S-(2-acetamidoethyl) octanethioate | 934498-23-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: S-(2-acetamidoethyl) octanethioate
• 英文别名: Octanethioic acid, S-[2-(acetylamino)ethyl] ester
• CAS: 934498-23-4
• 化学式: C₁₂H₂₃NO₂S
• 分子量: 245.386
• InChiKey: ZSBVQWHKLXJOHJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  71.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  S-(2-acetamidoethyl) octanethioate 在 3,3,3-膦三基三丙酸 、 OleA 、 sodium phosphate 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 生成 2-hexyl-3-ketodecanoic acid
  参考文献：
  名称：

  NADPH依赖的2-烷基-3-酮链烷酸还原酶参与嗜麦芽窄食单胞菌的烯烃生物合成的功能表征。

  摘要：

  OleD被证明在嗜麦芽窄食单胞菌的酰基硫酯的烯烃（烯烃）生成中起着关键的还原作用。编码OleD的基因与其他三个基因oleABC聚在一起，并且在各种产生烯烃的细菌中似乎都以与操纵子相同的方向转录。在这项研究中，合成了一系列链长和立体化学不同的底物，并用于阐明OleD的功能作用和底物特异性。我们证明OleD，这是NADP（H）依赖还原酶，是一个同型二聚体，它催化2-烷基-3-酮链烷酸的可逆立体定向还原。用顺-2-癸基-3-羟基十四烷酸观察到的最大催化效率，kcat / K m分别比顺-2-辛基-3-羟基十二酸和顺-2-己基-3-羟基癸酸高5倍和8倍。用顺-2-丁基-3-羟基辛酸和缺少2-烷基的化合物（例如3-酮癸酸和3-羟基癸酸）未观察到OleD活性，这表明2-烷基链对于酶的识别和催化是必要的。使用已知立体化学的底物非对映异构体对和4个对映体纯的2-己基-3-羟基癸酸异构体，OleD被证明对（2

  DOI：

  10.1021/bi201096w
• 作为产物：
  描述：

  N-乙酰基半胱胺 、 辛酸 在 adenosine monophosphate ligase SfaB from Streptomyces thioluteus 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 、 Cleland's reagent 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 S-(2-acetamidoethyl) octanethioate
  参考文献：
  名称：

  重新利用3-异氰基丁酸腺苷酸化酶SfaB进行多功能酰胺化和硫酯化

  摘要：

  微生物天然产物的基因组挖掘使化学家不仅能够发现具有新颖骨架的生物活性分子，而且能够识别催化多种化学反应的酶。探索这些生物合成酶的底物混杂性和催化机理有助于开发潜在的生物催化剂。SfaB是一种形成酰基腺苷酸的酶，可在由硫链霉菌产生的二异腈自然产物SF2768的生物合成途径中，对独特的结构单元3-异氰基丁酸进行腺苷酸化。，并且该AMP连接酶被证明可以接受各种短链脂肪酸（SCFA）。在本文中，我们将SfaB重新用于催化那些SCFA与各种胺或硫醇亲核试剂之间的酰胺化或硫酯化反应，从而提供了另一种酶促方法来体外制备相应的酰胺和硫酯。

  DOI：

  10.1002/anie.202010042

文献信息

• A mechanism-based fluorescence transfer assay for examining ketosynthase selectivity
  作者：Gitanjeli Prasad、Lawrence S. Borketey、Tsung-Yi Lin、Nathan A. Schnarr

  DOI：10.1039/c2ob26008e

  日期：——

  Since their discovery, polyketide synthases have received massive attention from researchers hoping to harness their potential as a platform for generating new and improved therapeutics. Despite significant strides toward this end, inherent specificities within the enzymes responsible for polyketide production have severely limited these efforts. We have developed a mechanism-based, fluorescence transfer assay for a key enzyme component of all polyketide synthases, the ketosynthase domain. As demonstrated, this method can be used with both ketosynthase-containing didomains and full modules. As proof of principle, the ketosynthase domain from module 6 of the 6-deoxyerythronolide synthase is examined for its ability to accept a variety of simple thioester substrates. Consistent with its natural hexaketide substrate, we find that this ketosynthase prefers longer, α-branched thioesters and its ability to distinguish these structural features is quite remarkable. Substrate electronics are also tested via a variety of p-substituted aromatic groups. In all, we expect this technique to find considerable use in the field of polyketide biosynthesis and engineering due to its extraordinary simplicity and very distinct visible readout.

  自其发现以来，聚酮合酶一直受到研究人员的极大关注，他们希望利用其潜力作为平台，生成新的和改进的治疗药物。尽管在这方面取得了重大进展，但负责聚酮生产的酶中固有的特定性严重限制了这些努力。我们开发了一种基于机制的、通过荧光传递的测定方法，用于所有聚酮合酶的关键酶组成部分，即酮合酶结构域。如所示，这种方法可以用于含有酮合酶的双结构域和完整模块。作为原理验证，我们检验了来自6-脱氧赤酮酸合酶模块6的酮合酶结构域，以评估其对各种简单硫酯底物的接受能力。与其天然六酮底物一致，我们发现该酮合酶偏好较长的、α-分支的硫酯，并且其区分这些结构特征的能力相当显著。通过各种对位取代的芳香族基团也测试了底物电子性质。总之，我们预计这项技术将在聚酮生物合成和工程领域得到广泛应用，因为它极其简单且具有非常明显的可见输出。
• A KAS-III Heterodimer in Lipstatin Biosynthesis Nondecarboxylatively Condenses C₈ and C₁₄ Fatty Acyl-CoA Substrates by a Variable Mechanism during the Establishment of a C₂₂ Aliphatic Skeleton
  作者：Daozhong Zhang、Fang Zhang、Wen Liu

  DOI：10.1021/jacs.8b12843

  日期：2019.3.6

  both long-chain fatty acyl-CoA substrates. This flexibility, along with the characterization of catalytic residues, benefits our investigations into the individual roles of the two KAS-III homologues in the heterodimer-catalyzed reactions. The large subunit LstA contains a characteristic Cys-His-Asn triad and likely reacts with C8 acyl-CoA to form an acyl-Cys enzyme intermediate. In contrast, the small

  β-酮酰基-酰基载体蛋白合酶-III (KAS-III) 及其同源物是硫解酶折叠蛋白，通常表现为同型二聚体，在各种基于硫酯的反应中起作用，以形成 CC、CO 或 CN 键。在这里，我们报告了在lipstatin 的生物合成中观察到的异常。在此 β-内酯脂肪酶抑制剂的 C22 脂肪族骨架的建立过程中，LstA 和 LstB（两者都是 KAS-III 同源物但在系统发育上彼此不同）通过形成不寻常的异二聚体来共同发挥作用，以催化 C8 和C14 脂肪酰基辅酶 A 底物。所得的 C22 α-烷基 β-酮酸不稳定，倾向于自发脱羧为分流 C21 烃产物，通过立体选择性 β-酮还原酶 LstD 转化为相对稳定的 C22 α-烷基 β-羟基酸，用于进一步转化。LstAB 活性耐受两种长链脂肪酰基辅酶 A 底物的立体化学、饱和度和硫酯形式的变化。这种灵活性以及催化残基的表征，有利于我们对异二聚体催化反应中两个
• Multiple Complexes of Long Aliphatic <i>N</i>-Acyltransferases Lead to Synthesis of 2,6-Diacylated/2-Acyl-Substituted Glycopeptide Antibiotics, Effectively Killing Vancomycin-Resistant Enterococcus
  作者：Syue-Yi Lyu、Yu-Chen Liu、Chin-Yuan Chang、Chuen-Jiuan Huang、Ya-Huang Chiu、Chun-Man Huang、Ning-Shian Hsu、Kuan-Hung Lin、Chang-Jer Wu、Ming-Daw Tsai、Tsung-Lin Li

  DOI：10.1021/ja504125v

  日期：2014.8.6

  Teicoplanin A2-2 (Tei)/A40926 is the last-line antibiotic to treat multidrug-resistant Gram-positive bacterial infections, e.g., methicillinresistant Staphylococcus aurcus (MRSA) and vancomycin-resistant enterococcus (VRE). This class of antibiotics is powered by the N-acyltransferase (NAT) Orf11*/Dbv8 through N-acylation on glucosamine at the central residue of Tei/A40926 pseudoaglycone. The NAT enzyme possesses enormous value in untapped applications; its advanced development is hampered largely due to a lack of structural information. In this report, we present eight high-resolution X-ray crystallographic unary, binary, and ternary complexes in order to decipher the molecular basis for NAT's functionality. The enzyme undergoes a multistage conformational change upon binding of acyl-CoA, thus allowing the uploading of Tei pseudoaglycone to enable the acyl-transfer reaction to take place in the occlusion between the N- and C-halves of the protein. The acyl moiety of acyl-CoA can be bulky or lengthy, allowing a large extent of diversity in new derivatives that can be formed upon its transfer. Vancomycin/synthetic acyl-N-acetyl cysteamine was not expected to be able to serve as a surrogate for an acyl acceptor/donor, respectively. Most strikingly, NAT can catalyze formation of 2-N,6-O-diacylated or C6 -> C2 acyl-substituted Tei analogues through an unusual 1,4-migration mechanism under stoichiometric/solvational reaction control, wherein selected representatives showed excellent biological activities, effectively counteracting major types (VanABC) of VRE.
• Repurposing the 3‐Isocyanobutanoic Acid Adenylation Enzyme SfaB for Versatile Amidation and Thioesterification
  作者：Mengyi Zhu、Lijuan Wang、Jing He

  DOI：10.1002/anie.202010042

  日期：2021.1.25

  molecules with novel skeletons, but also to identify the enzymes that catalyze diverse chemical reactions. Exploring the substrate promiscuity and catalytic mechanism of those biosynthetic enzymes facilitates the development of potential biocatalysts. SfaB is an acyl adenylate‐forming enzyme that adenylates a unique building block, 3‐isocyanobutanoic acid, in the biosynthetic pathway of the diisonitrile

  微生物天然产物的基因组挖掘使化学家不仅能够发现具有新颖骨架的生物活性分子，而且能够识别催化多种化学反应的酶。探索这些生物合成酶的底物混杂性和催化机理有助于开发潜在的生物催化剂。SfaB是一种形成酰基腺苷酸的酶，可在由硫链霉菌产生的二异腈自然产物SF2768的生物合成途径中，对独特的结构单元3-异氰基丁酸进行腺苷酸化。，并且该AMP连接酶被证明可以接受各种短链脂肪酸（SCFA）。在本文中，我们将SfaB重新用于催化那些SCFA与各种胺或硫醇亲核试剂之间的酰胺化或硫酯化反应，从而提供了另一种酶促方法来体外制备相应的酰胺和硫酯。
• Functional Characterization of an NADPH Dependent 2-Alkyl-3-ketoalkanoic Acid Reductase Involved in Olefin Biosynthesis in <i>Stenotrophomonas maltophilia</i>
  作者：Shilah A. Bonnett、Kancharla Papireddy、Samuel Higgins、Stephen del Cardayre、Kevin A. Reynolds

  DOI：10.1021/bi201096w

  日期：2011.11.8

  to play a key reductive role in the generation of alkenes (olefins) from acyl thioesters in Stenotrophomonas maltophilia. The gene coding for OleD clusters with three other genes, oleABC, and all appear to be transcribed in the same direction as an operon in various olefin producing bacteria. In this study, a series of substrates varying in chain length and stereochemistry were synthesized and used

  OleD被证明在嗜麦芽窄食单胞菌的酰基硫酯的烯烃（烯烃）生成中起着关键的还原作用。编码OleD的基因与其他三个基因oleABC聚在一起，并且在各种产生烯烃的细菌中似乎都以与操纵子相同的方向转录。在这项研究中，合成了一系列链长和立体化学不同的底物，并用于阐明OleD的功能作用和底物特异性。我们证明OleD，这是NADP（H）依赖还原酶，是一个同型二聚体，它催化2-烷基-3-酮链烷酸的可逆立体定向还原。用顺-2-癸基-3-羟基十四烷酸观察到的最大催化效率，kcat / K m分别比顺-2-辛基-3-羟基十二酸和顺-2-己基-3-羟基癸酸高5倍和8倍。用顺-2-丁基-3-羟基辛酸和缺少2-烷基的化合物（例如3-酮癸酸和3-羟基癸酸）未观察到OleD活性，这表明2-烷基链对于酶的识别和催化是必要的。使用已知立体化学的底物非对映异构体对和4个对映体纯的2-己基-3-羟基癸酸异构体，OleD被证明对（2