1-(ω-hydroxy-n-amyl)uracil | 2545-90-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(ω-hydroxy-n-amyl)uracil
• 英文别名: 1-(5'-hydroxypentyl)uracil；1-(5-hydroxypentyl)uracil；1-(5-hydroxy-pentyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione；1-(5-hydroxypentyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione；1-(5'-Hydroxypentyl)-uracil；1-(5-hydroxypentyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 2545-90-6
• 化学式: C₉H₁₄N₂O₃
• 分子量: 198.222
• InChiKey: BOOPRVFORVJUMY-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  78-80 °C
• 密度：
  1.205±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  69.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(ω-hydroxy-n-amyl)uracil 在 戴斯-马丁氧化剂 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.25h， 以77%的产率得到5-(uracil-1'-yl)pentanal
  参考文献：
  名称：

  迈向新的 MraY 抑制剂：尿嘧啶和 5-氨基-5-脱氧核糖基支架的丝氨酸模板

  摘要：

  细菌移位酶 MraY 是开发新抗生素的一个很好的目标，因为它无处不在，并且对细菌生长至关重要。这项工作的目标是合成这种酶的天然抑制剂的简化类似物，以研究这些抑制剂的尿苷部分在生物活性方面的基本特征。因此，目标对映体纯 N-(尿嘧啶基戊基)-β-DO-(5-氨基-5-脱氧核糖基)-L-丝氨酸的结构保留了尿嘧啶和通过丝氨酰模板连接的 5-氨基-5-脱氧核糖部分。该化合物的合成策略依赖于通过丝氨酸衍生物的还原胺化顺序进行的 O-糖基化和 N-烷基化。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200700527
• 作为产物：
  描述：

  戊烷-1,5-二醇苯甲酸酯 在 PS-PPh3 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 sodium methylate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 生成 1-(ω-hydroxy-n-amyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  无环核苷类似物可作为恶性疟原虫dUTPase的抑制剂。

  摘要：

  我们报告发现新型的基于尿嘧啶的无环化合物作为脱氧尿苷5'-三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）抑制剂的发现，脱氧尿苷5'-三磷酸核苷酸水解酶（dUTPase）参与核苷酸代谢，已被确定为抗疟药发展的有希望的目标。分析了针对恶性疟原虫dUTPase和完整寄生虫的化合物。在酶抑制和细胞测定之间观察到良好的相关性。鉴定出与先前报道的抑制剂相比，无环尿嘧啶衍生物显示出更大或更相似的效力，并且通常选择性提高。此处报道的针对恶性疟原虫酶的活性最高的化合物的K（i）为0.2 microM。分子模型研究为观察到的活动提供了很好的理由。初步的ADME研究表明，某些先导化合物是类药物分子。这些化合物是进一步研究恶性疟原虫dUTPase以开发急需的新型抗疟药的有用工具。

  DOI：

  10.1021/jm060126s

文献信息

• [EN] DUTPASE INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE DUTPASE
  申请人：MEDIVIR AB

  公开号：WO2005065689A1

  公开（公告）日：2005-07-21

  Deoxyuridine derivatives of the formula (I) where R1 is H or various substituents; D is -NHCO-, -CONH-, -0-, -C(=O)-, -CH=CH, -CΞC-, -NR5-; R4 is hydrogen or various substituents; R5 is H, C1-C4 alkyl, C1-C4 alkanoyl; E is Si or C; R6, R7 and R8 are independently selected from C1-C8 alkyl, C2-C8 alkenyl, C2-C8 alkynyl or a stable monocyclic, bicyclic or tricyclic ring system; G is -O-, -S-, -CHR10-, -C(=O)-; J is -CH2-, or when G is CHR10 may also be -O- or -NH-; R10 is H, F, -CH3, -CH2NH2, -CH2OH; -OH R11 is H, F, -CH3, -CH2 NH2, -CH2OH, CH(OH)CH3, CH(NH3)CH3; or R10 and R11 together define an olefinic bond, or together form a -CH2-group, thereby defining a cis or trans cyclopropyl group; have utility in the prophylaxis or treatment of protozoal diseases such as malaria.

  脱氧尿嘧啶衍生物的公式(I)，其中R1是H或不同的取代基；D是-NHCO-，-CONH-，-0-，-C(=O)-，-CH=CH，-CΞC-，-NR5-；R4是氢或不同的取代基；R5是H，C1-C4烷基，C1-C4烷酰基；E是Si或C；R6、R7和R8独立地选自C1-C8烷基，C2-C8烯基，C2-C8炔基或稳定的单环、双环或三环环系；G是-O-，-S-，-CHR10-，-C(=O)-；J是-CH2-，或者当G是CHR10时，也可以是-O-或-NH-；R10是H，F，-CH3，-CH2NH2，-CH2OH；-OH R11是H，F，-CH3，-CH2 NH2，-CH2OH，CH(OH)CH3，CH(NH3)CH3；或者R10和R11共同定义一个烯丙基键，或者共同形成一个-CH2-基团，从而定义一个顺式或反式环丙基基团；在预防或治疗疟疾等原虫性疾病方面具有用途。
• Search for a simpler synthetic model system for intramolecular 1,3-dipolar cycloaddition to the 5,6-double bond of a pyrimidine nucleoside
  作者：Tadashi Sasaki、Katsumaro Minamoto、Toshimichi Suzuki、Shunsuke Yamashita

  DOI：10.1016/0040-4020(80)80036-6

  日期：1980.1

  regiospecifically transformed to 1,2,3-triazole derivatives, 17,18 and 19. Heating 1-(4-azidobutyl)-5-bromouracil (20) yielded 3,9-tetramethylene-8-azaxanthine (22). 9 with NBA gave 1,06-tetramethylene-5-bromo-6-hydroxy-5,6-dihydrouracil (24) and the 5-brominated analog of 9 (25). The 4-functionalized butyl side chain proved to serve as a substitute for the 5'-functionalized sugar moiety in pyrimidine ribonucleosides

  为了寻找一个更简单的模型系统来研究核苷中的碱基和5'-官能化糖部分之间的分子内热反应，1-（3-叠氮基丙基）尿嘧啶（2），1-（4-叠氮基丁基）嘧啶（12和13）和1-（5- azidopentyl）尿嘧啶（14）通过合成相应的ω-苯甲酰氧基（6，7和8）和ω-羟基-嘧啶（9，10和11）。加热2得到1，N 6-三亚甲基-6-氨基尿嘧啶（4），同时加热12和13得到N。1 -C 6裂解的加成产物。分别为15和16。15是区域专一性转化为1,2,3-三唑衍生物，17，18和19。加热1-（4-叠氮丁基）-5-溴尿嘧啶（20），得到3,9-四亚甲基-8-氮杂黄嘌呤（22）。NBA的9产生1,0 6-四亚甲基-5-溴-6-羟基-5,6-二氢尿嘧啶（24）和9的5溴类似物（25）。事实证明4-官能化的丁基侧链可替代嘧啶核糖核苷中的5'-官能化的糖部分。
• Synthesis and biological evaluation of potential new inhibitors of the bacterial transferase MraY with a β-ketophosphonate structure
  作者：Nicolas Auberger、Rok Frlan、Bayan Al-Dabbagh、Ahmed Bouhss、Muriel Crouvoisier、Christine Gravier-Pelletier、Yves Le Merrer

  DOI：10.1039/c1ob06124k

  日期：——

  Stable analogs of bacterial transferase MraY substrate or product with a pyrophosphate surrogate in their structure are described. β-ketophosphonates were designed as pyrophosphate bioisosteres and were investigated as UDP-GlcNAc mimics. The developed strategy allows introduction of structural diversity at a late stage of the synthesis. The biological activity of the synthesized compounds was evaluated

  描述了细菌转移酶MraY底物或产物在结构上具有焦磷酸盐替代物的稳定类似物。β-酮膦酸酯被设计为焦磷酸盐生物等排体，并被研究为UDP-Glc N Ac模拟物。制定的策略允许在合成的后期引入结构多样性。在MraY酶上评估了合成化合物的生物活性。
• Synthesis of uracil nucleotide analogs with a modified, acyclic ribose moiety as P2Y2 receptor antagonists
  作者：Roland Sauer、Ali El-Tayeb、Marko Kaulich、Christa E. Müller

  DOI：10.1016/j.bmc.2009.05.062

  日期：2009.7

  diphosphate yielding the corresponding UTP analogs. Nucleoside analogs with an oxygen atom in the 2′-position, which are more similar to the natural ribosides, were synthesized from silylated uracil and trimethylsilyl iodide-treated 1,3-dioxolane, or 1,3-dioxane, respectively, and subsequently phosphorylated by standard procedures. The nucleotide analogs were investigated in a functional assay at NG108-15

  合成了一系列新的尿嘧啶核苷酸类似物（单磷酸酯，三磷酸酯和膦酸酯），其中核糖部分被无环链取代，包括支链或直链烷基或二烷基醚接头。通过用氢氧化钠处理将1-ω-溴代烷基尿嘧啶衍生物（2）转化为相应的醇，随后使用氯氧化磷进行磷酸化，然后水解以产生单磷酸盐，或通过与二磷酸盐偶联以形成三磷酸盐。2的反应用亚磷酸三乙酯处理，然后用三甲基甲硅烷基溴脱保护，得到ω-膦酰基烷基尿嘧啶衍生物。通过将这些产物转化为它们的咪唑化物并随后用二磷酸酯进行处理，可以将其进一步磷酸化，得到相应的UTP类似物。分别由甲硅烷基化的尿嘧啶和碘化三甲基甲硅烷基碘处理过的1,3-二氧戊环或1,3-二氧六环合成了2'位氧原子的核苷类似物，与天然核糖苷更相似。按照标准程序。在功能测定中对NG108-15细胞进行了核苷酸类似物的研究，NG108-15细胞是神经母细胞瘤×神经胶质瘤杂交细胞系，表达UTP和ATP激活的核苷酸受体亚型P2Y 2
• Dutpase Inhibitors
  申请人：Gilbert Ian

  公开号：US20080312183A1

  公开（公告）日：2008-12-18

  Deoxyuridine derivatives of the formula (I) where R 1 is H or various substituents; D is —NHCO—, —CONH—, - 0 -, —C(═O)—, —CH═CH, —C≡C—, —NR 5 —; R 4 is hydrogen or various substituents; R 5 is H, C 1 -C 4 alkyl, C 1 -C 4 alkanoyl; E is Si or C; R 6 , R 7 and R 8 are independently selected from C 1 -C 8 alkyl, C 2 -C 8 alkenyl, C 2 -C 8 alkynyl or a stable monocyclic, bicyclic or tricyclic ring system; G is —O—, —S—, —CHR 10 —, —C(═O)—; J is —CH 2 —, or when G is CHR 10 may also be —O— or —NH—; R 10 is H, F, —CH 3 , —CH 2 NH 2 , —CH 2 OH; —OHR 11 is H, F, —CH 3 , —CH 2 NH 2 , —CH 2 OH, —CH(OH)CH 3 , CH(NH 3 )CH 3 ; or R 10 and R 11 together define an olefinic bond, or together form a —CH 2 -group, thereby defining a cis or trans cyclopropyl group; have utility in the prophylaxis or treatment of protozoal diseases such as malaria.

  化合物的脱氧尿嘧啶衍生物式（I），其中R1为H或各种取代基; D为—NHCO—，—CONH—，-0-，—C（═O）—，—CH═CH，—C≡C—，—NR5—; R4为氢或各种取代基; R5为H，C1-C4烷基，C1-C4烷酰基; E为Si或C; R6，R7和R8分别选自C1-C8烷基，C2-C8烯基，C2-C8炔基或稳定的单环，双环或三环环系统; G为—O—，—S—，—CHR10—，—C（═O）—; J为—CH2—，或当G为CHR10时也可以是—O—或—NH—; R10为H，F，—CH3，—CH2NH2，—CH2OH; —OHR11为H，F，—CH3，—CH2NH2，—CH2OH，—CH（OH）CH3，CH（NH3）CH3; 或R10和R11一起定义烯丙基键，或一起形成—CH2-基团，从而定义顺反环丙基基团; 在预防或治疗疟疾等原虫病方面具有用途。