O-(cytidine-5'-O-phosphor-5'-P-yl) 7-aza-1-oxybenzotriazolide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: O-(cytidine-5'-O-phosphor-5'-P-yl) 7-aza-1-oxybenzotriazolide
• 英文别名: dCMP；[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl triazolo[4,5-b]pyridin-3-yl hydrogen phosphate
• 化学式: C₁₄H₁₆N₇O₈P
• 分子量: 441.297
• InChiKey: MMPJURCHQWOONW-UORFTKCHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  208
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 cytosine-5'-monophosphate 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 O-(cytidine-5'-O-phosphor-5'-P-yl) 7-aza-1-oxybenzotriazolide
  参考文献：
  名称：

  Accelerating chemical replication steps of RNA involving activated ribonucleotides and downstream-binding elements

  摘要：

  研究表明，用核糖核苷酸的氧氮苯并三唑类对 RNA 引物进行模板定向单核苷酸延伸是快速且具有序列选择性的；下游结合的 RNA 链有助于加速反应。

  DOI：

  10.1039/b510775j

文献信息

• Accelerating chemical replication steps of RNA involving activated ribonucleotides and downstream-binding elements
  作者：Stephanie R. Vogel、Christopher Deck、Clemens Richert

  DOI：10.1039/b510775j

  日期：——

  Template-directed single nucleotide extension of an RNA primer with oxyazabenzotriazolides of ribonucleotides is shown to be fast and sequence-selective; downstream-binding RNA strands contribute to the acceleration of the reaction.

  研究表明，用核糖核苷酸的氧氮苯并三唑类对 RNA 引物进行模板定向单核苷酸延伸是快速且具有序列选择性的；下游结合的 RNA 链有助于加速反应。