methyl 4-(6-bromo-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: methyl 4-(6-bromo-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzoate
• 英文别名: methyl 4-(6-bromo-1H-benzimidazol-2-yl)benzoate
• 化学式: C₁₅H₁₁BrN₂O₂
• 分子量: 331.169
• InChiKey: BAOURYZGDRVTKL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.07
• 拓扑面积：
  55
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 4-(6-bromo-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzoate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 4.0h， 以80%的产率得到4-(6-bromo-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzoic acid
  参考文献：
  名称：

  虚拟筛选鉴定和化学优化的取代2-芳基苯并咪唑类新的非锌结合MMP-2抑制剂。

  摘要：

  基质金属蛋白酶（MMPs）是锌依赖性内切蛋白酶的一大家族，已知在肿瘤的进展和侵袭性中起多种调节作用。多年来，这鼓励了针对抗癌治疗的MMP，尤其是MMP-2的方法。由于在临床上出现毒性和其他缺陷，基于（假）肽支架组装的非特异性锌结合基（ZBGs）的MMP抑制剂的早期世代已被中止，这为有或没有锌螯合剂部分的抑制剂铺平了道路。结合催化锌离子。在本文中，我们继续寻找新的非锌结合性MMP-2抑制剂：利用先前鉴定的化合物，开展了虚拟筛选（VS）运动，并导致了新一类配体的鉴定。通过合成几种类似物来探索苯并咪唑支架的构效关系（SAR），这些类似物的抑制活性已通过酶抑制试验进行了测试。通过执行分子简化方法，我们公开了不同组的MMP-2单位数微摩尔抑制剂，与所选先导化合物相比，抑制活性和对脱靶MMP-8的选择性提高了多达十倍。对具有对接的特权结构的MMP-2配合物进行的分子动力学计算证实，分析的抑制剂可避免靶

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2019.115257
• 作为产物：
  描述：

  4-氯甲酰基苯甲酸甲酯 、 4-溴邻苯二胺 在 吡啶 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 5,5-dimethyl-1,3-cyclohexadiene 为溶剂， 以52%的产率得到methyl 4-(6-bromo-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzoate
  参考文献：
  名称：

  虚拟筛选鉴定和化学优化的取代2-芳基苯并咪唑类新的非锌结合MMP-2抑制剂。

  摘要：

  基质金属蛋白酶（MMPs）是锌依赖性内切蛋白酶的一大家族，已知在肿瘤的进展和侵袭性中起多种调节作用。多年来，这鼓励了针对抗癌治疗的MMP，尤其是MMP-2的方法。由于在临床上出现毒性和其他缺陷，基于（假）肽支架组装的非特异性锌结合基（ZBGs）的MMP抑制剂的早期世代已被中止，这为有或没有锌螯合剂部分的抑制剂铺平了道路。结合催化锌离子。在本文中，我们继续寻找新的非锌结合性MMP-2抑制剂：利用先前鉴定的化合物，开展了虚拟筛选（VS）运动，并导致了新一类配体的鉴定。通过合成几种类似物来探索苯并咪唑支架的构效关系（SAR），这些类似物的抑制活性已通过酶抑制试验进行了测试。通过执行分子简化方法，我们公开了不同组的MMP-2单位数微摩尔抑制剂，与所选先导化合物相比，抑制活性和对脱靶MMP-8的选择性提高了多达十倍。对具有对接的特权结构的MMP-2配合物进行的分子动力学计算证实，分析的抑制剂可避免靶

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2019.115257

文献信息

• De novo Design of SARS-CoV-2 Main Protease Inhibitors
  作者：Nynke A. Vepřek、Zisis Peitsinis、Yingkai Zhang、Dirk Trauner、Christian Fischer、Klaus-Peter Rühmann、Chao Yang、Jessica N. Spradlin、Dustin Dovala、Daniel K. Nomura

  DOI：10.1055/a-1582-0243

  日期：2022.3

  conserved among coronaviruses, it has emerged as a prime target for developing inhibitors. Using a combination of virtual screening and molecular modeling, we identified small molecules that were easily accessible and could be quickly diversified. Biochemical assays confirmed a class of pyridones as low micromolar noncovalent inhibitors of the viral main protease.

  COVID-19 大流行促使许多科学家研究针对 SARS-CoV-2 和未来可能出现的相关病毒的治疗方法。作为病毒的主要蛋白酶 MPro 在冠状病毒中高度保守，因此它已成为开发抑制剂的主要目标。通过结合虚拟筛选和分子建模，我们鉴定了易于获取且可以快速多样化的小分子。生化测定证实一类吡啶酮是病毒主要蛋白酶的低微摩尔非共价抑制剂。