合成了包含三唑部分的新型氮杂大环内酯,并评估了它们对根癌农杆菌的群体感应
抑制剂活性。发现化合物Z12-3在200mg/L(0.45mM)时的抑制率可达67%。这些分子与 TraR QS 受体之间的潜在结合模式是通过分子对接进行的。结果表明,Z12-3三唑环上的两个氮原子与GLN-2形成氢键,酰胺中的羰基(C=O)与
水形成氢键。值得注意的是,大环内酯上的羰基与 DNA 中的 G-106 碱基形成氢键。这些氮杂大环内酯可以通过氢键键合 TraR QS 受体中的关键
氨基酸残基或 DNA 碱基来阻断群体感应表达。