1-[(benzyloxy)methyl]-5-isopropyl-6-(2-naphthylthio)uracil

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机硫化合物 - 硫醚类
• 英文名称: 1-[(benzyloxy)methyl]-5-isopropyl-6-(2-naphthylthio)uracil
• 英文别名: 1-(Benzyloxymethyl)-5-isopropyl-6-(2-naphthylsulfanyl)pyrimidine-2,4-dione；6-naphthalen-2-ylsulfanyl-1-(phenylmethoxymethyl)-5-propan-2-ylpyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₂₅H₂₄N₂O₃S
• 分子量: 432.543
• InChiKey: RCVODTSZNAXRKV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.3
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  83.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(benzyloxy)methyl]-5-isopropyl-6-(2-naphthylthio)uracil 在 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 12.0h， 以72.3%的产率得到1-((benzyloxy)methyl)-5-isopropyl-6-(naphthalen-2-ylsulfinyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  [(2-Hydroxyethoxy)methyl]-6-(phenylthio)-thymine 衍生物作为非核苷 HIV-1 逆转录酶抑制剂的基于结构的设计：从 HEPT 到亚磺酰基取代的 HEPT

  摘要：

  据报道，[(2-羟基乙氧基)甲基]-6-(苯硫基)胸腺嘧啶(HEPT)类似物是一种很有前途的先导化合物，可作为非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂。在这项工作中，通过基于结构的设计策略设计了一系列新型亚磺酰基取代类似物，旨在提高 HEPT 的活性，然后评估它们在 MT-4 细胞中的抗 HIV-1 活性。大多数最终化合物对野生型 HIV-1 毒株 (III B ) 具有中等至强活性，EC 50值在 0.21-1.91 μM 范围内，比参考化合物 HEPT 好约 4 ∼ 32 倍。其中一些对临床相关的突变型 L100I 和 E138K 病毒表现出比 NVP 更高的敏感性。进一步评估了所选化合物对野生型逆转录酶 (RT) 的活性，其中大多数表现出纳摩尔活性，表明与基于细胞的活性具有良好的相关性。化合物11h、11l和11ab对野生型 HIV-1 毒株（EC 50 = 0.280、0.209 和 0.290

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2022.105880
• 作为产物：
  描述：

  5-异丙基-6-氯-2,4-嘧啶二酮 在 sodium tetrahydroborate 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 1-[(benzyloxy)methyl]-5-isopropyl-6-(2-naphthylthio)uracil
  参考文献：
  名称：

  [(2-Hydroxyethoxy)methyl]-6-(phenylthio)-thymine 衍生物作为非核苷 HIV-1 逆转录酶抑制剂的基于结构的设计：从 HEPT 到亚磺酰基取代的 HEPT

  摘要：

  据报道，[(2-羟基乙氧基)甲基]-6-(苯硫基)胸腺嘧啶(HEPT)类似物是一种很有前途的先导化合物，可作为非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂。在这项工作中，通过基于结构的设计策略设计了一系列新型亚磺酰基取代类似物，旨在提高 HEPT 的活性，然后评估它们在 MT-4 细胞中的抗 HIV-1 活性。大多数最终化合物对野生型 HIV-1 毒株 (III B ) 具有中等至强活性，EC 50值在 0.21-1.91 μM 范围内，比参考化合物 HEPT 好约 4 ∼ 32 倍。其中一些对临床相关的突变型 L100I 和 E138K 病毒表现出比 NVP 更高的敏感性。进一步评估了所选化合物对野生型逆转录酶 (RT) 的活性，其中大多数表现出纳摩尔活性，表明与基于细胞的活性具有良好的相关性。化合物11h、11l和11ab对野生型 HIV-1 毒株（EC 50 = 0.280、0.209 和 0.290

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2022.105880

文献信息

• Nonnucleoside HIV-1 Reverse-Transcriptase Inhibitors, Part 5. Synthesis and Anti-HIV-1 Activity of Novel 6-Naphthylthio HEPT Analogues
  作者：Guang-Fu Sun、Xu-Xiang Chen、Fen-Er Chen、Yue-Ping Wang、Erik De Clercq、Jan Balzarini、Christophe Pannecouque

  DOI：10.1248/cpb.53.886

  日期：——

  As part of a series of studies to discover new HIV reverse-transcriptase inhibitors, various novel 6α- and 6β-naphthylthio 1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]-6-(phenylthio) thymine (HEPT) derivatives were synthesized, and in vitro anti-HIV-1 activity was evaluated. The results revealed that most of 6α-naphthylthio HEPT derivatives (7a—w) showed good activity [for 7e, IC50 value of 0.048 μM and selectivity index (SI) value of 735; for 7h, IC50 value of 0.057 μM and SI value of 579; for 7k, IC50 value of 0.063 μM and SI value of 565], 6β-naphthylthio HEPT derivatives (8a—f) showed low activity, but the introduction of α nitro group to the C-1 position of the 6β-naphthyl ring in the 6β-naphthylthio series (11a—c) resulted in a dramatic increase in anti-HIV-1 activity.

  作为发现新的 HIV 逆转录酶抑制剂的一系列研究的一部分，合成了各种新型 6α- 和 6β- 萘硫基 1-[(2-羟乙氧基)甲基]-6-（苯硫基）胸腺嘧啶（HEPT）衍生物，并对其体外抗 HIV-1 活性进行了评估。结果表明，大多数 6α-naphthylthio HEPT 衍生物（7a-w）都表现出良好的活性[7e 的 IC50 值为 0.048 μM，选择性指数（SI）值为 735；7h 的 IC50 值为 0.057 μM，选择性指数（SI）值为 579；7k 的 IC50 值为 0.063 μM，选择性指数（SI）值为 0.063 μM，SI 值为 565]，6β-萘硫基 HEPT 衍生物（8a-f）的活性较低，但在 6β-萘硫基系列（11a-c）的 6β-萘环的 C-1 位上引入 α 硝基后，抗 HIV-1 活性显著提高。
• Structure-Based design of [(2-Hydroxyethoxy)methyl]-6-(phenylthio)-thymine derivatives as nonnucleoside HIV-1 reverse transcriptase Inhibitors: From HEPTs to Sulfinyl-substituted HEPTs
  作者：Qingqing Hao、Shuai Wang、Wenjuan Huang、Yinxiang Zhang、Christophe Pannecouque、Erik De Clercq、Fener Chen

  DOI：10.1016/j.bioorg.2022.105880

  日期：2022.9

  The [(2-hydroxyethoxy)methyl]-6-(phenylthio)thymine (HEPT) analogs were reported to be a kind of promising lead compounds as nonnucleoside HIV-1 reverse transcriptase inhibitors. In this work, a series of novel sulfinyl-substituted analogs were designed by structure-based design strategy with the purpose of improving the activity of HEPT, followed by evaluating their anti-HIV-1 activity in MT-4 cells

  据报道，[(2-羟基乙氧基)甲基]-6-(苯硫基)胸腺嘧啶(HEPT)类似物是一种很有前途的先导化合物，可作为非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂。在这项工作中，通过基于结构的设计策略设计了一系列新型亚磺酰基取代类似物，旨在提高 HEPT 的活性，然后评估它们在 MT-4 细胞中的抗 HIV-1 活性。大多数最终化合物对野生型 HIV-1 毒株 (III B ) 具有中等至强活性，EC 50值在 0.21-1.91 μM 范围内，比参考化合物 HEPT 好约 4 ∼ 32 倍。其中一些对临床相关的突变型 L100I 和 E138K 病毒表现出比 NVP 更高的敏感性。进一步评估了所选化合物对野生型逆转录酶 (RT) 的活性，其中大多数表现出纳摩尔活性，表明与基于细胞的活性具有良好的相关性。化合物11h、11l和11ab对野生型 HIV-1 毒株（EC 50 = 0.280、0.209 和 0.290