(2R,5R)-2-(3-((benzyloxy)methyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-5-(hydroxymethyl)-4-methoxytetrahydrofuran-3-yl acetate | 1158951-44-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: (2R,5R)-2-(3-((benzyloxy)methyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-5-(hydroxymethyl)-4-methoxytetrahydrofuran-3-yl acetate
• 英文别名: 3-[(benzyloxy)methyl]-1-(2-O-acetyl-3-O-methyl-β-D-ribofuranosyl)uracil；[(2R,3R,4R,5R)-2-[2,4-dioxo-3-(phenylmethoxymethyl)pyrimidin-1-yl]-5-(hydroxymethyl)-4-methoxyoxolan-3-yl] acetate
• CAS: 1158951-44-0
• 化学式: C₂₀H₂₄N₂O₈
• 分子量: 420.419
• InChiKey: OWBZIYGCXAWMRN-NXWXRZEISA-N

物化性质

• 沸点：
  559.4±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.38±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,5R)-2-(3-((benzyloxy)methyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-5-(hydroxymethyl)-4-methoxytetrahydrofuran-3-yl acetate 在 4-二甲氨基吡啶 、 potassium osmate(VI) dihydrate 、 sodium chlorite 、 10 % palladium on carbon 、 sodium dihydrogenphosphate dihydrate 、 2-甲基-2-丁烯 、 三氟化硼乙醚 、 氢气 、 戴斯-马丁氧化剂 、 溶剂黄146 、 N-甲基吗啉氧化物 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 异丙醇 、 丙酮 、 乙腈 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 42.17h， 生成 2′-O-acetyl-5′-(S)-O-(2,3-di-O-acetyl-4-deoxy-β-L-erythro-hex-4-enopyranuronosyl)-5′-C-cyano-3′-O-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  费里尔Ⅰ型反应合成卡普拉霉素及其类似物及其生物学评价

  摘要：

  以Ferrier I型反应为关键步骤，完成了一种很有前景的抗结核抗生素capuramycin( 1 )的全合成。这种全合成是卡普拉霉素及其类似物合成的另一种方法。3' - O-去甲基类似物 ( 2 )对耻垢分枝杆菌和鸟分枝杆菌表现出与卡普拉霉素 ( 1 )相当的抗菌活性，被认为具有作为卡普拉霉素类似物的先导结构的潜力，因为2更容易从合成的观点。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2022.117011
• 作为产物：
  描述：

  在 三氟化硼乙醚 、 4-甲苯硫酚 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以2.5 g的产率得到(2R,5R)-2-(3-((benzyloxy)methyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-5-(hydroxymethyl)-4-methoxytetrahydrofuran-3-yl acetate
  参考文献：
  名称：

  Concise Synthesis of Capuramycin

  摘要：

  A concise total synthesis of capuramycin (1), a promising preclinical TB drug lead, is achieved by high-yield formations of the cyanohydrin 5a and 4 '',5 ''-glycal derivative 12. Capuramycin can be synthesized in eight steps from the uridine building block 5a with >30% overall yield. The synthetic intermediates reported here are useful for generation of analogs to improve pharmacokinetic properties of capuramycin.

  DOI：

  10.1021/ol900458w

文献信息

• DPAGT1 Inhibitors of Capuramycin Analogues and Their Antimigratory Activities of Solid Tumors
  作者：Katsuhiko Mitachi、Rita G. Kansal、Kirk E. Hevener、Cody D. Gillman、Syed M. Hussain、Hyun Gi Yun、Gustavo A. Miranda-Carboni、Evan S. Glazer、William M. Clemons、Michio Kurosu

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c00545

  日期：2020.10.8

  Capuramycin displays a narrow spectrum of antibacterial activity by targeting bacterial translocase I (MraY). In our program of development of new N-acetylglucosaminephosphotransferase1 (DPAGT1) inhibitors, we have identified that a capuramycin phenoxypiperidinylbenzylamide analogue (CPPB) inhibits DPAGT1 enzyme with an IC50 value of 200 nM. Despite a strong DPAGT1 inhibitory activity, CPPB does not show cytotoxicity against normal cells and a series of cancer cell lines. However, CPPB inhibits migrations of several solid cancers including pancreatic cancers that require high DPAGT1 expression in order for tumor progression. DPAGT1 inhibition by CPPB leads to a reduced expression level of Snail but does not reduce E-cadherin expression level at the IC50 (DPAGT1) concentration. CPPB displays a strong synergistic effect with paclitaxel against growthinhibitory action of a patient-derived pancreatic adenocarcinoma, PD002: paclitaxel (IC50: 1.25 mu M) inhibits growth of PD002 at 0.0024-0.16 mu M in combination with 0.10-2.0 mu M CPPB (IC50: 35 mu M).