in complex with an OF inducer, thereby obtaining the OF a priori with its subsequent use in designing potent and selective inhibitors. Fourteen co-crystal structures of TcDHODH with the designed inhibitors are presented herein. This approach has potential to encourage drug design against diseases where the molecular targets are such difficult proteins possessing small AS volume. This approach can be
许多药物靶标的开放形式 (OF) 结构是通过分析与
抑制剂的共晶后验获得的。因此,先验地获得药物靶标的OF结构将加速有效
抑制剂的开发。除了其小活性位点外,克氏锥虫二氢
乳清酸脱氢酶 (TcDHODH) 在其单体形式下功能齐全,这使得针对活性位点和蛋白质-蛋白质相互作用的药物设计方法变得不切实际。因此,开发了一种新的先验方法来确定 OF 中的 TcDHODH 活性位点。这种方法包括生成一个“OF 诱导剂”(在计算机中预测)来结合目标并导致空间排斥与靠近活性位点的柔性区域迫使它打开。我们通过预测和结晶 TcDHODH 与 OF 诱导剂的复合物,提供了该方法的第一个概念验证,从而先验地获得 OF,随后将其用于设计强效和选择性
抑制剂。本文介绍了 TcDHODH 与设计的
抑制剂的十四个共晶结构。这种方法有可能鼓励针对分子靶点是具有小 AS 体积的困难蛋白质的疾病进行药物设计。这种方法可以扩展到研究一般的