辅酶 A S-丁酸酯 | 2140-48-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 中文名称: 辅酶 A S-丁酸酯
• 中文别名: 辅酶AS-丁酸酯
• 英文名称: butyryl coenzyme A
• 英文别名: butyryl-CoA；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] butanethioate
• CAS: 2140-48-9
• 化学式: C₂₅H₄₂N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 837.632
• InChiKey: CRFNGMNYKDXRTN-CITAKDKDSA-N

物化性质

• 碰撞截面：
  252.9 Ų [M+H]+ [CCS Type: DT, Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.8
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  辅酶 A S-丁酸酯 在 phosphate buffer 、 short-chain acyl-CoA dehydrogenase (from Megasphaera elsdenii) 、 重水 作用下， 反应 12.0h， 以98%的产率得到(2R,3R)-[2,3-2H2]butanoyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  重新设计酰基辅酶A脱氢酶的活性位点：支持一碱基机制的新证据。

  摘要：

  酰基辅酶A脱氢酶是一族相关的酶，它们具有高度的结构同源性和共同的催化机制，其中涉及通过活性位点谷氨酸残基从底物中提取α-质子。几项研究表明，催化谷氨酸的位置在大多数这些脱氢酶（E2位点）中均是保守的，但在另外两个家族成员（E1位点）中却处于不同的位置。使用位点特异性体外诱变，已经构建了双突变大鼠短链酰基辅酶A脱氢酶（rSCAD），其中催化谷氨酸从E2移至E1位点（Glu368Gly / Gly247Glu）。该突变酶具有催化活性，但与底物酶相比，利用底物的效率较低（K（m）= 0.6和2.0 microM，Vmax = 2.8和0。天然和突变酶分别为3 s-1）。在这项研究中，我们表明野生型和突变型rSCAD都表现出相同的催化立体化学偏好-从底物上提取α-HR，然后将β-HR转移到FAD辅酶上。这些结果，加上天然和双重突变SCAD的分子模型，表明E1和E2位点的催化碱基在拓扑上相似且具有催

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(97)00159-4
• 作为产物：
  描述：

  [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-4-羟基-2-[[羟基-[羟基-[(3R)-3-羟基-2,2-二甲基-3-[2-[2-(2-甲基丙烷酰基硫基)乙基氨基甲酰]乙基氨基甲酰]丙氧基]磷酰]氧基-磷酰]氧基甲基]四氢呋喃-3-基]氧基膦酸 在 isobutyryl coenzyme A mutase fused 、 isobutyryl coenzyme A mutase 作用下， 生成 辅酶 A S-丁酸酯
  参考文献：
  名称：

  异戊酰-CoA 和新戊酰-CoA 的新型辅酶 B12 依赖性相互转化。

  摘要：

  5'-脱氧腺苷钴胺素 (AdoCbl) 依赖性异构酶使用自由基化学催化碳骨架重排。我们最近表征了一种融合蛋白，该蛋白包含 AdoCbl 依赖性异丁酰-CoA 变位酶的两个亚基，侧翼有一个 G 蛋白伴侣，并将其命名为异丁酰-CoA 变位酶融合 (IcmF)。IcmF 催化异丁酰辅酶 A 和正丁酰辅酶 A 的相互转化，而 GTP 酶活性与其 G 蛋白结构域相关。在这项研究中，我们报告了一种与 IcmF 相关的新活性，即异戊酰辅酶 A 和新戊酰辅酶 A 的相互转化。IcmF 的动力学表征产生以下值：异戊酰辅酶 A 的 K(m) 为 62 +/- 8 muM 和 V(max) 为 0.021 +/- 0.004 mumol min(-1) mg(-1) 在 37 度C。生化实验表明，其中碱基特异性环基序 NKXD 被修饰为 NKXE 的 IcmF 催化 GTP 和 ATP 的水解。IcmF 在转换过程中很容易快速失活，而

  DOI：

  10.1074/jbc.m111.320051

文献信息

• [EN] DNA-PK INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE LA PROTÉINE KINASE DÉPENDANTE DE L'ADN
  申请人：VERTEX PHARMA

  公开号：WO2019143678A1

  公开（公告）日：2019-07-25

  The present invention relates to compounds useful as inhibitors of DNA-PK. The invention also provides pharmaceutically acceptable compositions comprising said compounds and methods of using the compositions in the treatment of various diseases, conditions, or disorders.

  本发明涉及作为DNA-PK抑制剂有用的化合物。该发明还提供了包括所述化合物的药学上可接受的组合物，以及在治疗各种疾病、状况或障碍中使用这些组合物的方法。
• Characterization of Arylalkylamine <i>N</i>-Acyltransferase from <i>Tribolium castaneum</i>: An Investigation into a Potential Next-Generation Insecticide Target
  作者：Brian G. O’Flynn、Eric M. Lewandowski、Karin Claire Prins、Gabriela Suarez、Angelica N. McCaskey、Nasha M. Rios-Guzman、Ryan L. Anderson、Britney A. Shepherd、Ioannis Gelis、James W. Leahy、Yu Chen、David J. Merkler

  DOI：10.1021/acschembio.9b00973

  日期：2020.2.21

  short-chain acyl-CoAs (C2-C10), benzoyl-CoA, and succinyl-CoA functioning in the role of acyl donor. Recombinant TcAANAT0 was expressed and purified from E. coli and was used to investigate the kinetic and chemical mechanism of catalysis. The kinetic mechanism is an ordered sequential mechanism with the acyl-CoA binding first. pH-rate profiles and site-directed mutagenesis studies identified amino acids critical

  杀虫剂抗性问题日益严重，这意味着确定新的杀虫剂目标变得前所未有的重要。芳烷基胺 N-酰基转移酶 (AANATs) 已被建议作为潜在的新目标。这些混杂的酶参与生物胺的 N-酰化以形成 N-酰胺。在昆虫中，这个过程是黑色素、角质层硬化、生物胺去除和脂肪酸酰胺生物合成的关键步骤。表征的每个 AANAT 同种型的独特性质表明每个生物体都容纳了该生物体相对专有的离散 AANAT 组装。这意味着在杀虫剂设计中具有很高的选择性，同时也保持了多药性。此处介绍了对 AANAT 的全面动力学和结构分析，该分析在世界上所有植物商品中最常见的次生害虫之一 Tribolium castaneum 中发现。这种名为 TcAANAT0 的酶催化短链 N-酰基芳基烷基胺的形成，其中短链酰基辅酶 A (C2-C10)、苯甲酰辅酶 A 和琥珀酰辅酶 A 在酰基供体的作用下起作用。从大肠杆菌中表达和纯化重组 TcAANAT0，
• Repurposing the 3‐Isocyanobutanoic Acid Adenylation Enzyme SfaB for Versatile Amidation and Thioesterification
  作者：Mengyi Zhu、Lijuan Wang、Jing He

  DOI：10.1002/anie.202010042

  日期：2021.1.25

  molecules with novel skeletons, but also to identify the enzymes that catalyze diverse chemical reactions. Exploring the substrate promiscuity and catalytic mechanism of those biosynthetic enzymes facilitates the development of potential biocatalysts. SfaB is an acyl adenylate‐forming enzyme that adenylates a unique building block, 3‐isocyanobutanoic acid, in the biosynthetic pathway of the diisonitrile

  微生物天然产物的基因组挖掘使化学家不仅能够发现具有新颖骨架的生物活性分子，而且能够识别催化多种化学反应的酶。探索这些生物合成酶的底物混杂性和催化机理有助于开发潜在的生物催化剂。SfaB是一种形成酰基腺苷酸的酶，可在由硫链霉菌产生的二异腈自然产物SF2768的生物合成途径中，对独特的结构单元3-异氰基丁酸进行腺苷酸化。，并且该AMP连接酶被证明可以接受各种短链脂肪酸（SCFA）。在本文中，我们将SfaB重新用于催化那些SCFA与各种胺或硫醇亲核试剂之间的酰胺化或硫酯化反应，从而提供了另一种酶促方法来体外制备相应的酰胺和硫酯。
• [EN] QUINOXALINONE COMPOUNDS, COMPOSITIONS, METHODS, AND KITS FOR INCREASING GENOME EDITING EFFICIENCY<br/>[FR] COMPOSÉS DE QUINOXALINONE, COMPOSITIONS, PROCÉDÉS ET KITS POUR AUGMENTER L'EFFICACITÉ D'ÉDITION DU GÉNOME
  申请人：VERTEX PHARMA

  公开号：WO2019143677A1

  公开（公告）日：2019-07-25

  Compounds, methods of editing a target genomic region(s), methods of repairing of a DNA break via a HDR pathway, methods of inhibiting or suppressing repair of a DNA break via a NHEJ pathway, and methods of modifying expression of a gene(s) or protein(s) comprise administering to one or more cells that include one or more target genomic regions, a genome editing system and a DNA protein-kinase (DNA-PK) inhibitor disclosed herein. Kits and compositions for editing a target gene comprise a genome editing system and a DNA-PK inhibitor disclosed herein.

  化合物，编辑目标基因组区域的方法，通过HDR途径修复DNA断裂的方法，通过NHEJ途径抑制或抑制修复DNA断裂的方法，以及修改基因或蛋白表达的方法包括向包括一个或多个目标基因组区域的一个或多个细胞施用本文披露的基因组编辑系统和DNA蛋白激酶（DNA-PK）抑制剂。用于编辑目标基因的试剂盒和组合物包括本文披露的基因组编辑系统和DNA-PK抑制剂。
• [EN] DNA-PK INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS D'ADN-PK
  申请人：VERTEX PHARMA

  公开号：WO2019143675A1

  公开（公告）日：2019-07-25

  The present invention relates to compounds useful as inhibitors of DNA-PK. The invention also provides pharmaceutically acceptable compositions comprising said compounds and methods of using the compositions in the treatment of various diseases, conditions, or disorders.

  本发明涉及作为DNA-PK抑制剂有用的化合物。该发明还提供了包括所述化合物的药学上可接受的组合物，以及在治疗各种疾病、状况或障碍中使用这些组合物的方法。