S-{1-[5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-4-羟基-3-(膦酰氧基)四氢-2-呋喃基]-3,5,9-三羟基-8,8-二甲基-3,5-二氧代-10,14-二氧代-2,4,6-三氧杂-11,15-二氮杂-3lambda5,5lambda5-二磷杂十七烷-17-基}2-甲基硫代丁酸酯 | 6712-02-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: S-{1-[5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-4-羟基-3-(膦酰氧基)四氢-2-呋喃基]-3,5,9-三羟基-8,8-二甲基-3,5-二氧代-10,14-二氧代-2,4,6-三氧杂-11,15-二氮杂-3lambda5,5lambda5-二磷杂十七烷-17-基}2-甲基硫代丁酸酯
• 英文名称: 2-methylbutanoyl-CoA
• 英文别名: 2-methylbutyryl-CoA；S-((Ξ)-2-methyl-butyryl)-coenzyme-A；S-((Ξ)-2-Methyl-butyryl)-coenzym-A；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 2-methylbutanethioate
• CAS: 6712-02-3
• 化学式: C₂₆H₄₄N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 851.659
• InChiKey: LYNVNYDEQMMNMZ-XGXNYEOVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.2
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-甲基丁酸 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 S-{1-[5-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-4-羟基-3-(膦酰氧基)四氢-2-呋喃基]-3,5,9-三羟基-8,8-二甲基-3,5-二氧代-10,14-二氧代-2,4,6-三氧杂-11,15-二氮杂-3lambda5,5lambda5-二磷杂十七烷-17-基}2-甲基硫代丁酸酯
  参考文献：
  名称：

  Biosynthesis of Branched-chain Fatty Acid inBacilli: FabD (malonyl-CoA:ACP transacylase) Is Not Essential forIn VitroBiosynthesis of Branched-chain Fatty Acids

  摘要：

  研究发现，不完全纯化的无枝菌酸菌β-酮脂酰ACP合酶（Bacillus insolitus）在活性测定时不需要添加FabD（丙二酸单酰-CoA:ACP转酰酶，MAT）。因此，本研究探讨了杆状菌粗脂肪酸合成酶（FAS）体外支链脂肪酸（BCFA）生物合成中FabD蛋白的必要性。为了探索FabD在BCFA生物合成中的作用，通过免疫沉淀法从粗FAS中去除该蛋白。将枯草芽孢杆菌的His标签融合蛋白FabD在大肠杆菌中表达，并用其制备抗体。针对表达的融合蛋白免疫兔子得到的抗体能特异性地识别枯草芽孢杆菌粗FAS中的FabD。免疫沉淀法效力评估显示，经抗体处理的粗FAS中仅残留极少量的FabD蛋白。然而，从粗FAS中完全去除FabD并未使其BCFA生物合成失活，仅使其活性降低，对于酰基-CoA引物降至对照组的50-60%，对于α-酮基-β-甲基戊酸引物降至80%。此外，FabD浓度与酶组分中MAT的特异性活性并不一定相关，表明存在另一种MAT活性的酶源。因此，本研究认为，FabD不是体外BCFA生物合成中MAT唯一的酶源，并暗示脂肪酸生物合成与其他代谢途径之间存在功能联系。

  DOI：

  10.1271/bbb.67.2106

文献信息

• Repurposing the 3‐Isocyanobutanoic Acid Adenylation Enzyme SfaB for Versatile Amidation and Thioesterification
  作者：Mengyi Zhu、Lijuan Wang、Jing He

  DOI：10.1002/anie.202010042

  日期：2021.1.25

  molecules with novel skeletons, but also to identify the enzymes that catalyze diverse chemical reactions. Exploring the substrate promiscuity and catalytic mechanism of those biosynthetic enzymes facilitates the development of potential biocatalysts. SfaB is an acyl adenylate‐forming enzyme that adenylates a unique building block, 3‐isocyanobutanoic acid, in the biosynthetic pathway of the diisonitrile

  微生物天然产物的基因组挖掘使化学家不仅能够发现具有新颖骨架的生物活性分子，而且能够识别催化多种化学反应的酶。探索这些生物合成酶的底物混杂性和催化机理有助于开发潜在的生物催化剂。SfaB是一种形成酰基腺苷酸的酶，可在由硫链霉菌产生的二异腈自然产物SF2768的生物合成途径中，对独特的结构单元3-异氰基丁酸进行腺苷酸化。，并且该AMP连接酶被证明可以接受各种短链脂肪酸（SCFA）。在本文中，我们将SfaB重新用于催化那些SCFA与各种胺或硫醇亲核试剂之间的酰胺化或硫酯化反应，从而提供了另一种酶促方法来体外制备相应的酰胺和硫酯。
• Screening and Engineering the Synthetic Potential of Carboxylating Reductases from Central Metabolism and Polyketide Biosynthesis
  作者：Dominik M. Peter、Lennart Schada von Borzyskowski、Patrick Kiefer、Philipp Christen、Julia A. Vorholt、Tobias J. Erb

  DOI：10.1002/anie.201505282

  日期：2015.11.2

  Carboxylating enoyl‐thioester reductases (ECRs) are a recently discovered class of enzymes. They catalyze the highly efficient addition of CO2 to the double bond of α,β‐unsaturated CoA‐thioesters and serve two biological functions. In primary metabolism of many bacteria they produce ethylmalonyl‐CoA during assimilation of the central metabolite acetyl‐CoA. In secondary metabolism they provide distinct

  羧化烯酰硫酯还原酶（ECR）是最近发现的一类酶。它们催化高效添加CO 2与α，β-不饱和CoA-硫酯的双键结合，具有两个生物学功能。在许多细菌的初级代谢中，它们在吸收中央代谢物乙酰辅酶A的过程中会产生乙基丙二酰辅酶A。在次级代谢中，它们提供独特的α-羧基-酰基-硫代酯，以改变许多聚酮化合物天然产物的主链。使用各种可能的底物库系统评估了不同的ECR。我们鉴定了三个活性位点残基，以区分仅限于C4和C5-烯酰基-CoA的ECR和高度混杂的ECR，并成功地设计了一种选定的ECR作为原理证明。这项研究定义了ECR反应性的分子基础，从而可以预测和操纵天然产物多样化中的关键反应。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS USEFUL FOR TREATING DISEASES CHARACTERIZED BY INSUFFICIENT PANTOTHENATE KINASE ACTIVITY<br/>[FR] COMPOSITIONS ET MÉTHODES UTILES DANS LE TRAITEMENT DE MALADIES SE CARACTÉRISANT PAR UNE ACTIVITÉ INSUFFISANTE DE LA PANTOTHÉNATE KINASE
  申请人：ACIES BIO D O O

  公开号：WO2017218963A1

  公开（公告）日：2017-12-21

  Methods and pharmaceutical compositions for use in treating diseases associated with insufficient activity of the pantothenate kinase enzyme (e.g., CASTOR diseases) are disclosed. The methods and compositions involve an effective amount of an active derivative of 4'-phosphopantetheine.

  本发明揭示了用于治疗与泛酰胺激酶酶活性不足相关疾病（例如CASTOR疾病）的方法和药物组合物。这些方法和组合物涉及有效量的4'-磷酰泛酰胺的活性衍生物。
• METHYLBUTANOL AS AN ADVANCED BIOFUEL
  申请人：Picataggio Stephen

  公开号：US20090288337A1

  公开（公告）日：2009-11-26

  This invention describes genes, metabolic pathways, microbial strains and methods to produce methyl butanol and other compounds of interest from renewable feedstocks.

  这项发明描述了从可再生原料中生产甲基丁醇和其他感兴趣化合物的基因、代谢途径、微生物菌株和方法。
• Producing 3-hydroxycarboxylic acid and ketone using polyketide synthases
  申请人：The Regents of the University of California

  公开号：US10233431B2

  公开（公告）日：2019-03-19

  The present invention provides for a polyketide synthase (PKS) capable of synthesizing a 3-hydroxycarboxylic acid or ketone. The present invention also provides for a host cell comprising the PKS and when cultured produces the 3-hydroxycarboxylic acid or ketone.

  本发明提供了一种能够合成3-羟基羧酸或酮的聚酮合酶（PKS）。本发明还提供了一种包含该PKS的宿主细胞，当培养时产生3-羟基羧酸或酮。