N-tert-butyl-4-hydroxybutyramide | 471878-58-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: N-tert-butyl-4-hydroxybutyramide
• 英文别名: N-tert-butyl-4-hydroxybutanamide
• CAS: 471878-58-7
• 化学式: C₈H₁₇NO₂
• 分子量: 159.228
• InChiKey: XFQWJXBNBIDUJF-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  73 °C
• 沸点：
  326.9±25.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.970±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  49.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-tert-butyl-4-hydroxybutyramide 在 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 、 苯 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 N⁴-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(N,N-diisopropylamino)[3-(N-tert-butylaminocarbonyl)-1-propyloxy]phosphinyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基是有吸引力的磷酸酯/硫代磷酸酯保护基，用于固相寡聚脱氧核糖核苷酸合成。

  摘要：

  在适用于固相寡核苷酸合成的各种磷酸酯/硫代磷酸酯保护基中，3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基是最方便的基团之一，因为可以根据需要在热解下容易地将其除去。 pH中性条件。脱保护反应通过涉及酰胺功能的分子内环脱酯反应迅速进行（t（1/2）约100 s），并以2-（叔丁基亚氨基）四氢呋喃盐形式释放出磷酸/硫代磷酸酯基。使用廉价的原料将3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基结合到脱氧核糖核苷亚磷酰胺1a-d中。1a-d在d（ATCCGTAGCTAAGGTCATGC）及其硫代磷酸酯类似物的固相合成中的偶联效率与市售的2-氰基乙基脱氧核糖核苷亚磷酰胺相当。将这些寡核苷酸在磷酸盐缓冲盐水（PBS缓冲液，pH 7.2）中于90摄氏度加热30分钟后，将其磷酸盐/硫代磷酸盐去保护。由于没有可检测到的核碱基修饰或明显的硫代磷酸酯脱硫发生，因此3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基代表了2-氰乙基对于大规模制备治疗性寡核苷酸的有吸引力的替代方案。

  DOI：

  10.1021/jo0258608
• 作为产物：
  描述：

  γ-丁内酯 、 叔丁胺 反应 72.0h， 以98%的产率得到N-tert-butyl-4-hydroxybutyramide
  参考文献：
  名称：

  3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基是有吸引力的磷酸酯/硫代磷酸酯保护基，用于固相寡聚脱氧核糖核苷酸合成。

  摘要：

  在适用于固相寡核苷酸合成的各种磷酸酯/硫代磷酸酯保护基中，3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基是最方便的基团之一，因为可以根据需要在热解下容易地将其除去。 pH中性条件。脱保护反应通过涉及酰胺功能的分子内环脱酯反应迅速进行（t（1/2）约100 s），并以2-（叔丁基亚氨基）四氢呋喃盐形式释放出磷酸/硫代磷酸酯基。使用廉价的原料将3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基结合到脱氧核糖核苷亚磷酰胺1a-d中。1a-d在d（ATCCGTAGCTAAGGTCATGC）及其硫代磷酸酯类似物的固相合成中的偶联效率与市售的2-氰基乙基脱氧核糖核苷亚磷酰胺相当。将这些寡核苷酸在磷酸盐缓冲盐水（PBS缓冲液，pH 7.2）中于90摄氏度加热30分钟后，将其磷酸盐/硫代磷酸盐去保护。由于没有可检测到的核碱基修饰或明显的硫代磷酸酯脱硫发生，因此3-（N-叔丁基甲酰胺基）-1-丙基代表了2-氰乙基对于大规模制备治疗性寡核苷酸的有吸引力的替代方案。

  DOI：

  10.1021/jo0258608

文献信息

• A Mild and Facile Synthesis of Cyclic Imides using Pyridinium Chlorochromate
  作者：Yanyan Yang、Ge Wang、Xiaohui Cao、Xilong Yan、Ligong Chen

  DOI：10.3184/174751911x13202290249578

  日期：2011.11

  A mild and facile synthetic method of cyclic imides is presented. These compounds are widely used in the synthesis of novel medical, polymeric, photonic and electronic materials. Compared with traditional syntheses, the method reported has several advantages including mild conditions, simplified work-up and low cost.

  本文介绍了一种温和、简便的环状亚胺合成方法。这些化合物被广泛用于合成新型医用、聚合、光子和电子材料。与传统合成方法相比，该方法具有条件温和、操作简单和成本低廉等优点。
• Thermolabile phosphorus protecting groups, associated intermediates and methods of use
  申请人：——

  公开号：US20010044529A1

  公开（公告）日：2001-11-22

  The invention provides a method of thermally deprotecting the internucleosidic phosphorus linkage of an oligonucleotide, which method comprises heating in a fluid medium at a substantially neutral pH. The preferred protecting group is of the formula: 1 wherein R 1 is H, R 1a , OR 1a , SR 1a or NR 1a R 1a′ , wherein R 1a and R 1a′ independently represent H, alkyl, alkenyl, alkynyl, cycloalkyl, aryl, or aralkyl substituents. Alternatively, NR 1a R 1a′ represents a heterocycle. X is O or S. Z is O, S, NR 2a , CR 2a R 2a′ or CR 2a R 2a′ CR 2b R 2b′ wherein R 2a , R 2a′ , R 2b and R 2b′ independently represent H, alkyl, alkenyl, alkynyl, cycloalkyl, aryl, or aralkyl substituents. Alternatively, R 1a or R 1a′ , in combination with any of R 2a , R 2a′ , R 2b or R 2b′ , together with C═X can comprise a ring. R 2 , R 2′ , R 3 and R 3′ each represent H, alkyl, alkenyl, alkynyl, cycloalkyl, aryl, or aralkyl substituents. Alternatively, R 2 or R 2′ , in combination with R 3 or R 3′ , together with the carbons to which they are bonded, comprise a benzo-fused bicyclic ring. The foregoing substituents can be unsubstituted or substituted. The present invention further provides a method of synthesizing an oligonucleotide using the thermal deprotection method described above, and novel oligonucleotides and intermediates that incorporate the thermolabile protecting group used in accordance with the present invention.

  该发明提供了一种热解保护核苷酸寡聚物中核苷酸间磷酸酯连接的方法，该方法包括在基本中性pH值下在流体介质中加热。首选的保护基的化学式如下：其中R1为H，R1a，OR1a，SR1a或NR1aR1a′，其中R1a和R1a′独立表示H，烷基，烯烃基，炔烃基，环烷基，芳基或芳基烷基取代基。另外，NR1aR1a′表示杂环。X为O或S。Z为O，S，NR2a，CR2aR2a′或CR2aR2a′CR2bR2b′，其中R2a，R2a′，R2b和R2b′独立表示H，烷基，烯烃基，炔烃基，环烷基，芳基或芳基烷基取代基。另外，R1a或R1a′，与R2a，R2a′，R2b或R2b′中的任何一个结合，连同C═X可以构成一个环。R2，R2′，R3和R3′各自表示H，烷基，烯烃基，炔烃基，环烷基，芳基或芳基烷基取代基。另外，R2或R2′，与R3或R3′结合，连同它们结合的碳原子，构成一个苯并螺环。上述取代基可以是未取代或取代的。本发明还提供了一种使用上述热解保护方法合成寡核苷酸的方法，以及根据本发明采用的热敏保护基的新型寡核苷酸和中间体。
• Identification of a Common Pharmacophore for Binding to MMP2 and RGD Integrin: Towards a Multitarget Approach to Inhibit Cancer Angiogenesis and Metastasis
  作者：Lorenzo Baldini、Elena Lenci、Francesca Bianchini、Andrea Trabocchi

  DOI：10.3390/molecules27041249

  日期：——

  During tumor angiogenesis different growth factors, cytokines and other molecules interact closely with each other to facilitate tumor cell invasion and metastatic diffusion. The most intensively studied as molecular targets in anti-angiogenic therapies are vascular endothelial growth factor (VEGF) and related receptors, integrin receptors and matrix metalloproteinases (MMPs). Considering the poor efficacy of cancer angiogenesis monotherapies, we reasoned combining the inhibition of αvβ3 and MMP2 as a multitarget approach to deliver a synergistic blockade of tumor cell migration, invasion and metastasis. Accordingly, we identified a common pharmacophore in the binding cavity of MMP2 and αvβ3, demonstrating such approach with the design, synthesis and bioassays of tyrosine-derived peptidomimetics carrying the necessary functional groups to bind to key pharmacophoric elements of MMP2 and αvβ3 RGD integrin.

  在肿瘤血管生成过程中，不同的生长因子、细胞因子和其他分子密切相互作用，以促进肿瘤细胞的侵袭和转移扩散。在抗血管生成疗法中，作为分子靶点最深入研究的是血管内皮生长因子（VEGF）及其相关受体、整合素受体和基质金属蛋白酶（MMPs）。考虑到单一抗癌血管生成疗法的疗效较差，我们认为将αvβ3和MMP2的抑制结合起来作为一种多靶点方法，可以提供对肿瘤细胞迁移、侵袭和转移的协同阻断。因此，我们在MMP2和αvβ3的结合腔中发现了一个共同的药效团，通过设计、合成和生物测定携带必要功能基团的酪氨酸衍生肽类似物，以结合MMP2和αvβ3 RGD整合素的关键药效元素。
• The 2-(<i>N-</i>Formyl-<i>N-</i>methyl)aminoethyl Group as a Potential Phosphate/Thiophosphate Protecting Group in Solid-Phase Oligodeoxyribonucleotide Synthesis
  作者：Andrzej Grajkowski、Andrzej Wilk、Marcin K. Chmielewski、Lawrence R. Phillips、Serge L. Beaucage

  DOI：10.1021/ol0156852

  日期：2001.5.1

  [GRAPHICS]The 2-(N-formyl-N-methyl)aminoethyl deoxyribonucleoside phosphoramidite 1 has been synthesized and used in the solid-phase synthesis of an octadecathymidylic acid as a cost-efficient monomer for potential application in the preparation of therapeutic oligonucleotides, The 2-(N-formyl-N-methyl)aminoethyl group can be cleaved from oligonucleotides according to a unique thermolytic cyclodeesterification process at pH 7.0. In addition to being cost-effective, the use of 1 simplifies oligonucleotide postsynthesis processing by eliminating the utilization of concentrated ammonium hydroxide in oligonucleotide deprotection.
• CHEMICALLY MODIFIED OLIGONUCLEOTIDE PRIMERS FOR NUCLEIC ACID AMPLIFICATION
  申请人：TriLink BioTechnologies

  公开号：EP2032714B1

  公开（公告）日：2011-03-16