(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)-4-methoxyoxolan-3-ol

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)-4-methoxyoxolan-3-ol
• 化学式: C₁₁H₁₅N₅O₄
• 分子量: 281.27
• InChiKey: FPUGCISOLXNPPC-GZCUOZMLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

文献信息

• VERFAHREN ZUR AMPLIFIKATION VON NUKLEINSÄUREN UND KIT ZU DESSEN DURCHFÜHRUNG
  申请人：AGCT GmbH

  公开号：EP3287528A1

  公开（公告）日：2018-02-28

  Offenbart wird ein Verfahren zur Amplifikation von Nukleinsäuren, bei dem im Wesentlichen davon Gebrauch gemacht wird, dass eine vordefinierte Nukleinsäurekette (Zielsequenz) in Anwesenheit eines zielsequenzspezifischen Aktivator-Oligonukleotides vervielfältigt / amplifiziert werden kann. Das zielsequenzspezifische Aktivator-Oligonukleotid bewirkt die Trennung von neu synthetisierten komplementären Primer-Verlängerungsprodukten mittels Strangverdrängung, so dass sich an dem jeweiligen Matrizenstrang ein neues Primer-Oligonukleotid anlagern kann. Der so gebildete Komplex aus einem Primer-Oligonukleotid und einem Matrizenstrang kann eine neue Primer-Verlängerungsreaktion initiieren. Die so gebildeten Primer-Verlängerungsprodukte dienen wiederum als Matrizen, so dass eine exponentiell ablaufende Amplifikationsreaktion resultiert. Das Aktivator-Oligonukleotid dient dabei selbst nicht als Matrize und ist vorzugsweise gegenüber einer Primer-Verlängerungs-Reaktion inert. Das Aktivator-Oligonukleotid dient als Kofaktor in der Reaktion, welcher den für die Reaktion notwendigen einzelsträngigen Zustand der relevanten Strang-Segmente der Matrizen regeneriert. Durch Verwendung eines Komponenten-Set, umfassend mindestens ein Primer-Oligonukleotid, mindestens eine Polymerase, ein Set von Substraten für Polymerase (z.B. dNTPs) und mindestens ein spezifisches Aktivator-Oligonukleotid kann eine zu amplifizierende Nukleinsäure linear amplifiziert werden. Durch Verwendung eines solchen Sets und eines zweiten Primer-Oligonukleotids, kann eine zu amplifizierende Nukleinsäure exponentiell amplifiziert werden, wobei resultierende spezifische Primer-Verlängerungsprodukte für weitere Primer-Verlängerungsreaktionen als Matrizen verwendet werden.

  本发明公开了一种用于核酸扩增的方法，该方法主要利用了这样一个事实，即在有目标序列特异性激活剂寡核苷酸存在的情况下，可以复制/扩增预定义的核酸链（目标序列）。目标序列特异性激活剂寡核苷酸通过链置换作用使新合成的互补引物扩增产物分离，从而使新的引物寡核苷酸可以连接到相应的模板链上。由引物寡核苷酸和模板链形成的复合物可以引发新的引物延伸反应。以这种方式形成的引物延伸产物反过来作为基质，导致指数扩增反应。 激活剂寡核苷酸本身不作为模板，最好对引物延伸反应是惰性的。激活剂寡核苷酸在反应中充当辅助因子，使反应所需的基质的相关链段再生为单链状态。 通过使用由至少一种引物寡核苷酸、至少一种聚合酶、一组聚合酶底物（如 dNTPs）和至少一种特异性激活剂寡核苷酸组成的元件组，可以线性扩增待扩增的核酸。 通过使用这样一组引物寡核苷酸和第二引物寡核苷酸，待扩增的核酸可呈指数扩增，由此产生的特异性引物延伸产物可用作进一步引物延伸反应的基质。
• VERFAHREN ZUM ANZEIGEN DES FORTSCHRITTES DER AMPLIFIKATION VON NUKLEINSÄUREN UND KIT ZU DESSEN DURCHFÜHRUNG
  申请人：AGCT GmbH

  公开号：EP3530755A1

  公开（公告）日：2019-08-28

  Offenbart wird ein Verfahren zur Detektion einer Amplifikation von Nukleinsäuren, bei dem im Wesentlichen davon Gebrauch gemacht wird, dass eine vordefinierte Nukleinsäurekette (Zielsequenz) in Anwesenheit eines zielsequenzspezifischen Aktivator-Oligonukleotides vervielfältigt/amplifiziert werden kann. Das zielsequenzspezifische Aktivator-Oligonukleotid bewirkt die Trennung von neu synthetisierten komplementären Primer-Verlängerungsprodukten mittels Strangverdrängung, so dass sich an dem jeweiligen Matrizenstrang ein neues Primer-Oligonukleotid anlagern kann. Der so gebildete Komplex aus einem Primer-Oligonukleotid und einem Matrizenstrang kann eine neue Primer-Verlängerungsreaktion initiieren. Die so gebildeten Primer-Verlängerungsprodukte dienen wiederum als Matrizen, so dass eine exponentiell ablaufende Amplifikationsreaktion resultiert. Nachgewiesen wird die Amplifikation durch ein Detektionssystem.

  本发明公开了一种检测核酸扩增的方法，该方法主要利用了这样一个事实，即在有靶序列特异性激活剂寡核苷酸存在的情况下，可以扩增/扩增预定义的核酸链（靶序列）。目标序列特异性激活剂寡核苷酸通过链置换作用使新合成的互补引物延伸产物分离，从而使新的引物寡核苷酸可以连接到相应的模板链上。由引物寡核苷酸和模板链形成的复合物可以引发新的引物延伸反应。以这种方式形成的引物延伸产物反过来作为基质，导致指数扩增反应。扩增反应由检测系统检测。
• VERFAHREN ZUR SELEKTIVEN AMPLIFIKATION VON NUKLEINSÄUREN UND KIT ZU DESSEN DURCHFÜHRUNG
  申请人：AGCT GmbH

  公开号：EP3530756A1

  公开（公告）日：2019-08-28

  Offenbart wird ein Verfahren zur Detektion einer Amplifikation von Nukleinsäuren, bei dem im Wesentlichen davon Gebrauch gemacht wird, dass eine vordefinierte Nukleinsäurekette (Zielsequenz) in Anwesenheit eines zielsequenzspezifischen Aktivator-Oligonukleotides vervielfältigt/amplifiziert werden kann. Das zielsequenzspezifische Aktivator-Oligonukleotid bewirkt die Trennung von neu synthetisierten komplementären Primer-Verlängerungsprodukten mittels Strangverdrängung, so dass sich an dem jeweiligen Matrizenstrang ein neues Primer-Oligonukleotid anlagern kann. Der so gebildete Komplex aus einem Primer-Oligonukleotid und einem Matrizenstrang kann eine neue Primer-Verlängerungsreaktion initiieren. Die so gebildeten Primer-Verlängerungsprodukte dienen wiederum als Matrizen, so dass eine exponentiell ablaufende Amplifikationsreaktion resultiert. Bei dem Verfahren wird eine selektive Amplifikation dadurch bewirkt, dass bei erstem, zweitem Primer sowie Aktivator Oligonukleotid Varianten eingesetzt werden, die sich in wenigstens einem Nukleotid von der Zielsequenz unterscheiden.

  本发明公开了一种检测核酸扩增的方法，该方法主要利用了这样一个事实，即在有靶序列特异性激活剂寡核苷酸存在的情况下，可以扩增/扩增预定义的核酸链（靶序列）。目标序列特异性激活剂寡核苷酸通过链置换作用使新合成的互补引物延伸产物分离，从而使新的引物寡核苷酸可以连接到相应的模板链上。由引物寡核苷酸和模板链形成的复合物可以引发新的引物延伸反应。以这种方式形成的引物延伸产物反过来作为基质，导致指数扩增反应。在此过程中，通过使用第一和第二引物及激活剂中至少有一个核苷酸与目标序列不同的寡核苷酸变体，可实现选择性扩增。
• VERFAHREN ZUR AMPLIFIKATION VON NUKLEINSÄUREN UND VERWENDUNG EINES KITS ZU DESSEN DURCHFÜHRUNG
  申请人：AGCT GmbH

  公开号：EP3504338B1

  公开（公告）日：2020-12-09
• EP3786306A1
  申请人：——

  公开号：EP3786306A1

  公开（公告）日：2021-03-03