uridine 5’-(6-amino-6-deoxy-α-D-galactopyranosyl) diphosphate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: uridine 5’-(6-amino-6-deoxy-α-D-galactopyranosyl) diphosphate
• 英文别名: UDP-6-NH₂-Gal；[(2R,3R,4S,5R,6R)-6-(aminomethyl)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl] [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] hydrogen phosphate
• 化学式: C₁₅H₂₅N₃O₁₆P₂
• 分子量: 565.322
• InChiKey: OAQISHPSIFMSLS-ABVWGUQPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -9.2
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  297
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,3-di-O-acetyluridine 在 palladium on activated carbon 、 氢气 、 三乙胺 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 uridine 5’-(6-amino-6-deoxy-α-D-galactopyranosyl) diphosphate
  参考文献：
  名称：

  用于植物糖基转移酶的鉴定和表征的基于聚糖阵列的测定。

  摘要：

  种植具有改良细胞壁成分的植物是提高对病原体的抵抗力、增加生物量消化率和调整其他重要特性的有前途的策略。为了改变生物质结构，详细了解细胞壁结构和生物合成是先决条件。我们在这里报告了一种基于聚糖阵列的检测方法，用于植物细胞壁生物合成糖基转移酶（GT）的高通量鉴定和表征。我们证明，不同的异源表达的半乳糖基、岩藻糖基和木糖基转移酶可以将叠氮基功能化的糖核苷酸供体转移到阵列上选定的合成植物细胞壁寡糖，并且转移的单糖可以通过 1,3-与炔基修饰染料的偶极环加成反应。同时筛选数千种假定 GT、核苷酸糖供体和寡糖受体组合的机会将极大地加速植物细胞壁生物合成研究。

  DOI：

  10.1002/anie.202003105

文献信息

• A Glycan Array‐Based Assay for the Identification and Characterization of Plant Glycosyltransferases
  作者：Colin Ruprecht、Max P. Bartetzko、Deborah Senf、Anna Lakhina、Peter J. Smith、Maria J. Soto、Hyunil Oh、Jeong‐Yeh Yang、Digantkumar Chapla、Daniel Varon Silva、Mads H. Clausen、Michael G. Hahn、Kelley W. Moremen、Breeanna R. Urbanowicz、Fabian Pfrengle

  DOI：10.1002/anie.202003105

  日期：2020.7.20

  Growing plants with modified cell wall compositions is a promising strategy to improve resistance to pathogens, increase biomass digestibility, and tune other important properties. In order to alter biomass architecture, a detailed knowledge of cell wall structure and biosynthesis is a prerequisite. We report here a glycan array‐based assay for the high‐throughput identification and characterization of

  种植具有改良细胞壁成分的植物是提高对病原体的抵抗力、增加生物量消化率和调整其他重要特性的有前途的策略。为了改变生物质结构，详细了解细胞壁结构和生物合成是先决条件。我们在这里报告了一种基于聚糖阵列的检测方法，用于植物细胞壁生物合成糖基转移酶（GT）的高通量鉴定和表征。我们证明，不同的异源表达的半乳糖基、岩藻糖基和木糖基转移酶可以将叠氮基功能化的糖核苷酸供体转移到阵列上选定的合成植物细胞壁寡糖，并且转移的单糖可以通过 1,3-与炔基修饰染料的偶极环加成反应。同时筛选数千种假定 GT、核苷酸糖供体和寡糖受体组合的机会将极大地加速植物细胞壁生物合成研究。