(4-methyl-2-oxo-pentanoylamino)-acetic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (4-methyl-2-oxo-pentanoylamino)-acetic acid
• 英文别名: N-(4-methyl-2-oxo-valeryl)-glycine；N-(4-Methyl-2-oxo-valeryl)-glycin；(Isopropyl-pyruvyl)-glycin；(α-Oxo-isocaproylamino)-essigsaeure；2-[(4-Methyl-2-oxopentanoyl)amino]acetic acid；2-[(4-methyl-2-oxopentanoyl)amino]acetic acid
• 化学式: C₈H₁₃NO₄
• 分子量: 187.196
• InChiKey: AACGZYVCGJZNDM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  83.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-乙酰基半胱胺 、 (4-methyl-2-oxo-pentanoylamino)-acetic acid 在 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 16.0h， 以60%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Amino acid-accepting ketosynthase domain from a trans-AT polyketide synthase exhibits high selectivity for predicted intermediate

  摘要：

  反式酰基转移酶（AT）多酮苷合成酶是最近被确认的一类细菌酶，可生成复杂的多酮苷。重新设计这些研究较少的系统的先决条件是了解其组分的底物特异性。在这项研究中，来自紫杉烯多酮类化合物合成酶的 KS 结构域 1 被证明对 2-氨基乙酰基中间体具有高度特异性，这种中间体来自将 alpha 氨基酸加入到多酮类化合物链中。合成了全长底物的 N-乙酰半胱胺（SNAC）类似物，并与 KS1 结构域孵育。通过质谱分析（MS）发现，源自天然甘氨酸的酰基 SNAC 与 KS1 的酰化效率最高。丙氨酸变体也能与 KS1 结合，但其缬氨酸等效物却不能，这表明对 α 位取代的耐受性有限。在 0.5 mM 的标准检测浓度下，KS1 不接受 2 位上没有胺或酰胺氮取代的底物类似物。此外，通过定点突变将 Asn-206 从 KS1 的活性位点移除可使 kcat/Km 降低约 2 倍。这个残基在大多数已知的反式-AT PKS 的 2-氨基乙酰基接受 KS 结构域中都是保守的，因此我们推测 Asn-206 与底物的酰胺氮之间存在重要的相互作用。

  DOI：

  10.1039/c3sc50540e
• 作为产物：
  描述：

  4-甲基-2-氧代戊酸 在 N-甲基吗啉 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 (4-methyl-2-oxo-pentanoylamino)-acetic acid
  参考文献：
  名称：

  Amino acid-accepting ketosynthase domain from a trans-AT polyketide synthase exhibits high selectivity for predicted intermediate

  摘要：

  反式酰基转移酶（AT）多酮苷合成酶是最近被确认的一类细菌酶，可生成复杂的多酮苷。重新设计这些研究较少的系统的先决条件是了解其组分的底物特异性。在这项研究中，来自紫杉烯多酮类化合物合成酶的 KS 结构域 1 被证明对 2-氨基乙酰基中间体具有高度特异性，这种中间体来自将 alpha 氨基酸加入到多酮类化合物链中。合成了全长底物的 N-乙酰半胱胺（SNAC）类似物，并与 KS1 结构域孵育。通过质谱分析（MS）发现，源自天然甘氨酸的酰基 SNAC 与 KS1 的酰化效率最高。丙氨酸变体也能与 KS1 结合，但其缬氨酸等效物却不能，这表明对 α 位取代的耐受性有限。在 0.5 mM 的标准检测浓度下，KS1 不接受 2 位上没有胺或酰胺氮取代的底物类似物。此外，通过定点突变将 Asn-206 从 KS1 的活性位点移除可使 kcat/Km 降低约 2 倍。这个残基在大多数已知的反式-AT PKS 的 2-氨基乙酰基接受 KS 结构域中都是保守的，因此我们推测 Asn-206 与底物的酰胺氮之间存在重要的相互作用。

  DOI：

  10.1039/c3sc50540e

文献信息

• Dehydrooligopeptides. XX. Unusual Peptide Bond Cleavage of Dehydrotripeptide Esters Containing<i>α</i>-Dehydroamino Acid Residue at P₂by Using Papain
  作者：Chung-gi Shin、Kazushige Arai、Keitaro Hotta、Takeshi Kakusho

  DOI：10.1246/bcsj.70.1427

  日期：1997.6

  Enzymatic ester hydrolysis and coupling of various N-protected Δ2-dehydrotripeptide methyl esters (Boc–AA–ΔAA–AA–OMe) (4) by using protease papain in McIlvaine buffer are mainly described. The substrates (4) used were prepared by one-pot coupling of N-carboxy-α-dehydroamino acid anhydride (ΔAA·NCA) with N- and C-component l-α-amino acids (AA). Even in the enzymatic reaction of 4 containing an unusual ΔAA residue, the normal ester hydrolysis took place to give Boc–AA–ΔAA–AA–OH (6) and, in certain cases, the interesting unusual peptide bond cleavage at P2 of 6 occured further to give the unexpected N-(1,2-dioxoalkyl)–AA–OH. Besides examining in detail the differences between the enzymatic actions to the structures of 4, we also studied the mechanisms of the ester and peptide bond hydrolyses. As the results, the reverse enzymatic coupling of 4 with H–AA–ΔVal–OMe was first achieved to give dehydropentapeptide containing two ΔAA residues.

  主要介绍使用木瓜蛋白酶在McIlvaine缓冲液中对各种N-保护的Δ2-脱氢三肽甲酯（Boc–AA–ΔAA–AA–OMe）（4）进行酶促酯水解和偶联反应。所用的底物（4）是通过一步法偶联N-羧基-α-脱氢氨基酸酐（ΔAA·NCA）与N-和C-端l-α-氨基酸（AA）制备的。即使在含有不寻常ΔAA残基的4的酶反应中，正常的酯水解也会发生，得到Boc–AA–ΔAA–AA–OH（6），并且在某些情况下，进一步在6的P2位点发生有趣的非寻常肽键断裂，得到了意外的N-(1,2-二氧烷基)–AA–OH。除了详细研究酶对4结构作用的差异外，我们还探讨了酯和肽键水解的机制。结果表明，首次实现了4与H–AA–ΔVal–OMe的反向酶偶联，得到了含有两个ΔAA残基的脱氢五肽。
• Vinsova, Jarmila; Horak, Vaclav; Buchta, Vladimir, Molecules, 2005, vol. 10, # 3, p. 760 - 770
  作者：Vinsova, Jarmila、Horak, Vaclav、Buchta, Vladimir、Kaustova, Jarmila

  DOI：——

  日期：——
• Non-enzymatic Transamination between Peptides and Pyridoxal. Isolation of the 2,4-Dinitrophenylhydrazones of Some Ketopeptides
  作者：Carlo Cennamo、Biancarosa Carafoli、Erik P. Bonetti

  DOI：10.1021/ja01595a069

  日期：1956.7
• Goldschmidt et al., Justus Liebigs Annalen der Chemie, 1927, vol. 456, p. 16
  作者：Goldschmidt et al.

  DOI：——

  日期：——