O-(4-azidobutyl)hydroxylamine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机1,3-偶极化合物 - 烯丙基型1,3-偶极有机化合物
• 英文名称: O-(4-azidobutyl)hydroxylamine
• 化学式: C₄H₁₀N₄O
• 分子量: 130.15
• InChiKey: ARIAPHRPEUTXSO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  49.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O-(4-azidobutyl)hydroxylamine 、 4-甲氧基三苯基氯甲烷 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以84%的产率得到O-(4-azidobutyl)-N-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethyl]hydroxylamine
  参考文献：
  名称：

  5-甲酰基胞嘧啶可能是特定基因组位点的半永久性碱基

  摘要：

  5-甲酰基-2'-脱氧胞嘧啶（fdC）是干细胞基因组中最近发现的表观遗传基础，其功能尚不清楚。测序数据表明，该碱基在启动子的CpG岛中富集，因此可能参与细胞分化过程中的转录调控。已知fdC可被胸腺嘧啶DNA糖基化酶（Tdg）识别和切除。因此，据信fdC在活性脱甲基过程中起中间体的作用。为了了解新的表观遗传基础fdC的功能，重要的是分析其在确定的基因组位点的形成和去除。在这里，我们报告了一种新的方法，该方法将fdC的序列特定化学衍生化与液滴数字PCR相结合，从而实现了这种分析。我们显示初始数据，

  DOI：

  10.1002/anie.201605994
• 作为产物：
  描述：

  2-(2-azidobutoxy)isoindoline-1,3-dione 在 一水合肼 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 24.0h， 以1.81 g的产率得到O-(4-azidobutyl)hydroxylamine
  参考文献：
  名称：

  5-甲酰基胞嘧啶可能是特定基因组位点的半永久性碱基

  摘要：

  5-甲酰基-2'-脱氧胞嘧啶（fdC）是干细胞基因组中最近发现的表观遗传基础，其功能尚不清楚。测序数据表明，该碱基在启动子的CpG岛中富集，因此可能参与细胞分化过程中的转录调控。已知fdC可被胸腺嘧啶DNA糖基化酶（Tdg）识别和切除。因此，据信fdC在活性脱甲基过程中起中间体的作用。为了了解新的表观遗传基础fdC的功能，重要的是分析其在确定的基因组位点的形成和去除。在这里，我们报告了一种新的方法，该方法将fdC的序列特定化学衍生化与液滴数字PCR相结合，从而实现了这种分析。我们显示初始数据，

  DOI：

  10.1002/anie.201605994

文献信息

• 5‐Formylcytosine Could Be a Semipermanent Base in Specific Genome Sites
  作者：Meng Su、Angie Kirchner、Samuele Stazzoni、Markus Müller、Mirko Wagner、Arne Schröder、Thomas Carell

  DOI：10.1002/anie.201605994

  日期：2016.9.19

  epigenetic base fdC, it is important to analyze its formation and removal at defined genomic sites. Here, we report a new method that combines sequence‐specific chemical derivatization of fdC with droplet digital PCR that enables such analysis. We show initial data, indicating that the repair protein Tdg removes only 50 % of the fdCs at a given genomic site, arguing that fdC is a semipermanent base.

  5-甲酰基-2'-脱氧胞嘧啶（fdC）是干细胞基因组中最近发现的表观遗传基础，其功能尚不清楚。测序数据表明，该碱基在启动子的CpG岛中富集，因此可能参与细胞分化过程中的转录调控。已知fdC可被胸腺嘧啶DNA糖基化酶（Tdg）识别和切除。因此，据信fdC在活性脱甲基过程中起中间体的作用。为了了解新的表观遗传基础fdC的功能，重要的是分析其在确定的基因组位点的形成和去除。在这里，我们报告了一种新的方法，该方法将fdC的序列特定化学衍生化与液滴数字PCR相结合，从而实现了这种分析。我们显示初始数据，