1-((2R,3R,4R,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 367511-37-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-((2R,3R,4R,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 1-[(2R,3R,4R,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]-3-methoxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 367511-37-3
• 化学式: C₂₂H₄₂N₂O₆Si₂
• 分子量: 486.756
• InChiKey: NZGTXWSGCBMHTB-NXWXRZEISA-N

物化性质

• 密度：
  1.07±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.86
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  86.3
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险类别：
  6.1
• 危险性防范说明：
  P261,P264,P270,P271,P280,P302+P352,P304+P340,P310,P330,P361,P403+P233,P405,P501
• 危险品运输编号：
  2811
• 危险性描述：
  H301,H311,H331
• 包装等级：
  III

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,3R,4R,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 戴斯-马丁氧化剂 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 23.08h， 生成 5'-deoxy-3'-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-2'-O-methyl-5'-oxouridine
  参考文献：
  名称：

  作为磷酸盐模拟物的新型环丙基膦酸核苷酸的合成

  摘要：

  寡核苷酸固有的体内不稳定性是开发基于 RNAi 的疗法的众多挑战之一。对 5'-末端的化学修饰作为一种现有的范式，可以使磷酸化的反义链不易被内源性酶降解。最近的研究表明，与未修饰的磷酸衍生物相比，在寡核苷酸末端安装 5'-环丙基膦酸酯会导致更大程度的靶蛋白敲低。在本文中，我们报告了 5'-修饰的尿苷的合成。

  DOI：

  10.1039/d1cc02328d
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 2'-甲氧基尿苷 在 咪唑 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 1-((2R,3R,4R,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  作为磷酸盐模拟物的新型环丙基膦酸核苷酸的合成

  摘要：

  寡核苷酸固有的体内不稳定性是开发基于 RNAi 的疗法的众多挑战之一。对 5'-末端的化学修饰作为一种现有的范式，可以使磷酸化的反义链不易被内源性酶降解。最近的研究表明，与未修饰的磷酸衍生物相比，在寡核苷酸末端安装 5'-环丙基膦酸酯会导致更大程度的靶蛋白敲低。在本文中，我们报告了 5'-修饰的尿苷的合成。

  DOI：

  10.1039/d1cc02328d

文献信息

• [EN] S-ANTIGEN TRANSPORT INHIBITING OLIGONUCLEOTIDE POLYMERS AND METHODS<br/>[FR] POLYMÈRES OLIGONUCLÉOTIDIQUES INHIBANT LE TRANSPORT DE L'ANTIGÈNE S ET MÉTHODES
  申请人：ALIGOS THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2021119325A1

  公开（公告）日：2021-06-17

  Various embodiments provide STOPS™ polymers that are S-antigen transport inhibiting oligonucleotide polymers, processes for making them and methods of using them to treat diseases and conditions. In some embodiments the STOPS™ modified oligonucleotides include an at least partially phosphorothioated sequence of alternating A and C units having modifications as described herein. The sequence independent antiviral activity against hepatitis B of embodiments of STOPS™ modified oligonucleotides, as determined by HBsAg Secretion Assay, is an EC50 that is less than 100 nM.

  各种实施方式提供了STOPS™聚合物，这些聚合物是S-抗原转运抑制寡核苷酸聚合物，提供了制备它们的方法以及使用它们治疗疾病和症状的方法。在某些实施方式中，STOPS™修饰的寡核苷酸包括至少部分磷硫酸酯化的交替A和C单元序列，具有如本文所述的修饰。通过HBsAg分泌测定确定的STOPS™修饰的寡核苷酸对乙型肝炎的序列无关抗病毒活性，其EC50小于100 nM。
• [EN] MODIFIED NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF<br/>[FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE MODIFIÉES ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：MODERNA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2014093924A1

  公开（公告）日：2014-06-19

  The present disclosure provides modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and methods of using them.

  本公开提供了经修改的核苷、核苷酸和核酸，以及它们的使用方法。
• Can Phosphate-Branched RNA Persist under Physiological Conditions?
  作者：Tuomas A. Lönnberg

  DOI：10.1002/cbic.201200629

  日期：2012.12.21

  RNA X files: An RNA phosphotriester linkage embedded within a doublehelical stem is hydrolytically 100 times more stable than the corresponding trinucleoside monophosphate. Similar linkages in kinked regions can be even more long‐lived. This might bring the existence of phosphate‐branched RNA, such as the so‐called RNA X, under physiological conditions within the realm of possibility.

  RNA X档案：嵌入双螺旋茎中的RNA磷酸三酯键在水解上比相应的三核苷单磷酸酯稳定100倍。扭结区域中的类似链接甚至可以更长寿。在可能的生理条件下，这可能导致存在磷酸盐支化的RNA，例如所谓的RNAX。
• Modified Short Interfering Nucleic Acid (siNA) Molecules and Uses Thereof
  申请人：Aligos Therapeutics, Inc.

  公开号：US20220177888A1

  公开（公告）日：2022-06-09

  Disclosed herein are short interfering nucleic acid (siNA) molecules comprising modified nucleotides and uses thereof. The siNA molecules may be double stranded and comprise modified nucleotides selected from 2′-O-methyl nucleotides and 2′-fluoro nucleotides. Further disclosed herein are siNA molecules comprising (a) a phosphorylation blocker, conjugated moiety, or 5′-stabilized end cap; and (b) a short interfering nucleic acid (siNA).

  本文披露了包含修饰核苷酸的短干扰核酸（siNA）分子及其用途。siNA分子可以是双链的，并包括从2'-O-甲基核苷酸和2'-氟核苷酸中选择的修饰核苷酸。本文还披露了包含（a）磷酸化阻断剂、共轭基团或5'-稳定端盖；以及（b）短干扰核酸（siNA）的siNA分子。
• [EN] ALTERNATIVE NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF<br/>[FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE ALTERNATIVES ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：MODERNA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2015196130A3

  公开（公告）日：2016-03-03