methyl 2-((2-(4-bromophenyl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-yl)amino)acetate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl 2-((2-(4-bromophenyl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-yl)amino)acetate
• 英文别名: Methyl 2-((2-(4-bromophenyl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-yl)amino)acetate；methyl 2-[[2-(4-bromophenyl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-yl]amino]acetate
• 化学式: C₁₅H₁₃BrN₄O₂
• 分子量: 361.198
• InChiKey: AMYUCWUYHSWYBG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.13
• 拓扑面积：
  68.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  potassium (3,5-dimethylisoxazol-4-yl)(trifluoro)borate 、 methyl 2-((2-(4-bromophenyl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-yl)amino)acetate 在 palladium diacetate 、 sodium carbonate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 16.0h， 以56%的产率得到ethyl 2-((2-(4-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)phenyl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-yl)amino)acetate
  参考文献：
  名称：

  开发新型溴结构域抑制剂的偏向多组分反应

  摘要：

  BET 溴结构域抑制为基因调控提供了新的见解，并成为一种有前途的癌症治疗策略。早期甲基三唑并 BET 抑制剂的结构类比促使需要结构不同的配体作为溴结构域功能的探针。使用含氟标记的多组分反应，我们开发了一个围绕 3,5-二甲基异恶唑偏置元素和微摩尔生化 IC 50的溴结构域抑制剂的集中化学库。迭代合成和生化评估允许优化基于咪唑并 [1,2- a ] 吡嗪支架的新型 BET 溴结构域抑制剂。先导化合物32 (UMB-32) 以K d结合 BRD4在 BRD4 依赖性细胞系中的细胞效力分别为 550 nM 和 724 nM。此外，化合物32显示出对抗 TAF1 的效力，TAF1 是一种以前未被发现化学发现的含溴结构域的转录因子。化合物32与 BRD4 共结晶，得到分辨率为 1.56 埃的晶体结构。这项研究展示了氟和多组分化学合成在开发新型表观遗传抑制剂方面的新应用。

  DOI：

  10.1021/jm501120z
• 作为产物：
  描述：

  氨基吡嗪 、 异腈基乙酸甲酯 、 对溴苯甲醛 在 高氯酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 12.0h， 以58%的产率得到methyl 2-((2-(4-bromophenyl)imidazo[1,2-a]pyrazin-3-yl)amino)acetate
  参考文献：
  名称：

  开发新型溴结构域抑制剂的偏向多组分反应

  摘要：

  BET 溴结构域抑制为基因调控提供了新的见解，并成为一种有前途的癌症治疗策略。早期甲基三唑并 BET 抑制剂的结构类比促使需要结构不同的配体作为溴结构域功能的探针。使用含氟标记的多组分反应，我们开发了一个围绕 3,5-二甲基异恶唑偏置元素和微摩尔生化 IC 50的溴结构域抑制剂的集中化学库。迭代合成和生化评估允许优化基于咪唑并 [1,2- a ] 吡嗪支架的新型 BET 溴结构域抑制剂。先导化合物32 (UMB-32) 以K d结合 BRD4在 BRD4 依赖性细胞系中的细胞效力分别为 550 nM 和 724 nM。此外，化合物32显示出对抗 TAF1 的效力，TAF1 是一种以前未被发现化学发现的含溴结构域的转录因子。化合物32与 BRD4 共结晶，得到分辨率为 1.56 埃的晶体结构。这项研究展示了氟和多组分化学合成在开发新型表观遗传抑制剂方面的新应用。

  DOI：

  10.1021/jm501120z

文献信息

• INHIBITORS OF TRANSCRIPTION FACTORS AND USES THEREOF
  申请人：DANA-FARBER CANCER INSTITUTE, INC.

  公开号：US20160168154A1

  公开（公告）日：2016-06-16

  The present invention provides novel compounds of any one of Formulae (I) to (IV), and pharmaceutically compositions thereof. Compounds of any one of Formulae (I) to (IV) are believed to be inhibitors of bromodomain-containing proteins (e.g., bromo and extra terminal proteins (BETs)). Also provided are methods, uses, and kits using the inventive compounds and pharmaceutical compositions for inhibiting the activity of the bromodomain-containing proteins and for treating and/or preventing in a subject in need thereof diseases associated with bromodomain-containing proteins, such as proliferative diseases.

  本发明提供了任一式（I）至（IV）的新型化合物及其药物组合物。相信任一式（I）至（IV）的化合物是含有溴域的蛋白质（例如，溴域和额外末端蛋白质（BETs））的抑制剂。还提供了使用这些创新化合物和药物组合物的方法、用途和工具包，用于抑制含有溴域的蛋白质的活性，并用于治疗和/或预防与含有溴域的蛋白质相关的疾病，例如增生性疾病。
• [EN] INHIBITORS OF TRANSCRIPTION FACTORS AND USES THEREOF<br/>[FR] INHIBITEURS DES FACTEURS DE TRANSCRIPTION ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2015013635A3

  公开（公告）日：2015-04-02
• US9975896B2
  申请人：——

  公开号：US9975896B2

  公开（公告）日：2018-05-22
• Biased Multicomponent Reactions to Develop Novel Bromodomain Inhibitors
  作者：Michael R McKeown、Daniel L Shaw、Harry Fu、Shuai Liu、Xiang Xu、Jason J Marineau、Yibo Huang、Xiaofeng Zhang、Dennis L Buckley、Asha Kadam、Zijuan Zhang、Stephen C Blacklow、Jun Qi、Wei Zhang、James E Bradner

  DOI：10.1021/jm501120z

  日期：2014.11.13

  BET bromodomain inhibition has contributed new insights into gene regulation and emerged as a promising therapeutic strategy in cancer. Structural analogy of early methyl-triazolo BET inhibitors has prompted a need for structurally dissimilar ligands as probes of bromodomain function. Using fluorous-tagged multicomponent reactions, we developed a focused chemical library of bromodomain inhibitors around

  BET 溴结构域抑制为基因调控提供了新的见解，并成为一种有前途的癌症治疗策略。早期甲基三唑并 BET 抑制剂的结构类比促使需要结构不同的配体作为溴结构域功能的探针。使用含氟标记的多组分反应，我们开发了一个围绕 3,5-二甲基异恶唑偏置元素和微摩尔生化 IC 50的溴结构域抑制剂的集中化学库。迭代合成和生化评估允许优化基于咪唑并 [1,2- a ] 吡嗪支架的新型 BET 溴结构域抑制剂。先导化合物32 (UMB-32) 以K d结合 BRD4在 BRD4 依赖性细胞系中的细胞效力分别为 550 nM 和 724 nM。此外，化合物32显示出对抗 TAF1 的效力，TAF1 是一种以前未被发现化学发现的含溴结构域的转录因子。化合物32与 BRD4 共结晶，得到分辨率为 1.56 埃的晶体结构。这项研究展示了氟和多组分化学合成在开发新型表观遗传抑制剂方面的新应用。