作者:Pratyush Kumar Das、Laura Puusepp、Finny S. Varghese、Age Utt、Tero Ahola、Dzmitry G. Kananovich、Margus Lopp、Andres Merits、Mati Karelson
DOI:10.1128/aac.01421-16
日期:2016.12
target for in silico drug design; however, there is thus far little evidence that the designed compounds indeed inhibit the protease activity of nsP2 and/or suppress CHIKV replication. In this study, a set of 12 compounds, predicted to interact with the active center of nsP2 protease, was designed using target-based modeling. The majority of these compounds were shown to inhibit the ability of nsP2 to process
基孔肯雅热病毒(CHIKV; Alphavirus属)是基孔肯雅热的病原体。某些广谱抗病毒化合物可抑制CHIKV复制。相反,关于化合物特异性抑制CHIKV复制蛋白的酶活性的信息很少。这些蛋白以来自CHIKV正链RNA基因组的非结构(ns)P1234多蛋白前体的形式翻译。复制酶的活性形式是利用nsP2的自蛋白水解活性产生的。nsP2蛋白酶的可用三维(3D)结构使其成为计算机药物设计的目标。然而,迄今几乎没有证据表明所设计的化合物确实抑制了nsP2的蛋白酶活性和/或抑制了CHIKV的复制。在这项研究中,一组12种化合物 使用基于靶标的模型设计了预测与nsP2蛋白酶活性中心相互作用的蛋白。这些化合物中的大多数显示出抑制nsP2处理重组蛋白和合成肽底物的能力。此外,在这些无细胞测定中发现有活性的所有化合物也抑制了细胞培养中的CHIKV复制,最有效的抑制剂的50%有效浓度(EC50)为〜1.5μM。