Investigation of the effect of different linker chemotypes on the inhibition of histone deacetylases (HDACs)
作者:Pasquale Linciano、Rosaria Benedetti、Luca Pinzi、Fabiana Russo、Ugo Chianese、Claudia Sorbi、Lucia Altucci、Giulio Rastelli、Livio Brasili、Silvia Franchini
DOI:10.1016/j.bioorg.2020.104462
日期:2021.1
chemists. HDACIs are composed of a cap group, a linker region, and a metal-binding group interacting with the catalytic zinc ion. While the cap group has been extensively investigated, less information is available about the effect of the linker on isoform selectivity. To this aim, in this work, we explored novel linker chemotypes to direct isoform selectivity. A small library of 25 hydroxamic acids
组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 是抗癌药物发现中最具吸引力和最有趣的目标之一。四种 FDA 批准的癌症治疗药物证明了 HDAC 抑制剂 (HDACIs) 的临床相关性。然而,这些药物的主要缺点之一在于缺乏对不同 HDAC 亚型的选择性,导致严重的副作用。因此,选择性 HDACIs 的鉴定对药物化学家来说是一个令人兴奋的挑战。HDACIs 由一个帽基、一个连接区和一个与催化锌离子相互作用的金属结合基团组成。虽然已经对帽基进行了广泛的研究,但关于接头对同种型选择性的影响的可用信息较少。为此,在这项工作中,我们探索了新的接头化学型来指导同工型选择性。制备了一个包含 25 种异羟肟酸的小型文库,其具有迄今为止尚未探索的接头化学型。体外测试表明,根据接头类型,一些候选物选择性抑制 HDAC1 而不是 HDAC6 同种型,反之亦然。进行对接计算以合理化新型接头化学型对生物活性的影响。此外,四种化合物能够增加组蛋白