5’-amino-5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-8-bromoadenosine | 1383468-07-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 5’-amino-5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-8-bromoadenosine
• 英文别名: 9-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(aminomethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-8-bromopurin-6-amine
• CAS: 1383468-07-2
• 化学式: C₁₃H₁₇BrN₆O₃
• 分子量: 385.22
• InChiKey: CSOXNIJEPMJKRX-IOSLPCCCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  123
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5’-amino-5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-8-bromoadenosine 在 四丁基氟化铵 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 sodium hydride 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 2-[6-amino-9-[(2R,3R,4S,5R)-5-[(dimethylsulfamoylamino)methyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]purin-8-yl]sulfanyl-N-[2-(3,4-dichlorophenyl)ethyl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  8-硫代烷基腺苷衍生物通过新型结合方式抑制单核细胞增生李斯特菌NAD激酶

  摘要：

  病原体对现有抗生素的抗药性增强，因此有必要寻找新的靶标来开发有效的抗菌剂。已经提出了对细菌生长很重要的几种辅因子的生物合成途径，例如烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸酯（NADP），是有希望的抗生素靶标来源。烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶（NADK； EC 2.7.1.23）对于抑制剂的开发具有吸引力，因为它们催化NAD磷酸化为NADP，这是NADP代谢的重要步骤。我们以前合成了能抑制两种人类病原体单核细胞增生性李斯特菌和金黄色葡萄球菌的NADK的腺苷衍生物。，在微摩尔范围内。它们表现为NAD模拟物，其中的5'，5'-二磷酸基团被8,5'巯基乙醇酸桥取代。为了提高抑制能力，我们基于单个腺苷部分设计了新的NAD模拟物，该腺苷部分具有较大的衍生化基团，并连接到C8位置，而小组基团位于5'位置。在这里，我们报告一系列含有各种芳基和杂芳基部分的一系列8-硫代烷基-腺苷衍生物的合成及其作为单核细胞增生李斯特菌NAD

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2016.10.033
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(苄基磺酰基)-2',3'-O-异亚丙基腺苷 在 吡啶 、 ammonium hydroxide 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium azide 、 三苯基膦 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5’-amino-5’-deoxy-2’,3’-O-isopropylidene-8-bromoadenosine
  参考文献：
  名称：

  [EN] NOVEL ANTIBACTERIAL COMPOUNDS
  [FR] NOUVEAUX COMPOSÉS ANTIBACTÉRIENS

  摘要：

  本发明涉及以下化合物的公式(I)：其中R1、R2、R3、R4、X1、X2、X3和Z的定义如权利要求1所述。这些化合物在预防和/或治疗细菌感染方面具有用途。

  公开号：

  WO2012090136A1

文献信息

• NOVEL ANTIBACTERIAL COMPOUNDS
  申请人：Pochet Sylvie

  公开号：US20130331351A1

  公开（公告）日：2013-12-12

  The present invention relates to compounds of formula (I): wherein Rj, R2, R3, R4, Xi, X2, X3 and Z are as defined in claim 1 . The compounds are useful in the prevention and/or treatment of bacterial infections.

  本发明涉及公式（I）的化合物：其中Rj，R2，R3，R4，Xi，X2，X3和Z如权利要求1所定义。该化合物对于预防和/或治疗细菌感染有用。
• Synthesis and structure-activity relationship studies of original cyclic diadenosine derivatives as nanomolar inhibitors of NAD kinase from pathogenic bacteria
  作者：David A. Clément、Muriel Gelin、Clarisse Leseigneur、Valérie Huteau、Lou Mondange、Jean-Luc Pons、Olivier Dussurget、Corinne Lionne、Gilles Labesse、Sylvie Pochet

  DOI：10.1016/j.ejmech.2022.114941

  日期：2023.1

  kinases (NAD kinases) are essential and ubiquitous enzymes involved in the production of NADP(H) which is an essential cofactor in many metabolic pathways. Targeting NAD kinase (NADK), a rate limiting enzyme of NADP biosynthesis pathway, represents a new promising approach to treat bacterial infections. Previously, we have produced the first NADK inhibitor active against staphylococcal infection. From this

  烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶（NAD 激酶）是参与 NADP(H) 产生的必需且普遍存在的酶，NADP(H) 是许多代谢途径中的必需辅助因子。靶向 NAD 激酶 (NADK) 是一种 NADP 生物合成途径的限速酶，代表了一种治疗细菌感染的新方法。此前，我们已经生产出第一种对葡萄球菌感染具有活性的 NADK 抑制剂。从这种线性双腺苷衍生物，即 NKI1，我们设计了大环类似物。在这里，我们描述了原始系列环二腺苷衍生物的合成和评估，作为两种致病菌单核细胞增生李斯特菌和金黄色葡萄球菌的 NADK 抑制剂. 研究了两个腺苷单元之间连接的性质和长度，导致来自单核细胞增生李斯特氏菌的 NADK1 亚微摩尔抑制剂，包括迄今为止报道的最有效的体外抑制剂（与 NKI1 相比提高了 300 倍）。
• Design and synthesis of a library of C8-substituted sulfamidoadenosines to probe bacterial permeability
  作者：Okan Yildirim、Dipti Barman、Mia Chung、Samantha Stone、Raphael Geißen、Melissa L. Boby、Bradley S. Sherborne、Derek S. Tan

  DOI：10.1016/j.bmcl.2024.129844

  日期：2024.9

  Gram-negative bacteria pose a major challenge in antibiotic drug discovery because their cell envelope presents a permeability barrier that affords high intrinsic resistance to small-molecule drugs. The identification of correlations between chemical structure and Gram-negative permeability would thus enable development of predictive tools to facilitate antibiotic discovery. Toward this end, have advanced

  革兰氏阴性细菌对抗生素药物的发现提出了重大挑战，因为它们的细胞包膜呈现出渗透性屏障，对小分子药物具有高度的内在耐药性。因此，识别化学结构和革兰氏阴性渗透性之间的相关性将有助于开发预测工具，以促进抗生素的发现。为此，我们提出了一种文库设计范例，其中使用统一的试剂组在不同的区域异构体位置对各种化学支架进行功能化。这种设计能够解耦支架、区域化学和取代基对这些分子的革兰氏阴性渗透性的影响。基于我们最近合成的 C2 取代的磺酰胺腺苷文库，我们现在开发了一种有效的合成路线，用于合成区域异构 C8 取代的同系物的类似文库。 C8 库对抗生素相关化学空间区域进行采样，该区域与 C2 库所处理的区域类似，但与类似取代的恶唑烷酮库采样的区域不同。在初步分析中测试了所选分子的积累情况，为将来对这些库进行全面比较评估奠定了基础。
• Screening and In Situ Synthesis Using Crystals of a NAD Kinase Lead to a Potent Antistaphylococcal Compound
  作者：Muriel Gelin、Guillaume Poncet-Montange、Liliane Assairi、Laurence Morellato、Valérie Huteau、Laurence Dugué、Olivier Dussurget、Sylvie Pochet、Gilles Labesse

  DOI：10.1016/j.str.2012.03.024

  日期：2012.6

  Making new ligands for a given protein by in situ ligation of building blocks (or fragments) is an attractive method. However, it suffers from inherent limitations, such as the limited number of available chemical reactions and the low information content of usual chemical library deconvolution. Here, we describe a focused screening of adenosine derivatives using X-ray crystallography. We discovered an unexpected and biocompatible chemical reactivity and have simultaneously identified the mode of binding of the resulting products. We observed that the NAD kinase from Listeria monocytogenes (LmNADK1) can promote amide formation between 5'-amino-5'-deoxyadenosine and carboxylic acid groups. This unexpected reactivity allowed us to bridge in situ two adenosine derivatives to fully occupy the active NAD site. This guided the design of a close analog showing micromolar inhibition of two human pathogenic NAD kinases and potent bactericidal activity against Staphylococcus aureus in vitro.
• US8927520B2
  申请人：——

  公开号：US8927520B2

  公开（公告）日：2015-01-06