thymidine 3',5'-bis[2-(5-bromo-2-nitrophenyl)propyl carbonate]

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: thymidine 3',5'-bis[2-(5-bromo-2-nitrophenyl)propyl carbonate]
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-3-[2-(5-bromo-2-nitrophenyl)propoxycarbonyloxy]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl 2-(5-bromo-2-nitrophenyl)propyl carbonate
• 化学式: C₃₀H₃₀Br₂N₄O₁₃
• 分子量: 814.395
• InChiKey: ATYRLOZBBQIGIA-FNERBQMGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.1
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  221
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N-(3-ethylphenyl)acetamide 在 吡啶 、 硫酸 、 potassium tert-butylate 、 氢溴酸 、 硝酸 、 三乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 13.5h， 生成 thymidine 3',5'-bis[2-(5-bromo-2-nitrophenyl)propyl carbonate]
  参考文献：
  名称：

  基于[2-（2-硝基苯基）丙氧基]羰基（NPPOC）部分的新型高效光不稳定保护基

  摘要：

  基于光不稳定的[2-（2-硝基苯基）丙氧基]羰基（NPPOC），大量修饰的2-（2-硝基苯基）丙醇衍生物在苯环上被取代（参见23 – 34和57 – 76），以及在侧链上（见85 – 92和95 – 98）被合成以改善这种新型的光不稳定实体的光反应性。苯基部分也被萘基（请参阅102、103、105、108、110、113和114），噻吩基取代基（请参阅115、117、118和120）和苯并噻吩基取代基（请参见115、117、118和113）进行交换。121）。的2-（2- nitroaryl-和杂芳基）丙醇转化用双光气成相应carbonochloridates，其与胸苷随后反应胸苷5' - （被保护的碳酸酯）123 - 178作为主要的反应产物。在某些情况下，相应的3'-碳酸酯和3'，5'-二碳酸酯179 – 212也被分离出来并进行了表征。在标准条件下的光解研究（见表）表明，光裂解的速率

  DOI：

  10.1002/hlca.200490060

文献信息

• Nucleoside derivatives with photolabile protective groups
  申请人：——

  公开号：US20020146737A1

  公开（公告）日：2002-10-10

  The invention relates to nucleoside derivatives with photolabile protecting groups of general formula (I), where R 1 =H, F, Cl, Br, I, NO 2 ; R 2 =H, CN, where R 1 and R 2 are not simultaneously H; R 3 =H, 1-4 C alkyl, phenyl; R 4 =H or a conventional functional group for the synthesis of oligonucleotides; R 5 =H, OH, halogen or XR 6 , where X=O or S and R 6 =a conventional nucleotide protecting group; B=adenine, cytosine, guanine, thymine, uracil, 2,6-diaminopurin-9-yl, hypoxanthin-9-yl, 5-methylcytosin-1-yl, 5-amino-4-imidazolcarboxamid-1-yl or 5-amino-4-imidazolcarboxamid-3-yl, where, if B=adenine, cytosine or guanine the primary amine functionality, optionally, carries a permanent protecting group. Furthermore, these derivatives may be used for the light-controlled synthesis of oligonucleotides on a DNA chip.

  该发明涉及具有一般式(I)的光敏保护基团的核苷类衍生物，其中R1=H、F、Cl、Br、I、NO2；R2=H、CN，其中R1和R2不同时为H；R3=H、1-4 C 烷基、苯基；R4=H或用于寡核苷酸合成的常规功能基团；R5=H、OH、卤素或XR6，其中X=O或S，R6=常规核苷酸保护基团；B=腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、2,6-二氨基嘌呤-9-基、次嘌呤-9-基、5-甲基胞嘧啶-1-基、5-氨基-4-咪唑甲酰胺-1-基或5-氨基-4-咪唑甲酰胺-3-基，其中，如果B=腺嘌呤、胞嘧啶或鸟嘌呤，那么主要胺官能团可选择携带永久保护基。此外，这些衍生物可以用于在DNA芯片上进行光控合成寡核苷酸。
• NUCLEOSID-DERIVATE MIT PHOTOLABILEN SCHUTZGRUPPEN
  申请人：NIGU CHEMIE GMBH

  公开号：EP1224198A1

  公开（公告）日：2002-07-24
• US6750335B2
  申请人：——

  公开号：US6750335B2

  公开（公告）日：2004-06-15
• [DE] NUCLEOSID-DERIVATE MIT PHOTOLABILEN SCHUTZGRUPPEN<br/>[EN] NUCLEOSIDE DERIVATIVES WITH PHOTOLABILE PROTECTING GROUPS<br/>[FR] DERIVES DE NUCLEOSIDES A GROUPES PROTECTEURS PHOTOLABILES
  申请人：NIGU CHEMIE GMBH

  公开号：WO2001032671A1

  公开（公告）日：2001-05-10

  Die Erfindung betrifft Nucleosid-Derivate mit photolabilen Schutzgruppen der allgemeinen Formel (I) mit R1 = H, F, C1, Br, I, NO¿2; R?2 = H, CN, wobei R?1 und R2¿ nicht gleichzeitig H sind; R3 = H, Alkylrest mit 1 bis 4 C-Atomen, Phenyl R4 = H oder eine übliche funktionelle Gruppe zur Herstellung von Oligonucleotiden, R5 = H, OH, Halogen oder XR6, wobei X = O oder S und R6 eine in der Nucleotidchemie übliche Schutzgruppe darstellt, B = Adenin, Cytosin, Guanin, Thymin, Uracil, 2,6-Diaminopurin-9-yl, Hypoxanthin-9-yl, 5-Methylcytosin-1-yl, 5-Amino-4-imidazolcarbonsäureamid-1-yl oder 5-Amino-4-imidazolcarbonsäureamid-3-yl, wobei im Falle von B = Adenin, Cytosin oder Guanin die primäre Aminofunktion ggf. eine permanente Schutzgruppe aufweist. Diese Derivate können für die lichtgesteuerte Synthese von Oligonucleotiden auf einem DNA-Chip verwendet werden.
• New Types of Very Efficient Photolabile Protecting Groups Based upon the[2-(2-Nitrophenyl)propoxy]carbonyl (NPPOC) Moiety
  作者：Sigrid Bühler、Irene Lagoja、Heiner Giegrich、Klaus-Peter Stengele、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.200490060

  日期：2004.3

  in a broad range depending on the substituents. So far, the thymidine 5′-[2-(5-halo-2-nitrophenyl)propyl carbonates] 127–129, 5′-[2-(nitro[1,1′-biphenyl]3-yl)propyl carbonates] 136–139, 5′-2-[2-nitro-5-(thianthren-1-yl)phenyl]propyl carbonate} (140), 5′-[2-(5-naphthalenyl-2-nitrophenyl)propyl carbonates] 141 and 142, and 5′-[2-(2-nitro-5-thienylphenyl)propyl carbonates] 143 and 144 showed the best

  基于光不稳定的[2-（2-硝基苯基）丙氧基]羰基（NPPOC），大量修饰的2-（2-硝基苯基）丙醇衍生物在苯环上被取代（参见23 – 34和57 – 76），以及在侧链上（见85 – 92和95 – 98）被合成以改善这种新型的光不稳定实体的光反应性。苯基部分也被萘基（请参阅102、103、105、108、110、113和114），噻吩基取代基（请参阅115、117、118和120）和苯并噻吩基取代基（请参见115、117、118和113）进行交换。121）。的2-（2- nitroaryl-和杂芳基）丙醇转化用双光气成相应carbonochloridates，其与胸苷随后反应胸苷5' - （被保护的碳酸酯）123 - 178作为主要的反应产物。在某些情况下，相应的3'-碳酸酯和3'，5'-二碳酸酯179 – 212也被分离出来并进行了表征。在标准条件下的光解研究（见表）表明，光裂解的速率