催化顺序介于一阶和二阶之间，30°C 时，胺催化（k3B）/非催化（k2）速率系数比分别为 281â731 （EtOH）和 504â635 （MeCN），kMeCN/kEtOH=3.0â4.9。在MeCN中，δHÂ=Â0.8至Â5.9 kcal molÂ1，δSÂ=Â50至Â72 e.u。对于体系 5，Iâ从 3a 中排出的速率超过了它的去质子化速率，观察到的速率系数是复合的：在 MeCN 中 kobs = k1k2/kâ1 （k1 = 亲核攻击速率系数），但在 EtOH 中 kobs = k1。在 MeCN 中，去质子化的速度快于 MeSâ 的排出速度，对于 X = p-Br、p-CF3、m,mâ²-(CF3)2 的 6-X 来说更是如此。6-X 的不同亲电性、不同程度的氢键、立体效应和电子效应是造成动力学差异的原因。