[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-2-[[羟基-[羟基-[3-羟基-2,2-二甲基-3-[2-[2-(2-苯基乙酰基)硫基乙基氨基甲酰]乙基氨基甲酰]丙氧基]磷酰]氧基-磷酰]氧基甲基]四氢呋喃-3-基]氧基膦酸 | 7532-39-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-2-[[羟基-[羟基-[3-羟基-2,2-二甲基-3-[2-[2-(2-苯基乙酰基)硫基乙基氨基甲酰]乙基氨基甲酰]丙氧基]磷酰]氧基-磷酰]氧基甲基]四氢呋喃-3-基]氧基膦酸
• 中文别名: 苯丙腈,5-氟-2-甲氧基-b-羰基-
• 英文名称: phenylacetyl-CoA
• 英文别名: S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] 2-phenylethanethioate
• CAS: 7532-39-0
• 化学式: C₂₉H₄₂N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 885.676
• InChiKey: ZIGIFDRJFZYEEQ-CECATXLMSA-N

物化性质

• 密度：
  1.79±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  甲醇（微溶）、水（微溶）
• 物理描述：
  Solid

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

制备方法与用途

苯乙酰辅酶A是一种受体氧化还原酶，也是膜结合的钼-铁-硫酶，参与反硝化细菌Thauera aromatica中苯丙氨酸的厌氧代谢。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  teicoplanin pseudoaglycone 、 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-2-[[羟基-[羟基-[3-羟基-2,2-二甲基-3-[2-[2-(2-苯基乙酰基)硫基乙基氨基甲酰]乙基氨基甲酰]丙氧基]磷酰]氧基-磷酰]氧基甲基]四氢呋喃-3-基]氧基膦酸 在 N-acyltransferase Orf₁₁ 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 6.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Multiple Complexes of Long Aliphatic N-Acyltransferases Lead to Synthesis of 2,6-Diacylated/2-Acyl-Substituted Glycopeptide Antibiotics, Effectively Killing Vancomycin-Resistant Enterococcus

  摘要：

  Teicoplanin A2-2 (Tei)/A40926 is the last-line antibiotic to treat multidrug-resistant Gram-positive bacterial infections, e.g., methicillinresistant Staphylococcus aurcus (MRSA) and vancomycin-resistant enterococcus (VRE). This class of antibiotics is powered by the N-acyltransferase (NAT) Orf11*/Dbv8 through N-acylation on glucosamine at the central residue of Tei/A40926 pseudoaglycone. The NAT enzyme possesses enormous value in untapped applications; its advanced development is hampered largely due to a lack of structural information. In this report, we present eight high-resolution X-ray crystallographic unary, binary, and ternary complexes in order to decipher the molecular basis for NAT's functionality. The enzyme undergoes a multistage conformational change upon binding of acyl-CoA, thus allowing the uploading of Tei pseudoaglycone to enable the acyl-transfer reaction to take place in the occlusion between the N- and C-halves of the protein. The acyl moiety of acyl-CoA can be bulky or lengthy, allowing a large extent of diversity in new derivatives that can be formed upon its transfer. Vancomycin/synthetic acyl-N-acetyl cysteamine was not expected to be able to serve as a surrogate for an acyl acceptor/donor, respectively. Most strikingly, NAT can catalyze formation of 2-N,6-O-diacylated or C6 -> C2 acyl-substituted Tei analogues through an unusual 1,4-migration mechanism under stoichiometric/solvational reaction control, wherein selected representatives showed excellent biological activities, effectively counteracting major types (VanABC) of VRE.

  DOI：

  10.1021/ja504125v
• 作为产物：
  描述：

  sodium phenylphyruvate 、 辅酶 A 在 recombinant dihydrolipoyl dehydrogenase 、 recombinant orf1 pyruvate dehydrogenase 、 recombinant orf2 pyruvate dehydrogenase 、 焦磷酸硫胺素 、 3-(aminocarbonyl)-1-[5-O-[[1-(6-amino-9H-purin-9-yl)-1-deoxy-β-D-ribofuranos-5-O-yl]phosphonyloxy(oxylato)phosphinyl]-β-L-ribofuranosyl]pyridinium 、 magnesium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-2-[[羟基-[羟基-[3-羟基-2,2-二甲基-3-[2-[2-(2-苯基乙酰基)硫基乙基氨基甲酰]乙基氨基甲酰]丙氧基]磷酰]氧基-磷酰]氧基甲基]四氢呋喃-3-基]氧基膦酸
  参考文献：
  名称：

  N-苯乙酰化和非核糖体肽合成酶，可用于七肽变体JBIR-78和JBIR-95的生物合成

  摘要：

  JBIR-78（1）和JBIR-95（2），它们都是从Kibdelosporangium sp。分离的七肽衍生物。AK-AA56，除了第二个氨基酸外，具有相同的氨基酸序列：苯乙酸（Paa）–l -Val– d -Asp（1）/ d-半胱氨酸（2）–l -Ala–（3 S） -3-羟基-d -Leu–Gly– d -Ala – l -Phe。的生物合成基因簇包括编码非核糖体肽合成酶（NRPS）的基因的异源表达和体外用重组ORF3测定，一个升-半胱氨酸合酶同源物，提示模块2中的单个A结构域同时激活1- Asp和1-半胱氨酸，分别产生1和2，尽管NRPSs A结构域的底物特异性通常很严格。还研究了引入N末端Paa的生物合成机理。与丙酮酸脱氢酶复合物的亚基相似的重组Orf1和Orf2催化了丙酮酸苯酯与编码基因位于基因簇外部的二氢脂酰脱氢酶一起转化为苯乙酰辅酶A。此外，我们表明苯乙酰辅酶A与1可以直

  DOI：

  10.1021/acschembio.7b00314

文献信息

• [EN] MICROORGANISMS FOR PRODUCING 4C-5C COMPOUNDS WITH UNSATURATION AND METHODS RELATED THERETO<br/>[FR] MICRO-ORGANISMES POUR LA PRODUCTION DE COMPOSÉS EN 4C-5 C AVEC UNE INSATURATION ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS
  申请人：GENOMATICA INC

  公开号：WO2016004334A1

  公开（公告）日：2016-01-07

  The invention provides a non-naturally occurring microbial organism having a butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol, pathway. The microbial organism contains at least one exogenous nucleic acid encoding an enzyme in a pathway. The invention additionally provides a method for producing butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol,. The method can include culturing a butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol-producing microbial organism, where the microbial organism expresses at least one exogenous nucleic acid encoding a pathway enzyme in a sufficient amount, and under conditions and for a sufficient period of time to produce butadiene, crotyl alcohol, 2,4-pentadienoate, 3-buten-2-ol, or 3-buten-1-ol.

  该发明提供了一种具有丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇途径的非自然微生物生物体。该微生物生物体含有至少一个编码途径中酶的外源核酸。该发明还提供了一种生产丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇的方法。该方法可以包括培养一种生产丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇的微生物生物体，其中该微生物生物体表达至少一个编码途径酶的外源核酸，且在足够的量下，在适当的条件和足够的时间内产生丁二烯、丁烯醇、2,4-戊二烯酸酯、3-丁烯-2-醇或3-丁烯-1-醇。
• MICROORGANISMS AND METHODS FOR PRODUCTION OF 4-HYDROXYBUTYRATE, 1,4-BUTANEDIOL AND RELATED COMPOUNDS
  申请人：Genomatica, Inc.

  公开号：US20150148513A1

  公开（公告）日：2015-05-28

  The invention provides non-naturally occurring microbial organisms having a 4-hydroxybutyrate, 1,4-butanediol, or other product pathway and being capable of producing 4-hydroxybutyrate, 1,4-butanediol, or other product, wherein the microbial organism comprises one or more genetic modifications. The invention additionally provides methods of producing 4-hydroxybutyrate, 1,4-butanediol, or other product or related products using the microbial organisms.

  该发明提供了具有4-羟基丁酸、1,4-丁二醇或其他产物途径并能够产生4-羟基丁酸、1,4-丁二醇或其他产物的非自然微生物生物体，其中该微生物生物体包括一个或多个基因修饰。该发明还提供了利用这些微生物生物体生产4-羟基丁酸、1,4-丁二醇或其他产物或相关产品的方法。
• Transacylases of the paclitaxel biosynthetic pathway
  申请人：Washington State University Research Foundation

  公开号：US20030108891A1

  公开（公告）日：2003-06-12

  Transacylase enzymes and the use of such enzymes to produce paclitaxel and related taxoids, as well as intermediates in the paclitaxel biosynthetic pathway, are disclosed. Also disclosed are nucleic acid sequences encoding such transacylase enzymes such as (but without limitation) C-13 phenylpropanoid side chain-CoA acyltransferase and benzoyl-CoA:3′-N-debenzoyl-2′-deoxytaxol N-benzoyltransferase.

  揭示了转酰化酶酶及其用于生产紫杉醇及相关紫杉类化合物的用途，以及紫杉醇生物合成途径中的中间产物。还揭示了编码这些转酰化酶酶的核酸序列，如C-13苯丙烷基侧链-CoA酰基转移酶和苯甲酰-CoA:3'-N-去苯甲酰-2'-去氧紫杉醇N-苯甲酰转移酶（但不限于这些）。
• Isolation from bovine liver mitochondria and characterization of three distinct carboxylic acid:CoA ligases with activity toward xenobiotics
  作者：Donald A. Vessey、Jie Hu

  DOI：10.1002/jbt.2570100608

  日期：1995.10

  was fractionated on a DEAE-cellulose column into four distinct acyl-CoA ligase fractions. First to elute was a 50 kDa short-chain ligase that activated only short-chain fatty acids. Next to elute were three ligases that had activity toward both medium-chain fatty acids and xenobiotic carboxylic acids; these were termed xenobiotic/medium-chain ligases (X-ligases) and labeled XL-I, XL-II, and XL-III, respectively

  将线粒体冷冻/解冻裂解物在DEAE-纤维素柱上分离成四个不同的酰基-CoA连接酶馏分。首先洗脱的是一个仅激活短链脂肪酸的50 kDa短链连接酶。紧随其后的是三种对中链脂肪酸和异种羧酸都具有活性的连接酶。根据洗脱顺序，这些分别称为异种/中链连接酶（X-连接酶）并标记为XL-1，XL-II和XL-III。X-连接酶I，II和III的分子量约为。55,000、55,500和53,000。XL-III型没有最佳pH值。从pH值7.0开始，速率稳定增加。XL-I和XL-II在以苯甲酸酯为底物时表现出相同的行为，但在中链脂肪酸中，两种形式的pH最佳均为8.8。三种X连接酶的底物特异性不同。XL-1是主要的烟酸活化形式，对苯甲酸酯的Km最低。XL-II形式是唯一可测量的水杨酸盐活性的形式，尽管它的含量极低。XL-III是唯一的2,4,6,8-癸二烯酸活化形式，也是主要的中链脂肪酸活化形式。通过比较底物特
• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建