benzyl (2S)-2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-ylcarbonyl)tetrahydro-1H-pyrrole-1-carboxylate | 886981-23-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl (2S)-2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-ylcarbonyl)tetrahydro-1H-pyrrole-1-carboxylate
• 英文别名: (S)-benzyl 2-(1H-benzo[d][1,2,3]triazole-1-carbonyl)pyrrolidine-1-carboxylate；Cbz-L-Pro-Bt；Z-(L)Pro-Bt；(2S)-1-(benzyloxycarbonyl)-2-(benzotriazol-1-ylcarbonyl)pyrrolidine；benzyl (2S)-2-(benzotriazole-1-carbonyl)pyrrolidine-1-carboxylate
• CAS: 886981-23-3
• 化学式: C₁₉H₁₈N₄O₃
• 分子量: 350.377
• InChiKey: GDMROHXBPUYMMA-KRWDZBQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  77.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (2S)-2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-ylcarbonyl)tetrahydro-1H-pyrrole-1-carboxylate 在 氯化亚砜 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 16.25h， 生成 (S)-benzyl 2-(((S)-1-(1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-4-methyl-1-oxopentan-2-yl)carbamoyl)pyrrolidine-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Total synthesis of cyclic heptapeptide Rolloamide B

  摘要：

  报道了环脯氨酸富集的七肽Rolloamide B的首次全合成。该工作采用苯并三唑介导的液相肽合成法，连接天然氨基酸。

  DOI：

  10.1039/c3cc39291k
• 作为产物：
  描述：

  T406石油添加剂 、 N-苄氧羰基-L-脯氨酸 在 氯化亚砜 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.33h， 以95%的产率得到benzyl (2S)-2-(1H-1,2,3-benzotriazol-1-ylcarbonyl)tetrahydro-1H-pyrrole-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  The Efficient Preparation of Di- and Tripeptides by CouplingN-(Cbz- or Fmoc-α-aminoacyl)benzotriazoles with Unprotected Amino Acids

  摘要：

  在水中用乙腈溶液中,N-(苄氧羰基化或芴甲氧羰基化α-氨酰基)苯并三唑 2 和 N-保护肽基苯并三唑 6分别与游离氨基酸或二肽偶联,制备得到:(i) 22 种手性纯二肽 5a-v (平均产率为 82%),由 N-(苄氧羰基化或芴甲氧羰基化α-氨酰基)苯并三唑 2和未保护的氨基酸制得;(ii) 5 种手性三肽 7a-e (平均产率为 75%),由 N-保护肽苯并三唑 6 和未保护的氨基酸制得;(iii) 1种手性三肽 7g (产率为 62%),由 N-(苄氧羰基化或芴甲氧羰基化α-氨酰基)苯并三唑 2a 和游离二肽 8 制得。全部 20 种天然氨基酸中,含有以下未保护侧链官能团的 17种氨基酸的 N-(苄氧羰基化或芴甲氧羰基化α-氨酰基)苯并三唑衍生物均已使用:醇性-OH(丝氨酸)、吲哚性-NH(色氨酸)、咪唑性-NH,酚性-OH(酪氨酸)、-CONH2(谷氨酰胺、天冬酰胺)、-SH(半胱氨酸)、-CO2H(谷氨酸、天冬氨酸)、-S-S(胱氨酸)。通过使用 D-丙氨酸、L-丙氨酸和 DL-丙氨酸制备二肽和三肽的平行实验,证实了手性的完整保留。并通过 NMR 和 HPLC分析验证了手性完整性的其他证据。

  DOI：

  10.1055/s-2006-926287

文献信息

• Unexpected Reactivity of <i>N</i> -Acyl-Benzotriazoles with Aromatic Amines in Acidic Medium (ABAA Reaction)
  作者：Guillaume Laconde、Muriel Amblard、Jean Martinez

  DOI：10.1002/ejoc.201801567

  日期：2019.1.10

  A simple and practical approach for the synthesis of aromatic amides has been developed using N‐Acyl‐Benzotriazole derivatives and aromatic amines including anilines (ABAA reaction). The reaction is performed in acidic medium, is selective for the coupling of aromatic amines vs. aliphatic amines, and features broad functional group tolerance.

  使用N-酰基-苯并三唑衍生物和包括苯胺在内的芳族胺（ABAA反应），已经开发出一种简单而实用的合成芳族酰胺的方法。该反应在酸性介质中进行，对于芳族胺与脂肪族胺的偶联具有选择性，并且具有宽泛的官能团耐受性。
• (α-Aminoacyl)amino-Substituted Heterocycles and Related Compounds
  作者：Alan R. Katritzky、Bahaa El-Dien M. El-Gendy、Ekaterina Todadze、Ashraf A. A. Abdel-Fattah

  DOI：10.1021/jo8007379

  日期：2008.7.1

  N-Protected-(aminoacyl)benzotriazoles 1a−e,g,i,j,1a′−c′ convert heterocyclic amines of the following series: thiazoles (3a and 3a′), benzothiazoles (3b and 3b′), benzimidazoles (3c and 3c′), thiadiazoles (3d), pyrimidones (9a,b,a′), pyrazoles (11a,b), and pyridines (13a−g, 13d′) under microwave irradiation, into N-substituted amides in yields of 40−98% (average 76%). N-Protected peptidoylbenzotriazoles

  N-保护的（氨基酰基）苯并三唑1a - e，g，i，j，1a' - c'转换以下系列的杂环胺：噻唑（3a和3a'），苯并噻唑（3b和3b'），苯并咪唑（3c和3c'），噻二唑（3d），嘧啶酮（9a，b，a'），吡唑（11a，b）和吡啶（13a - g，13d'）在微波辐射下转化为N-取代的酰胺，产率为40-98％（平均76％）。N-保护的peptidoylbenzotriazoles 6A，b同样，得到Ç -末端的N-保护的酰胺dipeptidoyl 7A，b（52-60％）。
• Efficient Peptide Coupling Involving Sterically Hindered Amino Acids
  作者：Alan R. Katritzky、Ekaterina Todadze、Parul Angrish、Bogdan Draghici

  DOI：10.1021/jo0704255

  日期：2007.7.1

  coupling N-(Cbz- and Fmoc-α-aminoacyl)benzotriazoles with amino acids, wherein at least one of the components was sterically hindered, to provide compounds 3a−e, (3c +3 c‘), 5a−d, (5a + 5a‘), 6a−c, (6b + 6b‘), 8a−c, 9a−e, 10a−d, and (10a + 10a‘) in isolated yields of 41−95% with complete retention of chirality as evidenced by NMR and HPLC analysis. The benzotriazole activation methodology is a new route

  通过将N-（Cbz-和Fmoc-α-氨基酰基）苯并三唑与氨基酸偶合，可将受阻氨基酸引入肽链，其中至少一种组分在空间上受阻，从而提供化合物3a - e（3c +3 c ' ），5a - d，（5a + 5a ' ），6a - c，（6b + 6b ' ），8a - c，9a - e，10a - d和（10a + 10a ' ）NMR和HPLC分析表明，分离得到的化合物的收率为41-95％，并完全保留了手性。苯并三唑活化方法是合成位阻肽的新途径。（注意：括号内的化合物编号表示非对映异构体混合物或外消旋物；括号内的化合物编号表示对映异构体。）
• Tandem Deprotection-Dimerization-Macrocyclization Route to<i>C</i>₂Symmetric<i>cyclo</i>-Tetrapeptides
  作者：Khanh Ha、Iryna Lebedyeva、Sadra Hamedzadeh、Zhiliang Li、Ryan Quiñones、Girinath G. Pillai、Byron Williams、Amir Nasajpour、Kristin Martin、Abdullah M. Asiri、Alan R. Katritzky

  DOI：10.1002/chem.201304262

  日期：2014.4.22

  Therefore, the development of a process that affords the cyclic dimer predominantly is difficult. A novel and versatile strategy for the synthesis of symmetric cyclo‐tetrapeptides by palladium‐promoted tandem deprotection/cyclo‐dimerization from readily available Cbz‐dipeptidoyl benzotriazolides is reported (Cbz=carboxybenzyl).

  二聚-大环化一直是肽环化中的一个长期问题，因为在反应过程中还可能与所需的环状产物一起形成许多环状低聚物和线性聚合物。因此，难以开发主要提供环状二聚体的方法。据报道，通过钯促进的串联脱保护/环二聚反应，可以从容易获得的Cbz-二肽基苯甲酰三唑化物（Cbz =羧基苄基）合成对称环四肽的新型新颖方法。
• Ligand-based design, synthesis, computational insights, and <i>in vitro</i> studies of novel <i>N</i>-(5-Nitrothiazol-2-yl)-carboxamido derivatives as potent inhibitors of SARS-CoV-2 main protease
  作者：Mohamed Elagawany、Ayman Abo Elmaaty、Ahmed Mostafa、Noura M. Abo Shama、Eman Y. Santali、Bahaa Elgendy、Ahmed A. Al-Karmalawy

  DOI：10.1080/14756366.2022.2105322

  日期：2022.12.31

  against SARS-CoV-2. A new series of N-(5-nitrothiazol-2-yl)-carboxamido derivatives were designed and synthesised based on the structural optimisation principle of the SARS-CoV Mpro co-crystallized WR1 inhibitor. Notably, compound 3b achieved the most promising anti-SARS-CoV-2 activity with an IC50 value of 174.7 µg/mL. On the other hand, compounds 3a, 3b, and 3c showed very promising SARS-CoV-2 Mpro

   抽象的 COVID-19 大流行的全球爆发促使科学家迅速开发新的有效治疗干预措施来对抗 SARS-CoV-2。基于SARS-CoV Mpro共结晶WR1抑制剂的结构优化原理，设计合成了一系列新的N- (5-硝基噻唑-2-基)-甲酰胺衍生物。值得注意的是，化合物3b实现了最有希望的抗 SARS-CoV-2 活性，IC 50值为 174.7 µg/mL。另一方面，化合物3a 、 3b和3c显示出非常有前景的SARS-CoV-2 Mpro抑制作用，IC 50值分别为4.67、5.12和11.90 µg/mL。化合物3b对接分数非常有希望（-6.94 kcal/mol），其结合模式与WR1几乎相似。此外，化合物3b的分子动力学 (MD) 模拟显示其在结合袋内直至 40 ns 左右都具有出色的稳定性。最后，得出了一个非常有前途的 SAR，以帮助很快设计出更强大的 SARS-CoV-2 Mpro 抑制剂。