作者:Immo Burkhardt、Lukas Lauterbach、Nelson L. Brock、Jeroen S. Dickschat
DOI:10.1039/c7ob00913e
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Dimethylsulfoniopropionate (DMSP) catabolism of marine bacteria plays an important role in marine and global ecology. The genome of Ruegeria pomeroyi DSS-3, a model organism from the Roseobacter group, harbours no less than three genes for different DMSP lyases (DddW, DddP and DddQ) that catalyse the degradation of DMSP to dimethyl sulfide (DMS) and acrylate. Despite their apparent similar function
海洋细菌二甲基磺化丙酸酯(DMSP)分解代谢在海洋和全球生态中起着重要作用。卢氏菌群模型动物Ruegeria pomeroyi DSS-3的基因组中含有不少于三个不同DMSP裂解酶(DddW,DddP和DddQ)的基因,这些酶催化DMSP降解为二甲基硫醚(DMS)和丙烯酸酯。尽管它们具有明显的相似功能,但这些酶没有显示出明显的整体序列同一性。在这项工作中,来自R. pomeroyi的DddQ和DddW和来自Phieobacter inhibens的DddP同源物对DSM 17395进行了功能表征,并使用几种合成的DMSP类似物测试了其底物范围。对比动力学分析揭示了DMSP及其类似物在选择性和总速度方面的转化差异,从而使人们对DMSP裂解酶的分子机制及其推测的生物学功能有了更多的了解。