trans-1-(adenin-9-yl)-2-hydroxycyclopentane

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: trans-1-(adenin-9-yl)-2-hydroxycyclopentane
• 英文别名: 9-(trans-2-hydroxycyclopentyl)adenine；(1R,2R)-2-(6-aminopurin-9-yl)cyclopentan-1-ol
• 化学式: C₁₀H₁₃N₅O
• 分子量: 219.246
• InChiKey: MHPNWYKTHPYOJP-RNFRBKRXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  89.8
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  trans-1-(adenin-9-yl)-2-hydroxycyclopentane 在 亚硝酸异戊酯 作用下， 以 溶剂黄146 为溶剂， 反应 144.0h， 以91%的产率得到9-((1R,2R)-2-Hydroxy-cyclopentyl)-1,9-dihydro-purin-6-one
  参考文献：
  名称：

  Carbocyclic Phosphonate-Based Nucleotide Analogs Related to PMEA. I. Racemic trans-Configured Derivatives

  摘要：

  报告了与9-(2-磷酸甲氧乙基)腺嘌呤（PMEA）相关的一种新型核苷酸类似物，即杂环碱基的外消旋trans-N-(2-磷酸甲氧基环烷基)衍生物。完全保护的腺嘌呤-（5）、次黄嘌呤-（7）、鸟嘌呤-（11）、胸腺嘧啶-（13）、尿嘧啶-（16）和胞嘧啶含有的（18）碳环核苷酸类似物的合成基于trans-2-羟基环烷基的N-保护核碱基衍生物（2、10、12、14、17）与二异丙基对甲苯磺酸酯酯基甲酸酯的反应。去保护这些化合物得到所述的核苷酸类似物。起始核苷衍生物通过不同保护或自由核碱基的环戊烯氧化物的亲核环氧烷裂解制备。

  DOI：

  10.1135/cccc19960313
• 作为产物：
  描述：

  1,2-环氧环戊烷 、 腺嘌呤 在 lithium hydride 作用下， 生成 trans-1-(adenin-9-yl)-2-hydroxycyclopentane
  参考文献：
  名称：

  2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷类似物的合成及其构效关系，它是锥虫糖体甘油醛-3-磷酸脱氢酶的选择性抑制剂。

  摘要：

  在继续进行旨在针对睡眠病的药物的基于结构的设计的项目时，合成并测试了2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（1）的类似物，并建立了抑制糖体的构效关系。 3-磷酸​​甘油醛脱氢酶（GAPDH）。最近使用人类酶和昏睡锥虫（Trypanosoma brucei）的NAD：GAPDH复合物设计了化合物1。为了利用寄生虫酶的Val 207来开发额外的疏水结构域，合成了几种新的2'-酰胺基-2'-脱氧腺苷。与1相比，其中一些显示出抑制活性的有趣改善。碳环或无环类似物显示出明显的活性损失，说明了典型（C-2' -endo）核糖部分的起皱。我们还描述了一对化合物的合成，该化合物结合了2-和8-取代的腺嘌呤部分对效能的有益作用与2'-酰胺基对选择性的有益作用。不幸的是，在两种情况下，IC50值都证明了这些组合修饰的不相容性。最后，在5'-脱氧腺苷上引入疏水的5'-氨基基团显着增强了对原生动物酶的抑制

  DOI：

  10.1021/jm00019a014

文献信息

• Synthesis and Structure-Activity Relationships of Analogs of 2'-Deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine, a Selective Inhibitor of Trypanosomal Glycosomal Glyceraldehyde-3-phosphate Dehydrogenase
  作者：Serge Van Calenbergh、Christophe L. M. J. Verlinde、Johanna Soenens、Andre De Bruyn、Mia Callens、Norbert M. Blaton、Oswald M. Peeters、Piet Herdewijn、Jef Rozenski、Wim G. J. Hol

  DOI：10.1021/jm00019a014

  日期：1995.9

  at the structure-based design of drugs against sleeping sickness, analogs of 2'-deoxy-2'-(3-methoxybenzamido)adenosine (1) were synthesized and tested to establish structure-activity relationships for inhibiting glycosomal glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH). Compound 1 was recently designed using the NAD:GAPDH complexes of the human enzyme and that of Trypanosoma brucei, the causative

  在继续进行旨在针对睡眠病的药物的基于结构的设计的项目时，合成并测试了2'-脱氧-2'-（3-甲氧基苯甲酰胺基）腺苷（1）的类似物，并建立了抑制糖体的构效关系。 3-磷酸​​甘油醛脱氢酶（GAPDH）。最近使用人类酶和昏睡锥虫（Trypanosoma brucei）的NAD：GAPDH复合物设计了化合物1。为了利用寄生虫酶的Val 207来开发额外的疏水结构域，合成了几种新的2'-酰胺基-2'-脱氧腺苷。与1相比，其中一些显示出抑制活性的有趣改善。碳环或无环类似物显示出明显的活性损失，说明了典型（C-2' -endo）核糖部分的起皱。我们还描述了一对化合物的合成，该化合物结合了2-和8-取代的腺嘌呤部分对效能的有益作用与2'-酰胺基对选择性的有益作用。不幸的是，在两种情况下，IC50值都证明了这些组合修饰的不相容性。最后，在5'-脱氧腺苷上引入疏水的5'-氨基基团显着增强了对原生动物酶的抑制
• Carbocyclic Phosphonate-Based Nucleotide Analogs Related to PMEA II. Racemic cis-Configured Derivatives
  作者：Radek Liboska、Milena Masojídková、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1135/cccc19960778

  日期：——

  Racemic N-(cis-2-phosphonomethoxycycloalkyl) derivatives of heterocyclic bases, a novel type of nucleotide analogs related to 9-(2-phosphonomethoxyethyl)adenine (PMEA), are reported. The synthesis of adenine- (6a, 6b), uracil- (6c) and cytosine- (6d) containing carbocyclic phosphonates is based on the reaction of cis-2-hydroxycycloalkyl derivatives of protected nucleobases with diisopropyl tosyloxymethanephosphonate. The starting purine-containing nucleoside analogs 5a-5f were prepared by the Mitsunobu reaction of protected nucleobases with trans-2-benzyloxycycloalkanols, whereas pyrimidine-containing nucleoside analogs 5g-5k were obtained by configurational inversion at C-2' of the corresponding 1-(trans-2-hydroxycycloalkyl)pyrimidines via ring opening of their 2,2'-anhydro derivatives.

  报道了一种新型的与9-(2-磷酸甲氧基乙基)腺嘌呤（PMEA）相关的核苷酸衍生物，即外消旋N-(顺式-2-磷酸甲氧基环烷基)杂环碱类衍生物。含嘌呤（6a、6b）、尿嘧啶（6c）和胞嘧啶（6d）的含碳环膦酸酯的合成基于保护核碱类顺式-2-羟基环烷基衍生物与二异丙基对甲苯磺酸氧甲基膦酸酯反应。起始嘌呤含核苷类似物5a-5f通过保护核碱类与顺式-2-苄氧基环烷醇进行三室部反应制备，而含嘧啶的核苷类似物5g-5k通过对应1-(顺式-2-羟基环烷基)嘧啶的2,2'-脱水衍生物环开合在其2'位构型反转获得。
• US3917837A
  申请人：——

  公开号：US3917837A

  公开（公告）日：1975-11-04
• Carbocyclic Phosphonate-Based Nucleotide Analogs Related to PMEA. I. Racemic trans-Configured Derivatives
  作者：Radek Liboska、Milena Masojídková、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1135/cccc19960313

  日期：——

  Racemic trans-N-(2-phosphonomethoxycycloalkyl) derivatives of heterocyclic bases, a novel type of nucleotide analogs related to 9-(2-phosphonomethoxyethyl)adenine (PMEA), are reported. The synthesis of fully protected adenine- (5), hypoxanthine- (7), guanine- (11), thymine- (13), uracil- (16) and cytosine-containing (18) carbocyclic nucleotide analogs is based on the reaction of trans-2-hydroxycycloalkyl derivatives of N-protected nucleobases (2, 10, 12, 14, 17) with diisopropyl tosyloxymethanephosphonate. Deprotection of these compounds afforded the title nucleotide analogs. The starting nucleoside derivatives have been prepared via nucleophilic oxirane ring opening of cycloalkene oxides with various protected or free nucleobases.

  报告了与9-(2-磷酸甲氧乙基)腺嘌呤（PMEA）相关的一种新型核苷酸类似物，即杂环碱基的外消旋trans-N-(2-磷酸甲氧基环烷基)衍生物。完全保护的腺嘌呤-（5）、次黄嘌呤-（7）、鸟嘌呤-（11）、胸腺嘧啶-（13）、尿嘧啶-（16）和胞嘧啶含有的（18）碳环核苷酸类似物的合成基于trans-2-羟基环烷基的N-保护核碱基衍生物（2、10、12、14、17）与二异丙基对甲苯磺酸酯酯基甲酸酯的反应。去保护这些化合物得到所述的核苷酸类似物。起始核苷衍生物通过不同保护或自由核碱基的环戊烯氧化物的亲核环氧烷裂解制备。