tubulysin V

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tubulysin V
• 英文别名: (2S,4R)-4-(2-((1R,3R)-1-hydroxy-4-methyl-3-((2S,3S)-3-methyl-2-((R)-1-methylpiperidine-2-carboxamido)pentanamido)pentyl)thiazole-4-carboxamido)-2-methyl-5-phenylpentanoic acid；(2S,4R)-4-[[2-[(1R,3R)-1-hydroxy-4-methyl-3-[[(2S,3S)-3-methyl-2-[[(2R)-1-methylpiperidine-2-carbonyl]amino]pentanoyl]amino]pentyl]-1,3-thiazole-4-carbonyl]amino]-2-methyl-5-phenylpentanoic acid
• 化学式: C₃₅H₅₃N₅O₆S
• 分子量: 671.902
• InChiKey: WUFZLLWTTGBSDH-HHKQAZDGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.63
• 拓扑面积：
  189
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tubulysin V 、 丁酸酐 在 吡啶 作用下， 反应 18.0h， 以58%的产率得到(2S,4R)-4-[[2-[(1R,3R)-1-butanoyloxy-4-methyl-3-[[(2S,3S)-3-methyl-2-[[(2R)-1-methylpiperidine-2-carbonyl]amino]pentanoyl]amino]pentyl]-1,3-thiazole-4-carbonyl]amino]-2-methyl-5-phenylpentanoic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] THERAPEUTIC COMPOUNDS
  [FR] COMPOSÉS THÉRAPEUTIQUES

  摘要：

  公式（I）的化合物：或其盐类被披露。还披露了包含公式（I）化合物的药物组合物，制备公式（I）化合物的方法，用于制备公式（I）化合物的有用中间体，以及用于治疗癌症的治疗方法。

  公开号：

  WO2015057585A1
• 作为产物：
  描述：

  (2R)-1-甲基-2-哌啶甲酸 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 tubulysin V
  参考文献：
  名称：

  对微管溶菌素V的对映选择性全合成

  摘要：

  已经从二肽23，Tuv和Tup的单元对映选择性地合成了TubulysinV 。该合成策略的特征包括三部分：从d-苹果酸非对映选择性地合成Tuv片段17，通过不对称还原和甲基化构建Tup单元的立体中心，几种已知方法的差向异构化是通过片段19与24的缩合以及氢化脱保护而成功避免了这种情况。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2016.08.038

文献信息

• Total Synthesis and Biological Evaluation of Tubulysin U, Tubulysin V, and Their Analogues
  作者：Ranganathan Balasubramanian、Bhooma Raghavan、Adrian Begaye、Dan L. Sackett、Robert A. Fecik

  DOI：10.1021/jm8013579

  日期：2009.1.22

  A stereoselective total synthesis of the cytotoxic natural products tubulysin U, tubulysin V, and its unnatural epimer epi-tubulysin V, is reported. Simplified analogues containing N,N-dimethyl-d-alanine as a replacement for the N-terminal N-Me-pipecolinic acid residue of the tubulysins are also disclosed. Biological evaluation of these natural products and analogues provided key information with regard

  报道了细胞毒性天然产物微管溶素 U、微管溶素 V 及其非天然差向异构体表观微管溶素 V 的立体选择性全合成。含简化类似物Ñ，Ñ二甲基d丙氨酸作为N-末端的替代Ñ微管溶素的-Me-2-哌啶酸残基也被公开。这些天然产物和类似物的生物学评价提供了关于抗增殖活性和微管蛋白聚合抑制的结构和立体化学要求的关键信息。
• [EN] DESACETOXYTUBULYSIN H AND ANALOGS THEREOF<br/>[FR] DÉSACÉTOXYTUBULYSINE H ET SES ANALOGUES
  申请人：UNIV RICE WILLIAM M

  公开号：WO2016138288A1

  公开（公告）日：2016-09-01

  In one aspect, the present disclosure provides tubulysin analogs of the formula (I) wherein R1, R2, R3, R4, X1, X2, X3, and A1 are as defined herein. In another aspect, the present disclosure also provides methods of preparing the compounds disclosed herein. In another aspect, the present disclosure also provides pharmaceutical compositions and methods of use of the compounds disclosed herein.

  在一个方面，本公开提供了公式（I）的tubulysin类似物，其中R1、R2、R3、R4、X1、X2、X3和A1如本文所定义。在另一个方面，本公开还提供了制备本公开化合物的方法。在另一个方面，本公开还提供了药物组合物和使用本公开化合物的方法。
• Improved Total Synthesis of Tubulysins and Design, Synthesis, and Biological Evaluation of New Tubulysins with Highly Potent Cytotoxicities against Cancer Cells as Potential Payloads for Antibody–Drug Conjugates
  作者：K. C. Nicolaou、Rohan D. Erande、Jun Yin、Dionisios Vourloumis、Monette Aujay、Joseph Sandoval、Stefan Munneke、Julia Gavrilyuk

  DOI：10.1021/jacs.7b12692

  日期：2018.3.14

  streamlined total syntheses of natural tubulysins such as V (Tb45) and U (Tb46) and pretubulysin D (PTb-D43), and their application to the synthesis of designed tubulysin analogues (Tb44, PTb-D42, PTb-D47-PTb-D49, and Tb50-Tb120), are described. Cytotoxicity evaluation of the synthesized compounds against certain cancer cell lines revealed a number of novel analogues with exceptional potencies [e.g., Tb111:

  V (Tb45) 和 U (Tb46) 和 pretubulysin D (PTb-D43) 等天然微管溶素的改进、简化的全合成，以及它们在合成设计的微管溶素类似物（Tb44、PTb-D42、PTb-D47-PTb）中的应用-D49 和 Tb50-Tb120)，进行了描述。合成化合物对某些癌细胞系的细胞毒性评估揭示了许多具有特殊效力的新型类似物[例如，Tb111：IC50 = 40 pM 对 MES SA（子宫肉瘤）细胞系；针对 HEK 293T（人胚胎肾癌）细胞系的 IC50 = 6 pM；和 IC50 = 1.54 nM，对 MES SA DX（具有明显多重耐药性的 MES SA）细胞系]。这些研究产生了一组有价值的构效关系，为进一步的分子设计、合成和生物学评价研究提供指导。
• Synthesis and structure–activity relationship studies of novel tubulysin U analogues – effect on cytotoxicity of structural variations in the tubuvaline fragment
  作者：Sreejith P. Shankar、Monika Jagodzinska、Luciana Malpezzi、Paolo Lazzari、Ilaria Manca、Iain R. Greig、Monica Sani、Matteo Zanda

  DOI：10.1039/c3ob27111k

  日期：——

  Tubulysins are cytotoxic natural products with promising anti-cancer properties, originally isolated from myxobacterial cultures. Structurally, tubulysins are tetrapeptides, incorporating three unusual (Mep, Tuv and Tup) and one proteinogenic amino acid (Ile). Here we describe the synthesis and structure–activity relationship studies of novel tubulysin U and V analogues, with variations in the central Tuv fragment, which is known to be of paramount importance for tubulysins’ potency and hence cytotoxicity, but has seldom been modified in previous studies. Specifically, we replaced the natural iso-propyl and acetoxy functionalities with other structurally related groups. In general, the new analogues showed much lower potency relative to native tubulysin U. However, one of the synthetic analogues (1f) having a MOM function replacing the acetyl group exhibited a 22 nM IC50 on the HT-29 cell line which is comparable to the IC50 displayed by tubulysin U (3.8 nM). Furthermore, the synthetic methodology reported herein was found to be flexible enough to deliver different core-modified tubulysin analogues and hence may be regarded as a scalable and convenient strategy for the chemical generation of novel tubulysin analogues.

  Tubulysins是一种细胞毒性天然产物，具有有前景的抗癌特性，最初从粘细菌培养物中分离出来。在结构上，Tubulysins是四肽，包含三个不寻常的（Mep、Tuv和Tup）和一个蛋白质原生的氨基酸（Ile）。在这里，我们描述了新型Tubulysin U和V类似物的合成及其构效关系研究，这些类似物在中央Tuv片段上有所变化，该片段对于Tubulysins的效力和细胞毒性至关重要，但在先前的研究中很少被修改。具体而言，我们用其他结构相关的基团替代了天然的异丙基和乙酰氧基功能。总的来说，与天然Tubulysin U相比，新的类似物显示出较低的效力。然而，其中一个合成类似物（1f）具有MOM功能替代乙酰基，在HT-29细胞系上显示出22 nM的IC50，与Tubulysin U（3.8 nM）显示的IC50相当。此外，本文报道的合成方法被发现足够灵活，可以提供不同核心修饰的Tubulysin类似物，因此可以被视为产生新型Tubulysins类似物的可扩展和便捷策略。
• Total Syntheses of Tubulysins
  作者：Taku Shibue、Toshihiro Hirai、Iwao Okamoto、Nobuyoshi Morita、Hyuma Masu、Isao Azumaya、Osamu Tamura

  DOI：10.1002/chem.201000963

  日期：——

  (S)‐4‐isopropyl‐3‐propionyl‐2‐oxazolidinone with N‐protected phenylalaninal and a subsequent Barton deoxygenation protocol. We accomplished the total syntheses of tubulysins U (1 c) and V (1 d) by using these methodologies, in which the isoxazolidine ring was used as the effective protective group for γ‐amido alcohol functionality. Furthermore, to understand the structure‐activity relationship of tubulysins

  描述了作为强效微管蛋白聚合抑制剂的四肽微管蛋白溶素D（1b），U（1 c）和V（1 d）的总合成。Tuv（2）的合成是微管蛋白的一种不常见的氨基酸组成，包括衍生自D-古洛糖的手性硝酮D - 6与N-丙烯酰基樟脑（s）9的1,3-偶极环加成反应，采用双不对称诱导，而另一种不常见的氨基酸Tup（20）的合成涉及由（S）生成的（Z）-硼烯醇盐的立体选择性Evans aldol反应）带有N保护的苯丙氨酸的4-异丙基-3-丙酰基-2-恶唑烷酮和随后的Barton脱氧方案。通过使用这些方法，我们完成了微管溶素U（1 c）和V（1 d）的总合成，其中异恶唑烷环用作γ-氨基醇官能团的有效保护基。此外，为了了解微管溶素的结构-活性关系，我们合成了微管蛋白抑制剂d（图1b）和环-微管蛋白抑制剂d（图1e）由2 -Me和20，和ENT -tubulysin d（ENT - 1 d）从ENT - 2个‐Me和ent