基于片段的药物发现 (F
BDD) 最近的成功与适当的库设计密不可分。为了指导片段库的设计,我们在开源 KNIME 软件中构建了一个自动化工作流程。该工作流程考虑了片段的
化学多样性和新颖性,还可以考虑三维 (3D) 特征。该设计工具可用于创建大型和多样化的库,也可用于选择少量代表性化合物作为一组集中的独特筛选化合物,以丰富现有的片段库。为了说明这些程序,报告了基于
环丙烷脚手架的 10 成员重点库的设计和合成,这在我们现有的片段筛选库中代表性不足。对重点化合物集的分析表明显着的形状多样性和有利的整体物理
化学特征。凭借其模块化设置,可以轻松调整工作流程以设计专注于 3D 形状以外的属性的库。