2-(5-amino-2-hydroxyphenyl)isonicotinic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: 2-(5-amino-2-hydroxyphenyl)isonicotinic acid
• 英文别名: 2-(5-Azanyl-2-Oxidanyl-Phenyl)pyridine-4-Carboxylic Acid；2-(5-amino-2-hydroxyphenyl)pyridine-4-carboxylic acid
• 化学式: C₁₂H₁₀N₂O₃
• 分子量: 230.223
• InChiKey: BJCZMMOGTXVENP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  96.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(5-amino-2-hydroxyphenyl)isonicotinic acid 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 C₁₉H₁₄N₂O₅
  参考文献：
  名称：

  片段对接和连接以发现十文字组蛋白去甲基化酶抑制剂

  摘要：

  抑制 Jumonji 去甲基酶的工具分子的开发可以用于研究癌症相关的转录。虽然 2,4-吡啶二甲酸 (2,4-PDCA) 等支架是有效的抑制剂，但它们的选择性有限。为了发现 KDM4 去甲基酶（几种癌症中过度表达的酶）的新抑制剂，我们将包含 600 000 个片段的文库对接到 KDM4A 的高分辨率结构中。最有趣的化学型是 5-氨基水杨酸盐​​，它以两个不同但重叠的方向对接。对接姿势为共价连接片段化合物的设计提供了信息，并进一步衍生化。这种组合方法将亲和力提高了约 3 个对数级，得到化合物35 ( K = 43 nM)。几种杂合抑制剂对 KDM4C 的选择性高于相关酶 FIH、KDM2A 和 KDM6B，但对 KDM3 和 KDM5 亚家族缺乏选择性。共晶结构证实了对接预测。这项研究将基于结构的对接的使用从片段发现扩展到片段连接优化，产生了新型 KDM4 抑制剂。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b01527
• 作为产物：
  描述：

  2-溴吡啶-4-甲酸甲酯 在 氢溴酸 、 caesium carbonate 、 sodium iodide 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 116.0h， 生成 2-(5-amino-2-hydroxyphenyl)isonicotinic acid 、 C₁₃H₁₂N₂O₃
  参考文献：
  名称：

  片段对接和连接以发现十文字组蛋白去甲基化酶抑制剂

  摘要：

  抑制 Jumonji 去甲基酶的工具分子的开发可以用于研究癌症相关的转录。虽然 2,4-吡啶二甲酸 (2,4-PDCA) 等支架是有效的抑制剂，但它们的选择性有限。为了发现 KDM4 去甲基酶（几种癌症中过度表达的酶）的新抑制剂，我们将包含 600 000 个片段的文库对接到 KDM4A 的高分辨率结构中。最有趣的化学型是 5-氨基水杨酸盐​​，它以两个不同但重叠的方向对接。对接姿势为共价连接片段化合物的设计提供了信息，并进一步衍生化。这种组合方法将亲和力提高了约 3 个对数级，得到化合物35 ( K = 43 nM)。几种杂合抑制剂对 KDM4C 的选择性高于相关酶 FIH、KDM2A 和 KDM6B，但对 KDM3 和 KDM5 亚家族缺乏选择性。共晶结构证实了对接预测。这项研究将基于结构的对接的使用从片段发现扩展到片段连接优化，产生了新型 KDM4 抑制剂。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b01527

文献信息

• Docking and Linking of Fragments To Discover Jumonji Histone Demethylase Inhibitors
  作者：Magdalena Korczynska、Daniel D. Le、Noah Younger、Elisabet Gregori-Puigjané、Anthony Tumber、Tobias Krojer、Srikannathasan Velupillai、Carina Gileadi、Radosław P. Nowak、Eriko Iwasa、Samuel B. Pollock、Idelisse Ortiz Torres、Udo Oppermann、Brian K. Shoichet、Danica Galonić Fujimori

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.5b01527

  日期：2016.2.25

  Development of tool molecules that inhibit Jumonji demethylases allows for the investigation of cancer-associated transcription. While scaffolds such as 2,4-pyridinedicarboxylic acid (2,4-PDCA) are potent inhibitors, they exhibit limited selectivity. To discover new inhibitors for the KDM4 demethylases, enzymes overexpressed in several cancers, we docked a library of 600 000 fragments into the high-resolution

  抑制 Jumonji 去甲基酶的工具分子的开发可以用于研究癌症相关的转录。虽然 2,4-吡啶二甲酸 (2,4-PDCA) 等支架是有效的抑制剂，但它们的选择性有限。为了发现 KDM4 去甲基酶（几种癌症中过度表达的酶）的新抑制剂，我们将包含 600 000 个片段的文库对接到 KDM4A 的高分辨率结构中。最有趣的化学型是 5-氨基水杨酸盐​​，它以两个不同但重叠的方向对接。对接姿势为共价连接片段化合物的设计提供了信息，并进一步衍生化。这种组合方法将亲和力提高了约 3 个对数级，得到化合物35 ( K = 43 nM)。几种杂合抑制剂对 KDM4C 的选择性高于相关酶 FIH、KDM2A 和 KDM6B，但对 KDM3 和 KDM5 亚家族缺乏选择性。共晶结构证实了对接预测。这项研究将基于结构的对接的使用从片段发现扩展到片段连接优化，产生了新型 KDM4 抑制剂。