分裂内含肽在现代蛋白质半合成技术中发挥着重要作用。这些天然存在的蛋白质剪接域可用于体外和体内蛋白质修饰、肽和蛋白质环化、片段同位素标记以及
生物传感器的构建。最充分表征的分裂内含肽家族,蓝藻 DnaE 内含肽,显示出特别的前景,因为其中许多可以在不到 1 分钟的时间内剪接蛋白质。尽管如此,这些内含肽的活性是依赖于上下文的:围绕它们的连接点(称为局部 N-和 C-外显子)的某些肽序列是强烈优选的,而其他序列会导致剪接动力学和产量的显着降低。这些序列约束限制了内含肽的效用,因此,需要更详细地了解它们参与蛋白质剪接。在这里,我们对 C-外显肽组成与内含肽分裂活性之间的关系进行了彻底的动力学分析。这些实验的结果用于指导结构和分子动力学研究,结果表明催化残基的运动受到第二个 C-外显肽残基的限制,可能迫使它们进入促进蛋白质快速剪接的活性构象。总之,我们的结构和功能研究还突出了内含肽结构的一个关键区域,