(S,S)-S-adenosyl-L-methionine | 78548-84-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: (S,S)-S-adenosyl-L-methionine
• 英文别名: S-adenosyl-L-methionine；S-adenosylmethionine；(S,S)-AdoMet；SAM；(S)-adenosin-5'-yl-((#S)-3-amino-3-carboxy-propyl)-methyl sulfonium-betaine；(S)-Adenosin-5'-yl-((#S)-3-amino-3-carboxy-propyl)-methyl-sulfonium-betain
• CAS: 78548-84-2
• 化学式: C₁₅H₂₂N₆O₅S
• 分子量: 398.443
• InChiKey: MEFKEPWMEQBLKI-FCKMPRQPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.26
• 重原子数：
  27.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  185.46
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S,S)-S-adenosyl-L-methionine 在 硫酸 、 calcium chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] STABLE SALTS OF S-ADENOSYLMETHIONINE AND PROCESS FOR THE PREPARATION THEREOF
  [FR] SELS STABLES DE S-ADÉNOSYLMÉTHIONINE ET PROCÉDÉ DE PRÉPARATION DE CEUX-CI

  摘要：

  本发明涉及一种新的S-腺苷甲硫氨酸（SAMe）盐，具有改善的稳定性，并含有至少70％的SAMe重量。

  公开号：

  WO2009008019A1
• 作为产物：
  描述：

  L-蛋氨酸 、 5’-三磷酸腺苷 在 recombinant S-adenosylmethionine synthase-I₃₁₇A from Bacillus subtilis (strain ATCC 6051) 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 (S,S)-S-adenosyl-L-methionine
  参考文献：
  名称：

  Rationally engineered variants of S-adenosylmethionine (SAM) synthase: reduced product inhibition and synthesis of artificial cofactor homologues

  摘要：

  通过三维建模和对接，对细菌腺苷甲硫氨酸合成酶进行合理重设计，导致产生变种，可以合成甲基化辅酶SAM（AdoMet）而无产物抑制，并且可以合成更高级的烷基同系物。

  DOI：

  10.1039/c4cc08478k
• 作为试剂：
  描述：

  L-赖氨酸 在 sodium dithionite 、 磷酸吡哆醛 、 (S,S)-S-adenosyl-L-methionine 、 2,3-aminomutase BlsG 、 sodium chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 β-lysine
  参考文献：
  名称：

  天冬氨酸侧链羧酸盐-精氨酸相互作用在精氨酸 2,3-氨基变位酶 BlsG 底物选择中的重要性

  摘要：

  杀菌剂核苷杀稻瘟素 S 具有 β-精氨酸，这是天然产物结构中很少揭示的部分。 BlsG 是一种来自杀稻瘟菌素 S 生物合成途径的自由基 SAM 精氨酸-2,3-氨基变位酶，对三种碱性氨基酸表现出混杂的活性。在这项研究中，我们证明了 BlsG对其天然底物精氨酸表现出高度偏好。结合结构建模、稳态动力学和突变分析，可以详细了解 BlsG 的底物识别。 T340D 的单个突变改变了 BlsG 的底物偏好，导致对赖氨酸的偏好略高于精氨酸。基于我们对BlsG底物选择和生物信息学分析的理解，我们提出与KAM的D 293和D 330位置对应的D…D基序是赖氨酸2,3-氨基变位酶的特征，而相应的D…T基序是赖氨酸2,3-氨基变位酶的特征。是精氨酸2,3-氨基变位酶的特征。该研究可能提供一种简单的方法来识别精氨酸2,3-氨基变位酶，从而发现具有β-精氨酸部分的新天然化合物。

  DOI：

  10.1002/pro.4584

文献信息

• Chemoenzymatic synthesis and in situ application of S-adenosyl-l-methionine analogs
  作者：Marie Thomsen、Stine B. Vogensen、Jens Buchardt、Michael D. Burkart、Rasmus P. Clausen

  DOI：10.1039/c3ob41702f

  日期：——

  chemoenzymatic synthesis of a series of SAM analogs using wild-type (wt) and point mutants of two recently identified halogenases, SalL and FDAS. Molecular modelling studies are used to guide the rational design of mutants, and the enzymatic conversion of L-Met and other analogs into SAM analogs is demonstrated. We also apply this in situ enzymatic synthesis to the modification of a small peptide substrate

  S-腺苷-L-甲硫氨酸 (SAM) 的类似物越来越多地应用于甲基转移酶 (MT) 催化的生物分子修饰，包括蛋白质、核酸和小分子。然而，SAM 及其类似物具有固有的不稳定性，它们的化学合成受到低收率和立体异构体分离和抑制困难的挑战。在这里，我们报告了使用野生型 (wt) 和两个最近发现的卤化酶 SalL 和 FDAS 的点突变体的一系列 SAM 类似物的化学酶法合成。分子建模研究用于指导突变体的合理设计，并证明了L- Met 和其他类似物向 SAM 类似物的酶促转化。我们也将其应用于原位通过蛋白质精氨酸甲基转移酶 1 (PRMT1) 酶促合成小肽底物的修饰。该技术为化学合成提供了一种有吸引力的替代方法，可原位应用以克服稳定性和活性问题。
• Nitrososynthase-Triggered Oxidative Carbon–Carbon Bond Cleavage in Baumycin Biosynthesis
  作者：Ahmad Al-Mestarihi、Anthony Romo、Hung-wen Liu、Brian O. Bachmann

  DOI：10.1021/ja404987r

  日期：2013.8.7

  sugar. Notably, the dnmZ gene in the dox gene cluster possesses high translated sequence similarity to nitrososynthases, which are flavin-dependent amine monooxygenases involved in the four-electron oxidation of amino sugars to nitroso sugars. Herein we demonstrate that DnmZ is an amino sugar nitrososynthase that initiates the conversion of thymidine-5'-diphosphate-l-epi-vancosamine to a ring-opened product

  鲍霉素与临床上重要的抗癌次级代谢产物柔红霉素和多柔比星共同产生，它们是从 Streptomyces peucetius 中分离出来的糖基化蒽环类药物。鲍霉素的显着特征是存在附加到柔红胺的不寻常的缩醛部分，柔红霉素在从发酵液中酸提取柔红霉素的过程中会水解。鲍霉素缩醛的结构表明它很可能来自在 C3" 和 C4" 位置之间切割的未知 C3"-甲基脱氧糖。这得到了对鲍霉素/柔红霉素生物合成基因簇 (dox) 的分析的支持，该基因簇也编码与含有支链糖的蒽环类双糖的生产一致的推定蛋白质。尤其，dox 基因簇中的 dnmZ 基因与亚硝基合酶具有高度的翻译序列相似性，亚硝基合酶是一种黄素依赖性胺单加氧酶，参与氨基糖的四电子氧化为亚硝基糖。在本文中，我们证明 DnmZ 是一种氨基糖亚硝基合酶，它通过以前未表征的逆肟-醛醇反应启动 thymidine-5'-diphosphate-l-epi-vancosamine
• Biotin Synthase Exhibits Burst Kinetics and Multiple Turnovers in the Absence of Inhibition by Products and Product-Related Biomolecules
  作者：Christine E. Farrar、Karen K. W. Siu、P. Lynne Howell、Joseph T. Jarrett

  DOI：10.1021/bi101023c

  日期：2010.11.23

  may help to explain some of the experimental disparities between various laboratories studying BS. In addition, we examine possible inhibition by other AdoMet-related biomolecules present as common contaminants in commercial AdoMet preparations and/or generated during an assay, as well as by sinefungin, a natural product that is a known inhibitor of several AdoMet-dependent enzymes. Finally, we examine

  生物素合酶 (BS) 是酶的“SAM 自由基”超家族的成员，它催化各种底物的可逆或不可逆氧化与S-腺苷-l-甲硫氨酸 (AdoMet) 锍还原成生成甲硫氨酸和 5'-脱氧腺苷 (dAH)。先前的研究表明，这些产品是 BS 和该酶家族其他成员的适度抑制剂。此外，大肠杆菌BS 的体内催化活性需要表达 5'-甲硫腺苷/ S-腺苷-l-高半胱氨酸核苷酶，其水解 5'-甲硫腺苷(MTA)、S-腺苷-l-同型半胱氨酸 (AdoHcy) 和 dAH。在目前的工作中，我们证实 dAH 是一种适度的 BS 抑制剂（K i = 20 μM），并表明 dAH 与过量甲硫氨酸的协同结合导致这种抑制作用增强了 3 倍。然而，关于 MTA/AdoHcy 核苷酶的其他底物，我们证明 AdoHcy 是 BS 的有效抑制剂 ( K i ≤ 650 nM)，而 MTA 不是抑制剂。dAH 和 AdoHcy 的抑制作用可能是体内MTA/AdoHcy
• A Universal, Continuous Assay for SAM‐dependent Methyltransferases
  作者：Marian J. Menke、Pascal Schneider、Christoffel P. S. Badenhorst、Andreas Kunzendorf、Florian Heinz、Mark Dörr、Martin A. Hayes、Uwe T. Bornscheuer

  DOI：10.1002/anie.202313912

  日期：2023.12.18

  Enzyme‐catalyzed late‐stage functionalization (LSF), such as methylation of drug molecules and lead structures, enables direct access to more potent active pharmaceutical ingredients (API). S‐adenosyl‐l‐methionine‐dependent methyltransferases (MTs) can play a key role in the development of new APIs, as they catalyze the chemo‐ and regioselective methylation of O‐, N‐, S‐ and C‐atoms, being superior to traditional chemical routes. To identify suitable MTs, we developed a continuous fluorescence‐based, high‐throughput assay for SAM‐dependent methyltransferases, which facilitates screening using E. coli cell lysates. This assay involves two enzymatic steps for the conversion of S‐adenosyl‐l‐homocysteine into H₂S to result in a selective fluorescence readout via reduction of an azidocoumarin sulfide probe. Investigation of two O‐MTs and an N‐MT confirmed that this assay is suitable for the determination of methyltransferase activity in E. coli cell lysates.

  摘要酶催化的后期功能化（LSF），如药物分子和先导结构的甲基化，可以直接获得更有效的活性药物成分（API）。依赖于 S-腺苷-l-蛋氨酸的甲基转移酶（MTs）能催化 O 原子、N 原子、S 原子和 C 原子的化学和区域选择性甲基化，优于传统的化学途径，因此能在新原料药的开发中发挥关键作用。为了确定合适的 MT，我们开发了一种基于荧光的连续高通量检测方法，用于检测依赖于 SAM 的甲基转移酶，这种方法便于使用大肠杆菌细胞裂解液进行筛选。这种检测方法包括两个酶促步骤，将 S-腺苷-l-高半胱氨酸转化为 H2S，通过还原叠氮香豆素硫化物探针产生选择性荧光读数。对两种 O-甲基半胱氨酸和一种 N-甲基半胱氨酸的研究证实，这种检测方法适用于测定大肠杆菌细胞裂解物中的甲基转移酶活性。
• S-Adenosylmethionine: The Relation of Configuration at the Sulfonium Center to Enzymatic Reactivity¹
  作者：G. de la Haba、G. A. Jamieson、S. Harvey Mudd、Henry H. Richards

  DOI：10.1021/ja01524a039

  日期：1959.8