二核苷多
磷酸盐或二核苷酸(Np n N'; N,N'= A,U,G,C;n = 2-7)是天然存在的生理活性化合物。尽管对二核苷酸的兴趣以及它们的构象与其
生物学功能的相关性,但是对二核苷酸的构象的研究还不够充分。因此,在这里,我们通过各种NMR技术对一系列Np n N'Na +盐(N = A,G,U,C; N'= A,G,U,C;n = 2–5)进行了构象分析。。如NMR所示,除Up 4/5 U外,所有研究的二核苷酸均在
水溶液中形成分子内碱基堆积相互作用。Np n中糖苷角周围的构象发现N's是抗/高抗性,并且发现C4'-C5',C5'-O5'键周围的优选构象是gauche – gauche(gg)。Np n N's中的
核糖部分显示出对S构象的偏爱,但是当连接到
胞嘧啶时,
核糖环则优先选择N构象。然而,在任何二核苷酸中均未观察到
核糖部分的主要构象。Ap 2 A和Ap 4 A Na +盐的分子动力学模拟支持了实验结果。此外,针对Ap