作者:Tom Dekker、Mathilde A. C. H. Janssen、Christina Sutherland、Rene W. M. Aben、Hans W. Scheeren、Daniel Blanco-Ania、Floris P. J. T. Rutjes、Maikel Wijtmans、Iwan J. P. de Esch
DOI:10.1021/acsmedchemlett.2c00503
日期:2023.5.11
inextricably linked to adequate library design. To guide the design of our fragment libraries, we have constructed an automated workflow in the open-source KNIME software. The workflow considers chemical diversity and novelty of the fragments, and can also take into account the three-dimensional (3D) character. This design tool can be used to create large and diverse libraries but also to select a small
基于片段的药物发现 (FBDD) 最近的成功与适当的库设计密不可分。为了指导片段库的设计,我们在开源 KNIME 软件中构建了一个自动化工作流程。该工作流程考虑了片段的化学多样性和新颖性,还可以考虑三维 (3D) 特征。该设计工具可用于创建大型和多样化的库,也可用于选择少量代表性化合物作为一组集中的独特筛选化合物,以丰富现有的片段库。为了说明这些程序,报告了基于环丙烷脚手架的 10 成员重点库的设计和合成,这在我们现有的片段筛选库中代表性不足。对重点化合物集的分析表明显着的形状多样性和有利的整体物理化学特征。凭借其模块化设置,可以轻松调整工作流程以设计专注于 3D 形状以外的属性的库。