cyclo(N^w-(N-methylcarbamoyl)-L-arginyl-N-methyl-L-phenylalanyl-β-L-aspartyl-β-L-aspartyl-D-alanyl) | 243975-37-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: cyclo(N^w-(N-methylcarbamoyl)-L-arginyl-N-methyl-L-phenylalanyl-β-L-aspartyl-β-L-aspartyl-D-alanyl)
• 英文别名: argifin；(2R,5S,8S,11S,15S)-5-[3-[[amino-(methylcarbamoylamino)methylidene]amino]propyl]-8-benzyl-2,7-dimethyl-3,6,9,13,17-pentaoxo-1,4,7,10,14-pentazacycloheptadecane-11,15-dicarboxylic acid
• CAS: 243975-37-3
• 化学式: C₂₉H₄₁N₉O₁₀
• 分子量: 675.699
• InChiKey: UHBHXSDKGLPPGO-HTDHLNIYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.49±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.9
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  291
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  11

安全信息

• 储存条件：
  储存温度应控制在2-8°C，需密封保存并保持干燥。

制备方法与用途

生物活性

Argifin 是一种由土壤微生物产生的次纳摩尔级别的几丁质酶（chitinase）抑制剂。其对粘质沙雷菌几丁质酶 A 和 B、烟曲霉几丁质酶 B1 和人壳三糖酶的 IC50 值分别为 0.025 μM、6.4 μM、1.1 μM 和 4.5 μM。

靶点

• IC50:
  • SmChiA: 0.025 μM
  • SmChiB: 6.4 μM
  • Aspergillus fumigatus chitinase B1: 1.1 μM
  • human chitotriosidase: 4.5 μM

体外研究

Argifin 在 37 ºC 时抑制 L. cuprina 几丁质酶的 IC50 值为 3.7 μM，在 20 ºC 时该值降至 0.10 μM。

体内研究

Argifin 能够抑制 L. cuprina 的蜕皮过程。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  芴甲氧羰基-L-天冬氨酸-1-叔丁酯 在 茴香硫醚 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 cyclo(N^w-(N-methylcarbamoyl)-L-arginyl-N-methyl-L-phenylalanyl-β-L-aspartyl-β-L-aspartyl-D-alanyl)
  参考文献：
  名称：

  有效的合成argifin：具有化学治疗潜力的天然产物几丁质酶抑制剂。

  摘要：

  环五肽家族18几丁质酶抑制剂argifin的首次合成是通过固相和溶液化学的结合来实现的。合成的argifin是烟曲霉的几丁质酶B1的纳摩尔抑制剂，与相同酶复合的合成材料的高分辨率X射线结构与以前从天然产物中获得的相同。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2005.07.068

文献信息

• Solution-phase total synthesis of the hydrophilic natural product argifin using 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyl tag
  作者：Tomoyasu Hirose、Takako Kasai、Takafumi Akimoto、Ayako Endo、Akihiro Sugawara、Kazuo Nagasawa、Kazuro Shiomi、Satoshi Ōmura、Toshiaki Sunazuka

  DOI：10.1016/j.tet.2011.05.073

  日期：2011.9

  solution-phase total synthesis of argifin using 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzyl tag as a hydrophobic protective group of carboxylic acid was developed to produce 44% overall yield for 16 linear steps. Argifin, a novel class of natural product chitinase inhibitor, is a highly water-soluble cyclic pentapeptide, so hitherto, only solid-phase synthesis techniques have been used to conveniently prepare the compound

  开发了使用3,4,5-三（十八烷基氧基）苄基标签作为羧酸的疏水性保护基的argifin溶液相全合成方法，在16个线性步骤中总收率为44％。Argifin是一类新型的天然产物几丁质酶抑制剂，是一种高度水溶性的环状五肽，因此，迄今为止，仅使用固相合成技术即可方便地制备该化合物及其衍生物。3,4,5-三（十八烷氧基）苄醇（HO-TAGa）及其酯是高度结晶的物质，具有很高的溶解度，可溶于二氯甲烷，苯，THF等极性较小的溶剂中，但不溶于极性溶剂例如甲醇和DMSO。HO-TAGa和基于Fmoc的肽合成相结合，并通过在MeOH溶液中重结晶进行简单纯化，
• Solid-phase synthesis of cyclic peptide chitinase inhibitors: SAR of the argifin scaffold
  作者：Mark J. Dixon、Amit Nathubhai、Ole A. Andersen、Daan M. F. van Aalten、Ian M. Eggleston

  DOI：10.1039/b815077j

  日期：——

  Asp residue to the solid support and assembly of the linear peptide chain by Fmoc SPPS prior to cyclisation and side-chain manipulation on-resin. Introduction of the key N-methyl carbamoyl-substituted Arg side chain is achieved viaderivatisation of a selectively protected Orn residue, prior to cleavage from the resin and side-chain deprotection. A severe aspartimide side-reaction observed upon final

  一种新型、高效、全固相合成精氨酸据报道，一种天然产物环状五肽几丁质酶抑制剂。该合成的特点是在树脂上进行环化和侧链操作之前，将正交保护的 ASP 残基附着到固体支持物上，并通过 Fmoc SPPS 组装线性肽链。在从树脂上裂解和侧链脱保护之前，通过选择性保护的 Orn 残基的衍生化来引入关键的N-甲基氨基甲酰基取代的 Arg 侧链。通过使用新型水性酸解程序，避免了最终脱保护时观察到的严重天冬酰亚胺副反应。通过一系列的制备证明了合成的灵活性精氨酸根据与代表性家族 18 几丁质酶复合的天然产物的 X 射线结构设计的类似物。
• Argifin; efficient solid phase total synthesis and evalution of analogues of acyclic peptide
  作者：Toshiaki Sunazuka、Akihiro Sugawara、Kanami Iguchi、Tomoyasu Hirose、Kenichiro Nagai、Yoshihiko Noguchi、Yoshifumi Saito、Tsuyoshi Yamamoto、Hideaki Ui、Hiroaki Gouda、Kazuro Shiomi、Takeshi Watanabe、Satoshi Ōmura

  DOI：10.1016/j.bmc.2009.02.047

  日期：2009.4

  An effective solid phase synthesis of Argifin, providing subsequent access to effective synthesis of analogues, was developed in 13% overall yield, as well as elucidating structure-activity relationships. The novel acyclic peptide 18b, prepared from a synthetic intermediate of Argifin, was found to be 70 times more potent as an inhibitor of Serratia marcescens chitinases B than Argifin itself (c) 2009 Elsevier Ltd. All rights reserved.