[ψ[CH2NH]Tpg4]vancomycin aglycon

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [ψ[CH2NH]Tpg4]vancomycin aglycon
• 英文别名: (1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)-22-(2-amino-2-oxoethyl)-5,15-dichloro-2,18,32,35,37,48-hexahydroxy-19-[[(2R)-4-methyl-2-(methylamino)pentanoyl]amino]-20,23,42,44-tetraoxo-7,13-dioxa-21,24,27,41,43-pentazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta-3,5,8(48),9,11,14,16,29(45),30,32,34(39),35,37,46,49-pentadecaene-40-carboxylic acid
• 化学式: C₅₃H₅₄Cl₂N₈O₁₆
• 分子量: 1129.96
• InChiKey: IUNFJZBMWJGXFF-LPUVNLKGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  79
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  390
• 氢给体数：
  15
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [ψ[CH2NH]Tpg4]vancomycin aglycon 、 UDP-glucose 在 3,3,3-膦三基三丙酸 、 recombinant glycosyltranferase GtfE 、 magnesium chloride 作用下， 以 甘油 为溶剂， 反应 48.0h， 以66%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  [Ψ[C(=S)NH]Tpg4]万古霉素、[Ψ[C(=NH)NH]Tpg4]万古霉素、[Ψ[CH2NH]Tpg4]万古霉素及其（4-氯联苯）的全合成和初步评价甲基衍生物：糖肽抗生素的协同结合口袋和外周修饰

  摘要：

  公开了关于万古霉素结合口袋类似物的全合成研究的全部细节，该类似物带有外周 L-vancosaminyl-1,2-D-葡糖基二糖，其包含对残基 4 酰胺（残基 4 羰基）中的一个关键单原子的改变。 O → S、NH、H2) 旨在直接解决万古霉素耐药性的潜在分子基础。还公开了对合成上更易接近的 C 端羟甲基苷元衍生物进行后期转化的试验研究，以及为双 D-Ala-D-设计的所有结合口袋修饰的万古霉素类似物的外围氯联苯官能化的全部细节。 Ala/D-Ala-D-Lac 结合。他们的集体评估表明，结合口袋和氯联苯外周修饰类似物的组合表现出显着的抗菌活性谱（VSSA、MRSA 和 VanA 和 VanB VRE）以及对万古霉素敏感和万古霉素耐药细菌的显着效力（MIC = 0.06-0.005脒和亚甲基类似物分别为 0.5-0.06 μg/mL）并且可能受益于两种独立的协同作用机制，其中只有一种依赖于

  DOI：

  10.1021/jacs.5b01008
• 作为产物：
  描述：

  在 aluminum tri-bromide 、 乙硫醇 作用下， 反应 5.0h， 以80%的产率得到[ψ[CH2NH]Tpg4]vancomycin aglycon
  参考文献：
  名称：

  [Ψ[CH2NH]Tpg4]万古霉素苷元的全合成和评价：重新设计万古霉素的双-Ala-d-Ala 和 d-Ala-d-Lac 结合

  摘要：

  详细描述了[Psi[CH(2)NH]Tpg(4)]万古霉素苷元(5)的有效合成，其中万古霉素苷元的残基4酰胺羰基已被亚甲基取代。这种单原子的去除是为了增强与 D-Ala-D-Lac 的结合，对抗通过类似的单原子变化（酯 O 代表酰胺）重塑其 D-Ala-D-Ala 肽聚糖细胞壁前体的细菌所赋予的抗性。 NH）。该方法的关键要素包括合成改性万古霉素 ABCD 环系统，其特征是残基 4 和 5 的还原胺化偶联，用于安装深层酰胺修饰，这是用于形成改性 CD 环系统的两个二芳基醚闭合中的第一个（76%，2.5-3:1 动力学阻转二对映选择性），用于安装受阻 AB 联芳键 (90%) 的 Suzuki 偶联，阻转异构体的立体化学可以在其上进行热调节，以及 AB 环系统的大内酰胺化闭合 (70% ）。随后的DE环体系的引入引发了室温芳香亲核取代反应，形成剩余的二芳基醚（86%，6-7:1动力学阿托二对

  DOI：

  10.1021/ja0572912

文献信息

• [PSI[CH2NH]PG4] glycopeptide antibiotic analogs
  申请人：Boger L. Dale

  公开号：US20070173438A1

  公开（公告）日：2007-07-26

  [ψ[CH 2 NH]PG 4 ] glycopeptide antibiotic analogs are reengineered forms of glycopeptides that exhibit antimicrobial activity against both wild type and glycopeptide antibiotic resistant strains of microorganisms. For example, [ψ[CH 2 NH]Tpg 4 ] vancomycin aglycon is a reengineered form of vancomycin that exhibits antimicrobial activity (MIC=31 μg/mL) against both wild type and VanA resistant organism ( E. faecalis BM4166). The VanA resistant organism achieves its resistance, upon glycopeptide antibiotic challenge, by remodeling its D-Ala-D-Ala peptidoglycan cell wall precursor to D-Ala-D-Lac. [ψ[CH 2 NH]PG 4 ] glycopeptide antibiotic analogs have an altered glycopeptide backbone wherein the carbonyl of the fourth amino acid residue of the glycopeptide backbone has been replaced with a methylene. This alteration of the glycopeptide backbone imparts dual binding affinities for both D-Ala-D-Ala and D-Ala-D-Lac and dual antimicrobial activities for both wild type and resistant strains. For example, [ψ[CH 2 NH]Tpg 4 ]vancomycin aglycon displays a antimicrobial potency that reflects its altered binding characteristics.

  [ψ[CH2NH]PG4] 糖肽抗生素类似物是糖肽的重新设计形式，对野生型和糖肽抗生素耐药菌株都表现出抗微生物活性。例如，[ψ[CH2NH]TPG4] 万古霉素裸核是万古霉素的重新设计形式，对野生型和VanA耐药菌株（E. faecalisBM4166）都表现出抗微生物活性（MIC=31 μg/mL）。VanA耐药菌株通过重塑其D-Ala-D-Ala肽聚糖细胞壁前体为D-Ala-D-Lac，在糖肽抗生素挑战下获得其抗性。[ψ[CH2NH]PG4] 糖肽抗生素类似物具有改变的糖肽骨架，其中糖肽骨架的第四个氨基酸残基的羰基被亚甲基取代。这种糖肽骨架的改变赋予了对D-Ala-D-Ala和D-Ala-D-Lac的双重结合亲和力，以及对野生型和耐药菌株的双重抗微生物活性。例如，[ψ[CH2NH]TPG4] 万古霉素裸核显示出反映其改变的结合特性的抗微生物效力。