N-(2-oxoindolin-5-yl)-3-(piperidin-1-yl)propanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(2-oxoindolin-5-yl)-3-(piperidin-1-yl)propanamide
• 英文别名: N-(2-oxo-1,3-dihydroindol-5-yl)-3-piperidin-1-ylpropanamide
• 化学式: C₁₆H₂₁N₃O₂
• 分子量: 287.362
• InChiKey: ZQKOAGVHVAFCIF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  61.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-吲哚甲醛 、 N-(2-oxoindolin-5-yl)-3-(piperidin-1-yl)propanamide 在 哌啶 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 12.0h， 以71%的产率得到N-(3-((1H-indol-3-yl)methylene)-2-oxoindolin-5-yl)-3-(piperidin-1-yl)propanamide
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和生物学评估2-吲哚酮衍生物作为MDA-MB-231细胞中的PAK1抑制剂。

  摘要：

  P21活化激酶1（PAK1）在癌细胞的增殖，存活和迁移中起着至关重要的作用，而癌细胞已成为一种有希望的癌症治疗靶标。在这项研究中，通过基于结构的策略设计和合成了一系列2-吲哚酮衍生物。发现了一种有效的PAK1抑制剂（ZMF-005），它对具有有效抗增殖活性的PAK1的IC 50值为0.22μM。此外，我们通过分子对接和动态（MD）模拟预测了ZMF-005和PAK1的结合模式。另外，据报道ZMF-005在MDA-MB-231细胞中诱导明显的凋亡并抑制迁移。这些发现共同表明ZMF-005 是用于乳腺癌治疗的新型有效PAK1抑制剂。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2020.127355
• 作为产物：
  描述：

  5-硝基-1,3-二氢-2H-吲哚-2-酮 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 、 potassium iodide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.5h， 生成 N-(2-oxoindolin-5-yl)-3-(piperidin-1-yl)propanamide
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和生物学评估2-吲哚酮衍生物作为MDA-MB-231细胞中的PAK1抑制剂。

  摘要：

  P21活化激酶1（PAK1）在癌细胞的增殖，存活和迁移中起着至关重要的作用，而癌细胞已成为一种有希望的癌症治疗靶标。在这项研究中，通过基于结构的策略设计和合成了一系列2-吲哚酮衍生物。发现了一种有效的PAK1抑制剂（ZMF-005），它对具有有效抗增殖活性的PAK1的IC 50值为0.22μM。此外，我们通过分子对接和动态（MD）模拟预测了ZMF-005和PAK1的结合模式。另外，据报道ZMF-005在MDA-MB-231细胞中诱导明显的凋亡并抑制迁移。这些发现共同表明ZMF-005 是用于乳腺癌治疗的新型有效PAK1抑制剂。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2020.127355

文献信息

• Discovery of hybrids of indolin-2-one and nitroimidazole as potent inhibitors against drug-resistant bacteria
  作者：Yuanzheng Zhou、Yuan Ju、Yang Yang、Zitai Sang、Zhenling Wang、Gu He、Tao Yang、Youfu Luo

  DOI：10.1038/s41429-018-0076-5

  日期：2018.10

  With antibiotics resistance developing rapidly, new antibacterial agents are needed to be discovered. We readily synthesized 11 indolin-2-one compounds and found a hybrid of indolin-2-one and nitroimidazole 3-((1-methyl-5-nitro-1H-imidazol-2-yl)methylene)indolin-2-one to be effective on Staphylococcus aureus strains. Six derivatives of this compound were further designed and synthesized in order to enhance its efficacy. After a second turn of structural refinement, a novel hybrid of indolin-2-one and nitroimidazole 3-((1-methyl-5-nitro-1H-imidazol-2-yl)methylene)-5-nitroindolin-2-one with a nitro group on C-5 position of indolin-2-one was shown to exhibit remarkable antibacterial activities with a low MIC value against MRSA ATCC 33591. Besides, this molecule demonstrated its potency on Gram-negative bacteria and VRE strain. The time-killing curve experiment showed its good bactericidal activity. Low hemolytic rate suggested its promising safety profile.

  随着抗生素耐药性迅速发展，需要发现新的抗菌剂。我们合成了11种吲哚啉-2-酮化合物，并发现一种吲哚啉-2-酮和硝基咪唑的杂合物3-((1-甲基-5-硝基-1H-咪唑-2-基)亚甲基)吲哚啉-2-酮对金黄色葡萄球菌菌株效果显著。为了提高其疗效，我们进一步设计和合成了该化合物的六种衍生物。在经过第二轮结构优化后，一种新型的吲哚啉-2-酮与硝基咪唑的杂合物3-((1-甲基-5-硝基-1H-咪唑-2-基)亚甲基)-5-硝基吲哚啉-2-酮在吲哚啉-2-酮的C-5位置上带有一个硝基，显示出对MRSA ATCC 33591显著的抗菌活性，表明MIC值较低。此外，该分子在革兰氏阴性菌和耐万古霉素菌株中也表现出活性。时间杀菌曲线实验显示其良好的杀菌活性。低溶血率表明其具有良好的安全性。
• Structure–activity relationship study of DEL-22379: ERK dimerization inhibitors with increased safety
  作者：Yang Yang、Yuanzheng Zhou、Lei Tao、Tao Yang、Yinglan Zhao、Youfu Luo

  DOI：10.1007/s11030-020-10088-0

  日期：2021.5

  impeded by the emergence of drug resistance due to reactivation of ERK signaling. Compound DEL-22379 has been reported to inhibit ERK dimerization which was unaffected by drug-resistant mechanism reactivating the ERK signaling. Here, we discussed a structure-activity relationship study of DEL-22379. Forty-seven analogues were designed and synthesized. Each synthesized compound was biologically evaluated

  ERK 信号通路的异常激活通常会导致肿瘤发生，而靶向该通路的小分子药物会因 ERK 信号通路的重新激活而出现耐药性。据报道，化合物 DEL-22379 可抑制 ERK 二聚化，其不受重新激活 ERK 信号传导的耐药机制的影响。在这里，我们讨论了 DEL-22379 的构效关系研究。设计并合成了 47 个类似物。对每种合成的化合物对几种肿瘤细胞系的抑制率进行生物学评估，并进一步评估具有高抑制率的化合物的 IC50 值。讨论了idolin-2-one支架的构效关系和Z/E构型对效力的影响。
• 2-吲哚酮类PAK1抑制剂及其在抗肿瘤治疗药物中的应用
  申请人：深圳技术大学

  公开号：CN111675647B

  公开（公告）日：2022-03-01

  本发明涉及2‑吲哚酮类PAK1抑制剂及其在抗肿瘤治疗药物中的应用，属于抗肿瘤药学技术领域。本发明解决的技术问题是提供一种作为PAK1抑制剂的化合物。该化合物包括如下所示的化合物或其药学上可接受的盐，其中X、n、R1如权利要求和说明书所述。本发明的化合物或其药学上可接受的盐，可以作为PAK1抑制剂，用于制备抗肿瘤药物。
• A Novel Small Molecule, ZY354, Inhibits Dental Caries-Associated Oral Biofilms
  作者：Chenzi Zhang、Xinyi Kuang、Yuanzheng Zhou、Xian Peng、Qiang Guo、Tao Yang、Xuedong Zhou、Youfu Luo、Xin Xu

  DOI：10.1128/aac.02414-18

  日期：2019.5

  Biofilm control is a critical approach to the better management of dental caries. Antimicrobial small molecules have shown their potential in the disruption of oral biofilm and control of dental caries.

  生物膜控制是更好地治疗龋齿的关键方法。抗菌小分子在破坏口腔生物膜和控制龋齿方面已显示出其潜力。