4,4-difluoro-8-(thiophen-2-yl)-1,3,5,7-tetramethyl-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene | 1359876-93-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯
• 英文名称: 4,4-difluoro-8-(thiophen-2-yl)-1,3,5,7-tetramethyl-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene
• 英文别名: 5,5-difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-10-(thiophen-2-yl)-5H-4λ⁴,5λ⁴-dipyrrolo[1,2-c:2',1'-f][1,3,2]diazaborinine；5,5-Difluoro-1,3,7,9-tetramethyl-10-(2-thienyl)-5H-dipyrrolo[1,2-c:2 inverted exclamation mark,1 inverted exclamation mark-f][1,3,2]diazaborinin-4-ium-5-uide；2,2-difluoro-4,6,10,12-tetramethyl-8-thiophen-2-yl-3-aza-1-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaene
• CAS: 1359876-93-9
• 化学式: C₁₇H₁₇BF₂N₂S
• 分子量: 330.209
• InChiKey: WDRNQLYDRWGPMN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  36.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4,4-difluoro-8-(thiophen-2-yl)-1,3,5,7-tetramethyl-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene 在 乙基溴化镁 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 18.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  多种双染料制成的发光分子太阳能聚光器

  摘要：

  描述了由Bodipy支架组成的光敏阵列的合成。合成策略首先涉及功能化模块的构建，然后使用特定的Knoevenagel反应。需要进行硼保护以避免自凝结。噻吩基二联染料与苯基类似物的比较表明，它们化学稳定性较差，荧光性较弱。在多发色物种中，以最高能量单位吸收后会发生有效的级联能量转移。根据特定参考化合物的行为分析了混合染料的氧化还原活性。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2013.06.039
• 作为产物：
  描述：

  2,4-二甲基吡咯 在 三氟化硼乙醚 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 4,4-difluoro-8-(thiophen-2-yl)-1,3,5,7-tetramethyl-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene
  参考文献：
  名称：

  Synthesis, Photophysical Properties and Solvatochromism of Meso-Substituted Tetramethyl BODIPY Dyes

  摘要：

  4,4-二氟-4-硼-3a,4a-二氮-s-吲哚荧光染料（BODIPYs）首次合成于近50年前；然而，其技术应用的探索仅在过去20年中开始。这些染料具有有趣的光物理特性，因而对其作为荧光标记物和/或染料的应用产生了越来越大的兴趣。在此，我们报告了四甲基BODIPY及四种中间体取代染料（2-噻吩基、4-吡啶基、4-氟苯基和4-硝基苯基衍生物）的合成。对它们的光物理特性（吸收光谱、发射光谱、荧光量子产率和时间分辨荧光）以及溶剂色谱行为进行了研究。吸收和发射几乎不受取代基的影响，在取代染料中观察到稍高的斯托克斯位移。取代基与较短的荧光寿命和较低的量子产率相关联。观察到Catalán溶剂描述符与光物理参数之间的良好相关性。同时，溶剂极化率描述符（SP）与光物理参数之间的相关性更好。总体而言，仅观察到轻微的溶剂色谱现象。4-吡啶基衍生物在发射光谱波长方面表现出相对显著的溶剂色谱现象，在甲醇中观察到了红移的发射。4-硝基苯取代的BODIPY在己烷中的荧光量子产率约高出30倍，这可能对实际应用具有兴趣。

  DOI：

  10.1007/s10895-013-1293-8

文献信息

• Synthesis and Transformations of 5-Chloro-2,2′-Dipyrrins and Their Boron Complexes, 8-Chloro-BODIPYs
  作者：Haijun Wang、M. Graça H. Vicente、Frank R. Fronczek、Kevin M. Smith

  DOI：10.1002/chem.201304310

  日期：2014.4.22

  reacted with methoxide or ethoxide ions to produce monopyrrole esters, presumably via a 5,5‐dialkoxy‐dipyrromethane intermediate. In contrast, 8‐chloro‐BODIPYs underwent a variety of nucleophilic substitutions of the chloro group in the presence of alkoxide ions, Grignard reagents, and thiols. In the presence of excess alkoxide or Grignard reagent, at room temperature or above, substitution at the boron

  对称二吡咯酮1 a , b通过与硫光气反应，然后在碱性条件下氧化水解，由相应的无α吡咯分两步合成。二吡咯酮分别与光气或 Meerwein 盐反应生成相应的 5-氯-二吡啉盐或 5-乙氧基-二吡啉。双吡喃的硼络合以高产率提供了相应的 8 功能化 BODIPY（硼二吡咯亚甲基）。5-氯-二吡啉盐与甲醇盐或乙醇盐离子反应生成单吡咯酯，推测是通过 5,5-二烷氧基-二吡咯甲烷中间体。相比之下，8-氯-BODIPY 在醇盐离子、格氏试剂和硫醇的存在下经历了氯基团的各种亲核取代。在过量醇盐或格氏试剂存在下，在室温或更高温度下，硼中心的替代也发生了。8-氯-BODIPY 是一种特别有用的试剂，用于以非常高的产率制备 8-芳基-、8-烷基-和 8-乙烯基取代的 BODIPY，使用 Pd0催化的 Stille 交叉偶联反应。展示了 11 个 BODIPY 和两个吡咯的 X 射线结构，并讨论了合成的 BODIPY
• The inorganic DMSO/POCl₃ reaction with BODIPY: wide product formation and implications for biological ROS sensing and neurodegenerative disease research
  作者：Taehong Jun、Kibong Kim、Kang Mun Lee、Dhiraj P. Murale、Atul P. Singh、Amgalan Natsagdorj、Hyunjeong Liew、Yoo-Hun Suh、David G. Churchill

  DOI：10.1142/s1088424612501180

  日期：2012.11

  We report a refined and expanded synthetic study of 4,4-difluoro-1,3,5,7-tetramethyl-8-(aryl)-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene under treatment with POCl₃/DMSO. The 2-chloro-6-methylsulfide derivative (Kim TI, Park S, Choi Y and Kim Y. Chem. Asian J. 2011; 6: 1358-61.) was one of five co-eluants, including 2,6-disulfido and -dichloro species, and mono-substituted counterparts. The 8-meso tail group modifies product distribution. The different sulfur-containing products undergo different "off-on" responses with NaOCl (10 equiv.). Compounds 4b and 2b exhibit low toxicity and were found to enter juxtanuclear regions in neuroblastoma.

  我们报告了用 POCl3/DMSO 处理 4,4-二氟-1,3,5,7-四甲基-8-(芳基)-4-bora-3a,4a-diaza-s-茚的精制和扩展合成研究。2-chloro-6-methylsulfide 衍生物（Kim TI、Park S、Choi Y 和 Kim Y. Chem. Asian J. 2011; 6: 1358-61.）是五种共助剂之一，其中包括 2,6-二磺酸基和二氯化物以及单取代的对应物。8-meso 尾基改变了产物的分布。不同的含硫产物在 NaOCl（10 等量）的作用下会产生不同的 "关闭-开启 "反应。化合物 4b 和 2b 显示出较低的毒性，并能进入神经母细胞瘤的并核区域。
• Thiophene-linked tetramethylbodipy-labeled nucleotide for viscosity-sensitive oligonucleotide probes of hybridization and protein–DNA interactions
  作者：Pedro Güixens-Gallardo、Jana Humpolickova、Sebastian Paul Miclea、Radek Pohl、Tomáš Kraus、Piotr Jurkiewicz、Martin Hof、Michal Hocek

  DOI：10.1039/c9ob02634g

  日期：——

  labeled oligonucleotides (ONs) or DNA by primer extension. The labeled single-stranded ONs showed a significant decrease in mean fluorescence lifetime when hybridized to the complementary strand of DNA or RNA and were also sensitive to mismatches. The labeled dsDNA sensed protein binding (p53), which resulted in the increase of its fluorescence lifetime. The triphosphate dCTBdpTP was transported to live

  设计并合成了胞嘧啶2'-脱氧核糖核苷dCTBdp及其三磷酸（dCTBdpTP），其在位置5处带有四甲基化的噻吩-二联荧光团。绿色荧光核苷dCTBdp显示出荧光寿命与粘度的完美关系。修饰的三磷酸dCTBdpTP是几种DNA聚合酶的底物，并用于通过引物延伸的体外酶促合成标记寡核苷酸（ON）或DNA。标记的单链ONs与DNA或RNA的互补链杂交时，平均荧光寿命显着降低，并且对错配也敏感。标记的dsDNA感知到蛋白结合（p53），从而延长了其荧光寿命。
• Thiocyanation of BODIPY dyes and their conversion to thioalkylated derivatives
  作者：Lucas Cunha Dias de Rezende、Shaiani Maria Gil de Melo、Stijn Boodts、Bram Verbelen、Wim Dehaen、Flavio da Silva Emery

  DOI：10.1039/c5ob00499c

  日期：——

  Thiocyanation and formation of thioalkylated BODIPYs is a simple and reliable way for their chemical modification and photophysical tuning.

  硫氰化反应和硫代烷基化反应是一种简单可靠的方法，用于对BODIPY分子进行化学修饰和光物理调控。
• Microwave-assisted direct synthesis of BODIPY dyes and derivatives
  作者：Ana Da Lama、José Pérez Sestelo、Luis A. Sarandeses、M. Montserrat Martínez

  DOI：10.1039/d2ob01349e

  日期：——

  A microwave-assisted one-pot synthesis of BODIPY dyes from pyrroles and acyl chlorides is reported. This protocol features short reaction times, low temperatures, minimum amount of solvent, scalability, versatility, and good yields of the products. These simple, efficient and sustainable conditions can be also applied to the synthesis of derivatives such as BOPHY, BOAHY and BOPAHY.

  报道了从吡咯和酰氯中微波辅助一锅法合成 BODIPY 染料。该协议具有反应时间短、温度低、溶剂用量最少、可扩展性、多功能性和产品收率高的特点。这些简单、高效和可持续的条件也可以应用于BOPHY、BOAHY和BOPAHY等衍生物的合成。